| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 1,653,950 | 0 | C | G | 7.9% | 770.8 / 38.2 | 239 | intergenic (‑238/+58) | oprB‑II/PP_1446 | carbohydrate‑selective porin/TonB‑dependent receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (120/99); new base G (13/6); total (134/105) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.37e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.50e-01 | |||||||||||
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |