| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,700,020 | C→G | 6.2% | A332G (GCC→GGC) | wspC → | biofilm formation methyltransferase WspC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,700,020 | 0 | C | G | 6.2% | 1578.0 / 65.9 | 468 | A332G (GCC→GGC) | wspC | biofilm formation methyltransferase WspC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (197/242); new base G (15/14); total (212/256) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.78e-01 | |||||||||||
Only 100 of 475 total aligned reads displayed.
CACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCACTATCGCAAGGCCC > NC_002947/1699871‑1700169 | cgacgTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCa < 1:5186911/150‑1 (MQ=255) gacgTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCaa > 1:6177909/1‑150 (MQ=255) gacgTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGGTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCaa < 2:7813177/150‑1 (MQ=255) acgTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAAt < 2:3061325/150‑1 (MQ=255) gTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGc < 2:7681680/150‑1 (MQ=255) gTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGA‑‑CCGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGc < 2:1583838/150‑1 (MQ=255) ttGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGcc < 1:6325642/150‑1 (MQ=255) tGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCg < 1:8493241/150‑1 (MQ=255) ccGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTg > 1:1247061/1‑150 (MQ=255) ccGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTg > 2:3173623/1‑150 (MQ=255) ccGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTg > 2:3961060/1‑150 (MQ=255) ggTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGa < 2:5937797/150‑1 (MQ=255) ggTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGGTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGa < 2:8424593/150‑1 (MQ=255) ggTATATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGa < 1:1573173/150‑1 (MQ=255) gTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTCGCTGGCACCGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCggccagcaa > 1:2274849/1‑142 (MQ=37) ttATCCGCAGCCCAGTGCGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGCGCa < 2:4935317/150‑1 (MQ=255) cGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGccc > 2:2499984/1‑150 (MQ=255) gCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCg > 2:28699/1‑150 (MQ=255) gCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCg > 1:603107/1‑150 (MQ=255) gCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCg > 2:7429774/1‑150 (MQ=255) cccAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGc > 2:5728674/1‑150 (MQ=255) cccAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGc > 1:1656724/1‑150 (MQ=255) ccaaGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGc > 1:3640972/4‑150 (MQ=255) cAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGa > 2:2000649/1‑150 (MQ=255) aGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGaa < 1:1844270/150‑1 (MQ=255) tgtgCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATg > 2:419439/1‑150 (MQ=255) gtgCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGc < 2:4810630/150‑1 (MQ=255) gCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCa < 2:6444260/150‑1 (MQ=255) ccGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCaa < 2:6590416/150‑1 (MQ=255) ccGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCaa < 1:8304351/150‑1 (MQ=255) gTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACg > 1:4469148/1‑150 (MQ=255) ccTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTAc < 2:883675/150‑1 (MQ=255) cTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTAcc > 2:1414962/1‑150 (MQ=255) cTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTAcc > 2:8026308/1‑150 (MQ=255) cTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTAcc > 1:2002212/1‑150 (MQ=255) tCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCt > 1:2861783/1‑150 (MQ=255) tCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCt > 1:868339/1‑150 (MQ=255) tCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCt > 2:5637315/1‑150 (MQ=255) tCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCt > 2:412697/1‑150 (MQ=255) tCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCt < 1:3147714/150‑1 (MQ=255) tCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCt > 1:8383972/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGc < 2:8679589/150‑1 (MQ=255) tCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGc < 1:7876078/150‑1 (MQ=255) gcggcgTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTTCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCa < 2:126628/150‑1 (MQ=255) gcggcgTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCa < 1:5672383/150‑1 (MQ=255) cggcgTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAg > 2:5515360/1‑150 (MQ=255) cgTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTAc < 1:504661/150‑1 (MQ=255) cgTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATCCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGACAGCCAACGCTACCTGAGCCAGTAc > 1:4943237/1‑150 (MQ=255) tgctgcCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACccgc > 1:5340769/1‑150 (MQ=255) ggTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCCCGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGc < 2:7091244/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGcac > 1:2211042/1‑150 (MQ=255) gcggcCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTCCCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAg > 1:2504580/1‑150 (MQ=255) gcggcCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAg > 2:5126921/1‑150 (MQ=255) ggccaggccaGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGgt > 1:5495806/1‑150 (MQ=255) ggccaggccaGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGgt > 1:6779910/1‑150 (MQ=255) gccaggccagCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGgtg > 1:4594294/1‑150 (MQ=255) gccaggccagCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGgtg > 1:7299426/1‑150 (MQ=255) gccaggccagCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGgtg > 2:8221028/1‑150 (MQ=255) ccaggccagCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGgtgt < 2:1802643/150‑1 (MQ=255) caggccagCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGta < 2:6789920/150‑1 (MQ=255) cagcccagCGCCAGCCCGCCAGCACAGCCCCGAGGGGGCCAGCGAGTTGCCGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTCGCCTATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCAACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGta < 2:8520284/150‑1 (MQ=255) aggccagCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGtac < 2:1037450/150‑1 (MQ=255) aggccagCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGtac > 2:6105209/1‑150 (MQ=255) gcgcGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActgg > 2:3584002/1‑150 (MQ=255) gcgAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTActggct < 1:1719620/150‑1 (MQ=255) ccGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGttt < 1:7514435/150‑1 (MQ=255) ccGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGttt > 2:6281991/1‑150 (MQ=255) gcgAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGc < 2:5426508/150‑1 (MQ=255) aGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCa < 1:2740176/150‑1 (MQ=255) gCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAg < 1:965294/150‑1 (MQ=255) gCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAg < 1:4369346/150‑1 (MQ=255) cacaGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGt < 1:4086575/150‑1 (MQ=255) acaGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTg > 1:1079100/1‑150 (MQ=255) aGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGAt > 2:4651524/1‑150 (MQ=255) aGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGAt > 2:2137670/1‑150 (MQ=255) gCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATa < 2:2393425/150‑1 (MQ=255) aCGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCg > 1:5891982/1‑150 (MQ=255) gAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGaa < 1:7686427/150‑1 (MQ=255) gAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGaa < 1:4804415/150‑1 (MQ=255) gAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGaa < 1:4008007/150‑1 (MQ=255) gAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGaa > 2:1197805/1‑150 (MQ=255) gggggCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAgg < 2:2976812/150‑1 (MQ=255) gggggCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCCGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAgg < 1:4164253/150‑1 (MQ=255) gggCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCg < 2:4373449/150‑1 (MQ=255) ggCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGa < 2:5232404/150‑1 (MQ=255) cAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATgc > 1:3325002/1‑150 (MQ=255) cAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATgc > 1:8058440/1‑150 (MQ=255) cAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATgc > 1:3012305/1‑150 (MQ=255) aGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCgcagc < 1:3736652/150‑1 (MQ=255) gCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGgc > 2:6214122/1‑150 (MQ=255) gCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTGTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGgc > 1:3866998/1‑150 (MQ=255) tggcaccGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCG‑‑GCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGgcgc > 1:7089161/6‑150 (MQ=38) tggcaccGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCG‑‑GCCAGCAAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGgcgc > 1:1300548/6‑150 (MQ=38) tGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGgcgc > 2:2655173/1‑150 (MQ=255) g‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGGCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTg > 1:2624416/1‑150 (MQ=255) g‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTg > 2:7136569/1‑150 (MQ=255) ccGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGa < 1:6603293/150‑1 (MQ=255) cccGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCACTATc > 2:7346562/1‑150 (MQ=255) ccGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCACTATCg > 2:5372816/1‑150 (MQ=255) gCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCACTATCGCAAGGcc < 1:3411313/150‑1 (MQ=255) | CACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGGCCAGCGCGAGCCCGCGAGCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGG‑‑CCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCACTATCGCAAGGCCC > NC_002947/1699871‑1700169 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |