| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 1,958,400 | T→C | 6.2% | T45A (ACC→GCC) ‡ | mnmC ← | methyltransferase/FAD‑dependent oxidoreductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 1,958,400 | 0 | T | C | 6.2% | 1177.4 / 41.0 | 370 | T45A (ACC→GCC) ‡ | mnmC | methyltransferase/FAD‑dependent oxidoreductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (165/182); new base C (11/12); total (176/194) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 | |||||||||||
Only 100 of 374 total aligned reads displayed.
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GCTGACGAAGTGCAGGCGCGCGTCGCTGTGTGCGTGCTGGTCGAACAGCTGCCAGGCGCAGAAAAAATTCATGCCGGTGCCAAAACCGGTTTCGCCGATCACCGTGCAGGCGTGCGGCGCCAGGTTGGCAAAACGCTCGGCCAGGCGGGTCTGGCCGAGGAACACGTGCTTGGTTTCTTCGATGCCTTCGTTGACTGCGAAATAGACGTCGTCATAGTGCCGCGAATGGGGGCGGCCCTGGTCGTCCCAGTCGATCTGGGCGTGCTGGAGGAGGGTGGGCATGGTGGGCTCGGTTGCAG > NC_002947/1958251‑1958549 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |