| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,653,953 | T→A | 9.2% | intergenic (‑241/+55) | oprB‑II ← / ← PP_1446 | carbohydrate‑selective porin/TonB‑dependent receptor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,653,953 | 0 | T | A | 9.2% | 743.5 / 36.2 | 248 | intergenic (‑241/+55) | oprB‑II/PP_1446 | carbohydrate‑selective porin/TonB‑dependent receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (122/99); new base A (19/6); total (143/105) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.53e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
AAGCGTTTCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTGGCATAGCGCACGGTCTGGTCGG > NC_002947/1653804‑1654102 | aaGCGTTTCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCt < 2:5392067/150‑1 (MQ=255)aaGCGTTTCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCt > 1:8254636/1‑150 (MQ=255) tttCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGACTGCGCCGGTTGCCCTACCag > 1:5352583/1‑149 (MQ=255) tttCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCAt > 1:4376071/1‑150 (MQ=255) ttCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATc < 2:1521295/150‑1 (MQ=255) aGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTa > 1:4017237/1‑150 (MQ=255) tGCGGCGGTGAGTATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTcg < 2:5968347/150‑1 (MQ=255) cggcggGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTcgcg < 1:6153761/150‑1 (MQ=255) ggcggGGAGGATATCGGGGAAGTGATAAGAACAAAGACAACTTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATACGATGGTAGGGCAACCGGCGCATTCGCgg < 1:7973162/150‑1 (MQ=21) ggcggGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAATAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTAAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCgg < 2:1344585/150‑1 (MQ=255) ggcggGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCgg < 1:7708142/150‑1 (MQ=255) ggcggGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCgg < 2:1580898/150‑1 (MQ=255) ggcggGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCgg < 1:3312425/150‑1 (MQ=255) ggcggGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAACGGGTTCACCCGCGAATACGATGGTAGGGCAACCGGCGCATTCGCgg < 2:655272/150‑1 (MQ=25) gcggGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGAGTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAACGGGTTCACCCGCGAATACGATGGTAGGGCAACCGGCGCATTCGCggg < 2:2918312/150‑1 (MQ=21) ggggAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTg > 1:4325176/1‑150 (MQ=255) gggAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑a > 2:8551776/1‑150 (MQ=255) gggAGGATAGAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑a < 1:2959902/150‑1 (MQ=255) tataGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCGACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGtt > 2:3032260/1‑150 (MQ=255) ataGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTc < 1:6371372/150‑1 (MQ=255) taGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTcc < 1:6728014/150‑1 (MQ=255) ggggAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTa > 2:206128/1‑150 (MQ=255) gggAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCCCGAAAGCGCCGCTTGACCTACCAACGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTac > 1:5075038/1‑150 (MQ=255) ggAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTAGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATAAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTGACCCGCCAATGAGACCGTGGCCCGACCAAAGTATTAGCGTGTG‑AAACCCtacataca > 1:2323690/1‑150 (MQ=255) gTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGa > 2:5666299/1‑150 (MQ=255) aacaaaaaaGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTtc < 1:3506790/147‑1 (MQ=255) gAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTtcgt < 2:181860/150‑1 (MQ=255) aaaaaaGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTtcgtc > 1:7167310/1‑150 (MQ=255) aaaaGACAAATTGTCGCAGAGTATTGTTGTTGAACGGGAAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCTTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGc < 2:713797/150‑1 (MQ=255) aaaaGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGc < 1:8812246/150‑1 (MQ=255) aaaGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCt > 2:1919117/1‑150 (MQ=255) aCAAATTGGCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACTGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTTTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCACTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGTTCTTCGTCGCTtgtg < 1:582986/150‑1 (MQ=39) aaaTTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGt > 2:614253/1‑150 (MQ=255) acttGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGtt < 1:6667702/148‑1 (MQ=255) gCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCAACGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAgg > 1:1985392/1‑150 (MQ=255) cAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTGACCCGCGAATGGGCCGGTTGGCCTACCATCGTATTAGCGGGTG‑AAACCGTTGCTACAACGATCTTCGTGGCTTGTGGTTGAGAAggt > 1:8321222/1‑150 (MQ=255) agagGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAggtg < 2:3340881/150‑1 (MQ=255) agagGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAggtg < 1:1549775/150‑1 (MQ=255) agagGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAggtg < 2:5116759/150‑1 (MQ=255) gagGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAggtgg < 1:5219592/150‑1 (MQ=255) agcaTTGTTCTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAAACGAGGCAGGTGTAGGAGCGGTTTCACCCGCGAAAGAGCCCGTTGCCCTACCATCGAATACGCCGGTG‑AACCAGATCATACACCGAAATACGTCGCTTGTGGATCAGAAggagta > 2:3401008/4‑146 (MQ=255) gATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTAc > 2:4769686/1‑150 (MQ=255) gttgttgAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCaa < 2:4400874/150‑1 (MQ=255) ttgttgAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAAc > 2:78046/1‑150 (MQ=255) tgttgAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAAcc < 1:6555661/150‑1 (MQ=255) gttgAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAAccc < 2:6921338/150‑1 (MQ=255) gAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGAc > 2:6729065/1‑150 (MQ=255) aaCGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCAACCCCGAAAGCGCCGGGTGCCCTACCAAAGTATTCGCGGGTG‑AAACCGTTCCTAAACCGATCATCGTCGCATGTTGTTGAGAATGTGGTAAGCAccccccct > 1:6896007/1‑146 (MQ=255) aaCGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTAACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACt > 1:2155106/1‑150 (MQ=255) aaCGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGGTAACCCCCGAAAGCGCCCGTTGCCCGACCAACGGAATCGCGGGTGTAACCCG‑TCCTACACCCCAAGTCGTCGCGGGTGGTTGAGAAGGTGGTTAGCAAaccccca > 1:1502386/1‑146 (MQ=255) aCGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACtt < 1:4880920/150‑1 (MQ=255) gggCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACGTcc > 2:8253888/1‑150 (MQ=255) gCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCAc > 2:2723500/1‑150 (MQ=255) cAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTa < 1:2734012/150‑1 (MQ=255) gtcATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGccc < 1:2362329/150‑1 (MQ=255) tcATTACTCGCCGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGcccc < 1:4593472/150‑1 (MQ=255) tcATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGcccc < 2:5555079/150‑1 (MQ=255) tcATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGcccc > 2:8706153/1‑150 (MQ=255) cATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCg < 2:7946792/150‑1 (MQ=255) aTTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGCATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCgg > 2:4085387/1‑150 (MQ=255) aaTCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGGTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCGACGCCCCGgcgc > 2:3857413/1‑150 (MQ=255) aTCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGcc > 2:4257446/1‑150 (MQ=255) gatcggTGTAGGAACGGGTTCACCCGCGAATACGATGGTAGGGCAACCGGCGCATTCGCGGGTG‑AACCCGCTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGc > 2:2472288/5‑150 (MQ=17) aGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGat > 2:829781/1‑150 (MQ=255) tgtAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATc > 2:3994586/1‑150 (MQ=255) tAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATcgc > 2:6816893/1‑150 (MQ=255) ggAACGGGTTCACCCGCGAATACGATGGTAGGGCAACCGGCGCATTCGCGGGTG‑AACCCGCTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCgcgc > 1:1080013/1‑150 (MQ=18) gaacGGGTTCACCCGCGAATACGATGGTAGGGCAACCGGCGCATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCa > 2:5118065/4‑150 (MQ=21) gAGCGGGTTCACCCGCGCATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCa < 1:32580/150‑1 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCa > 2:2652730/1‑150 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCa < 2:5889223/150‑1 (MQ=255) gAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCa < 1:3704755/150‑1 (MQ=255) gggTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGAt < 1:1298272/150‑1 (MQ=255) ggTTCACCCGCGACTGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATc < 1:1410574/150‑1 (MQ=255) ggTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTTGTACGCCACCCGACTTCCAAGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATc < 2:2323690/150‑1 (MQ=255) ttCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGa > 1:8465548/1‑150 (MQ=255) cACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAAc > 1:4492685/1‑150 (MQ=255) aCCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACt > 2:3742616/1‑150 (MQ=255) aCCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACt < 2:6648313/150‑1 (MQ=255) cccGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTg > 1:4817863/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTgg > 1:3084507/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTgg > 1:3865504/1‑150 (MQ=255) ccGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTgg < 1:4345156/150‑1 (MQ=255) ccGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTgg > 1:4955204/1‑150 (MQ=255) cgcgAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTGGc > 1:7879019/1‑150 (MQ=255) gAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTGGCATa < 2:7999069/150‑1 (MQ=255) gAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTGGCATa < 2:6233482/150‑1 (MQ=255) tGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTCCGCTACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGCTCGAACTGGCATcgcg > 2:8816888/1‑150 (MQ=255) gcgcCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTGGCATAgcgc > 1:2873977/1‑150 (MQ=255) cgcCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTGGCATAGCGCa < 2:6719898/150‑1 (MQ=255) gcCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTGGCATAGCGCat > 1:1434480/1‑149 (MQ=255) cGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTGGCATAGCGCACgg > 1:6480034/1‑150 (MQ=255) cccTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTGGCATAGCGCACGGTCTggt < 1:8551776/150‑1 (MQ=255) cccTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTGGCATAGCGCACGGTCTggt < 2:1320348/150‑1 (MQ=255) ccTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTGGCATAGCGCACGGTCTggtc > 1:5186738/1‑150 (MQ=255) ccTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTGGCATAGCGCACGGTCTggtc > 2:6359123/1‑150 (MQ=255) ccTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTGGCATAGCGCACGGTCTggtc > 2:3080699/1‑150 (MQ=255) cTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTGGCATAGCGCACGGTCTggtcg > 1:5548269/1‑150 (MQ=255) cTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGGTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCCCGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCCGGATCGAACTGGCATAGCGCACGGTCTggtcg > 2:3304969/1‑150 (MQ=255) tACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTGGCATAGCGCACGGTCTggtcgg > 1:2236722/1‑150 (MQ=255) | AAGCGTTTCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTG‑AACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTGGCATAGCGCACGGTCTGGTCGG > NC_002947/1653804‑1654102 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |