Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 1,653,957 | 0 | A | G | 6.3% | 805.1 / 26.7 | 256 | intergenic (‑245/+51) | oprB‑II/PP_1446 | carbohydrate‑selective porin/TonB‑dependent receptor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (135/103); new base G (10/6); total (147/109) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.96e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.97e-01 |
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
TTTCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTGGCATAGCGCACGGTCTGGTCGGTCAG > NC_002947/1653809‑1654106 | tttCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGACTGCGCCGGTTGCCCTACCag > 1:5352583/1‑149 (MQ=255) tttCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCAt > 1:4376071/1‑150 (MQ=255) tttCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCCCGAATGCGCCCGTGGCCCAACCag > 1:8172833/1‑149 (MQ=255) 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cATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTGGCATAGCGCACGGTCTGGTCGGTCa < 1:1489944/150‑1 (MQ=255) aTCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTGGCATAGCGCACGGTCTGGTCGGTCAg < 1:3075123/150‑1 (MQ=255) | TTTCAGCTTGCGGCGGGGAGGATATAGGGGAAGTTATAAGAAAAAAGACAAATTGTCGCAGAGGATTGTTGTTGAACGGGCAACAGTCGTCATTAATCGAGGCAGGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGCCGGTTGCCCTACCATCGTATTCGCGGGTGAACCCGTTCCTACACCGATCTTCGTCGCTTGTGGTTCAGAAGGTGGTACGCAACCCGACTTCCACGCTACGCCCCGGCGCCGGTGCGATATCGCGCAGGATCGAACTGGCATAGCGCACGGTCTGGTCGGTCAG > NC_002947/1653809‑1654106 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |