| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,695,404 | T→C | 5.4% | T140A (ACG→GCG) ‡ | ydcS ← | polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,695,404 | 0 | T | C | 5.4% | 953.8 / 25.8 | 293 | T140A (ACG→GCG) ‡ | ydcS | polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (144/133); new base C (5/11); total (149/144) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.36e-01 | |||||||||||
Only 100 of 296 total aligned reads displayed.
GATCGGCCCGTCATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCCGAGGCGGTGACCA > NC_002947/1695255‑1695553 | aTCGGCCCGTCATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTg > 2:577586/1‑150 (MQ=255) aTCGGCCCGTCATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTg < 2:2159251/150‑1 (MQ=255) cGGCCCGTCATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGcc < 2:6603461/150‑1 (MQ=255) ggCCCGTCATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCg > 2:6426887/1‑150 (MQ=255) ccGTCATAGGCTTGCACGCGGCCCGTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTCTCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTac > 2:545978/1‑150 (MQ=255) gTCATAGGCGTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCGTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCACGCCGTacca < 2:4569431/150‑3 (MQ=255) tCATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACAcc > 1:233279/1‑150 (MQ=255) cATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCt > 2:8638581/1‑150 (MQ=255) cATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCt < 1:3684942/150‑1 (MQ=255) cATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCACGCCGTaccagt < 2:3750483/150‑5 (MQ=255) cATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCACGCCGTaccagt < 2:2501878/150‑5 (MQ=255) tAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGc < 2:1493256/150‑1 (MQ=255) tAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGc < 2:8221438/150‑1 (MQ=255) ttGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTc < 1:2388491/150‑1 (MQ=255) ttGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTc > 1:4228455/1‑150 (MQ=255) tGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCg < 1:5862062/150‑1 (MQ=255) aCGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGAcc > 1:378117/1‑150 (MQ=255) cgcgGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACca < 2:2315037/150‑1 (MQ=255) gCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATa > 1:1359588/1‑150 (MQ=255) cccTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATAc < 2:7085976/150‑1 (MQ=255) cccTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATAc > 1:5437209/1‑150 (MQ=255) ccTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATAcc > 1:3313437/1‑150 (MQ=255) ccTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATAcc > 1:5773361/1‑150 (MQ=255) tttGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCAGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTa > 1:4630198/1‑150 (MQ=255) gCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGt > 2:1276636/1‑150 (MQ=255) cTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGtt < 2:6795137/150‑1 (MQ=255) ttGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTc < 1:7372140/150‑1 (MQ=255) tGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCt < 2:6843702/150‑1 (MQ=255) gCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTg > 1:8287640/1‑150 (MQ=255) gCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTg > 1:6838173/1‑150 (MQ=255) cGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCa > 1:7641844/1‑150 (MQ=255) cGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCa > 1:8761335/1‑150 (MQ=255) cGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCa > 1:1808402/1‑150 (MQ=255) gTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAg < 2:8301045/150‑1 (MQ=255) gggCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGgcg > 2:1191076/1‑150 (MQ=255) ggCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGgcgc < 1:251711/150‑1 (MQ=255) ggCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGgcgc < 2:805432/150‑1 (MQ=255) ggCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGAGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGgcgc < 2:4547805/150‑1 (MQ=255) gCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGcgcg > 1:405583/1‑150 (MQ=255) cAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCgg < 2:5159461/150‑1 (MQ=255) cAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCgg < 2:1752941/150‑1 (MQ=255) ggTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGt < 1:475712/150‑1 (MQ=255) gTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTc > 1:8095871/1‑150 (MQ=255) gTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTc > 2:3468443/1‑150 (MQ=255) cTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGAt < 1:5911418/150‑1 (MQ=255) tGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATg > 2:7835841/1‑150 (MQ=255) ggCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGctc < 1:3450202/150‑1 (MQ=255) ggCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGctc < 2:2794184/150‑1 (MQ=255) tCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTc < 2:4876135/150‑1 (MQ=255) ccacGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTgg < 1:2393102/150‑1 (MQ=255) ccacGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTgg < 2:2015361/150‑1 (MQ=255) ccacGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTgg < 1:5270682/150‑1 (MQ=255) cacGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTggg > 2:882189/1‑150 (MQ=255) cAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAgg > 2:2971382/1‑150 (MQ=255) aGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAggg < 1:2755349/150‑1 (MQ=255) tggtggGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAg < 1:8100628/150‑1 (MQ=255) tggtggGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAg < 1:6120777/150‑1 (MQ=255) ggtggGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTTGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAgt < 1:389580/150‑1 (MQ=255) ggtggGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAgt < 2:4101186/150‑1 (MQ=255) tggGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAgtgt < 1:8679682/150‑1 (MQ=255) tggGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAgtgt < 1:5501020/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGa < 2:6182699/150‑1 (MQ=255) cgcCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGAt < 1:208365/150‑1 (MQ=255) gcCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATc > 1:6586213/1‑150 (MQ=255) gcCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGGTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGCTCAGGGCAGTGTTGATc > 1:3419971/1‑150 (MQ=255) cTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCgg > 1:8173105/1‑150 (MQ=255) tGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGc < 2:4655108/150‑1 (MQ=255) gCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCt < 2:3934515/150‑1 (MQ=255) cTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTg > 2:4271119/1‑150 (MQ=255) gAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTAc < 1:50518/150‑1 (MQ=255) aGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTAcgc > 2:2627432/1‑150 (MQ=255) aGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTAcgc > 1:6960412/1‑150 (MQ=255) ggTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTAcgcg > 2:7570043/1‑150 (MQ=255) gTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACgcgc > 1:2718995/1‑150 (MQ=255) gTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACgcgc > 1:4373752/1‑150 (MQ=255) ggTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGcc < 2:7442274/150‑1 (MQ=255) tgttgtACAGCAGCACGTTTGGCCCCCTCTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTg < 1:2004833/150‑1 (MQ=255) ttgtACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCa < 2:4053780/150‑1 (MQ=255) tgtACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCaa < 1:7607135/150‑1 (MQ=255) cagcaCGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTg < 2:3195056/118‑1 (MQ=255) cagcaCGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTg > 1:3195056/1‑118 (MQ=255) aCGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGc < 2:5908196/150‑1 (MQ=255) ttGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATg > 1:7161277/1‑150 (MQ=255) tGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGc < 2:7230415/150‑1 (MQ=255) gCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCAt > 1:1414457/1‑150 (MQ=255) ccccACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCg > 1:1306906/1‑150 (MQ=255) cccACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGc > 1:4980061/1‑150 (MQ=255) ccACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGcc > 1:7497551/1‑150 (MQ=255) aggtgTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGAt > 1:4003245/5‑140 (MQ=255) aggtgTACGGCACGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCCg > 2:8345779/5‑150 (MQ=255) aCTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCCg > 1:2243138/1‑150 (MQ=255) aCTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCCg > 2:4494273/1‑150 (MQ=255) gtgTACGGCACGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCCGAg > 1:554201/3‑150 (MQ=255) gTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCCGAGGc > 1:6729171/1‑150 (MQ=255) tACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCCGAGGCg < 1:4909062/150‑1 (MQ=255) tACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACAAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCTGTTGGGTTTCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCACGAGGCg > 2:3601656/1‑150 (MQ=255) aCGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCCGAGGCgg > 1:6412980/1‑150 (MQ=255) cGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCCGAGGCGGt > 1:1945209/1‑150 (MQ=255) cGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCCGAGGCGGt < 1:1618825/150‑1 (MQ=255) gTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCCGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCCGAGGCGGTGAcc > 1:113241/1‑150 (MQ=255) | GATCGGCCCGTCATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCCGAGGCGGTGACCA > NC_002947/1695255‑1695553 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |