Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,700,014 | G→A | 5.9% | R330Q (CGG→CAG) | wspC → | biofilm formation methyltransferase WspC |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,700,014 | 0 | G | A | 5.9% | 1544.5 / 51.6 | 486 | R330Q (CGG→CAG) | wspC | biofilm formation methyltransferase WspC |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (202/255); new base A (15/14); total (217/269) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.47e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 489 total aligned reads displayed.
TGCGTTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCACTATCGC > NC_002947/1699865‑1700162 | tgcgtTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCg < 1:2070393/150‑1 (MQ=255) cgtTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGTCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGc < 2:3827647/150‑1 (MQ=255) gtTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCt < 1:7325967/150‑1 (MQ=255) gtTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCt > 1:5213470/1‑150 (MQ=255) gtTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCt > 2:5446327/1‑150 (MQ=255) gtTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCt < 2:1852916/150‑1 (MQ=255) gtTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCATTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCt < 2:5741331/150‑1 (MQ=255) gtCACGACGGTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTg < 2:6358246/149‑1 (MQ=255) cACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGc < 2:4062851/150‑1 (MQ=255) acgTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAAt < 2:3146793/150‑1 (MQ=255) gTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGc < 2:7681680/150‑1 (MQ=255) gTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAAAGc > 1:1744355/1‑150 (MQ=255) gTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGACCGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGc < 2:1583838/150‑1 (MQ=255) ttGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGcc < 1:5972669/150‑1 (MQ=255) tGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCg < 1:7967525/150‑1 (MQ=255) tGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCg < 2:418389/150‑1 (MQ=255) tGCCCGCACCGGTTTATCCACAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCg < 2:6183825/150‑1 (MQ=255) tGCCCGCACCGGTTTATCCACAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCg < 2:5965549/150‑1 (MQ=255) cccGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGACCGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCggc < 1:8168136/150‑2 (MQ=255) cccGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGACCGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCggc < 2:220615/150‑2 (MQ=255) ccGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTg > 1:3743695/1‑150 (MQ=255) ccGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTg > 1:1247061/1‑150 (MQ=255) cACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCa < 1:7874692/150‑1 (MQ=255) ggTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGGTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGa < 2:8424593/150‑1 (MQ=255) tttATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGc < 1:8441581/150‑1 (MQ=255) ttATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCGGCGAgac < 2:2065482/150‑3 (MQ=255) ttATCCGCAGCCCAGTGCGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGCGCa < 2:4935317/150‑1 (MQ=255) tATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAg < 1:5499905/150‑1 (MQ=255) aTCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAgg < 1:1918929/150‑1 (MQ=255) cGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGccc < 1:1374235/150‑1 (MQ=255) cGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGccc > 1:516493/1‑150 (MQ=255) gCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCg > 2:28276/1‑150 (MQ=255) gCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCg > 2:7429774/1‑150 (MQ=255) aGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTa < 1:570940/150‑1 (MQ=255) gCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAg > 2:2549788/1‑150 (MQ=255) cccAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGc > 1:8794496/1‑150 (MQ=255) cccAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGc > 1:1656724/1‑150 (MQ=255) ccAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCg > 2:4792351/1‑150 (MQ=255) cAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGa < 2:7833918/150‑1 (MQ=255) aGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGaa < 1:4011399/150‑1 (MQ=255) gtgtGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAAt < 2:5206221/150‑1 (MQ=255) gtgtGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAAt > 1:4191964/1‑150 (MQ=255) ccTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTAc < 2:883675/150‑1 (MQ=255) cTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTAcc > 2:8026308/1‑150 (MQ=255) tCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCt > 1:3365611/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGATTGCCAACGCTACCTGAg < 1:717268/150‑1 (MQ=255) tCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGc < 2:8679589/150‑1 (MQ=255) tCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGc < 1:3515899/150‑1 (MQ=255) tCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGc < 2:4497314/150‑1 (MQ=255) gcggcgTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCa < 2:6565498/150‑1 (MQ=255) gcggcgTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCa < 1:8363069/150‑1 (MQ=255) gcgTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTa < 2:7060240/150‑1 (MQ=255) tgtgCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTAccc > 2:2914541/1‑150 (MQ=255) 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gccagCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGtacta > 1:752089/1‑150 (MQ=255) gcgcGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActgg < 1:2279281/150‑1 (MQ=255) gcgcGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActgg > 2:3584002/1‑150 (MQ=255) gAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActggctgg < 2:5397941/150‑1 (MQ=255) gCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGt > 2:8558683/1‑150 (MQ=255) 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acaGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTg > 1:1079100/1‑150 (MQ=255) gCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATa < 2:6281760/150‑1 (MQ=255) ccACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATAc < 2:1247061/150‑1 (MQ=255) gAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGaa < 1:3193951/150‑1 (MQ=255) gggggCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCCGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAgg < 1:6209585/150‑1 (MQ=255) cAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATgc > 2:4372762/1‑150 (MQ=255) cAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATgc > 1:6078767/1‑150 (MQ=255) gCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATgcgc > 2:5681832/1‑150 (MQ=255) ttGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGcagcag > 2:2430622/1‑150 (MQ=255) tggcaccGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCGGCGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGgc > 2:303562/6‑150 (MQ=255) gCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGgc > 2:5098761/1‑150 (MQ=255) gCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGgc > 1:3909542/1‑150 (MQ=255) gCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGGCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTg > 1:2624416/1‑150 (MQ=255) gCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTg > 2:7136569/1‑150 (MQ=255) ccGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCGGCGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGa < 1:303562/150‑1 (MQ=255) ccGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGa < 2:6774360/150‑1 (MQ=255) ccGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGa < 1:5445915/150‑1 (MQ=255) cGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAg > 1:6885307/1‑150 (MQ=255) cGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAg > 1:4590957/1‑150 (MQ=255) cGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCAAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAg > 1:6471379/1‑150 (MQ=255) 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ccGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCACTATCg > 1:4379590/1‑150 (MQ=255) ccGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCACTATCg > 2:1391237/1‑150 (MQ=255) | TGCGTTCACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCACTATCGC > NC_002947/1699865‑1700162 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |