| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 1,975,707 | 0 | C | T | 6.4% | 1163.0 / 40.4 | 371 | intergenic (+9/‑257) | mtnA/PP_mr25 | methylthioribose‑1‑phosphate isomerase/gyrA regulatory region |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (170/177); new base T (15/9); total (185/186) | |||||||||||
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Only 100 of 376 total aligned reads displayed.
GCCGGGTGTCGAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTGAGACCAAC > NC_002947/1975557‑1975856 | ccGGGTGTCGAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATc < 2:4280941/150‑1 (MQ=255) ccGGGTGTCGAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATc < 2:7505266/150‑1 (MQ=255) gggTGTCGAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGc < 1:1311152/150‑1 (MQ=255) 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tCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCGTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCCGTGCAgg > 1:4263176/1‑150 (MQ=255) aGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCa > 2:2778385/1‑150 (MQ=255) tttGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACaa > 2:7950669/1‑150 (MQ=255) ccGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTAGCGGGCGTTGCCGCGCCCACGGGGCTATCGCAAGGGCGTAGGGGCGTGGTGTACCGGTGGGGGCGGGCGGGCCCCCGGACAGGCCGGTGCAGGCAAGACAAAAAc > 1:3170721/1‑150 (MQ=255) cGCAAGCGCCTGCACTGTTTTTGTATTGCCTGCACCGGCCTCTTCGCGGGCTcgcccgcccccaccggttcaccacggccctaaggccatgcgatatcccagtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccggtgaggcgatacaaaatca < 2:7668109‑M1/150‑99 (MQ=255) gCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGCCCCCGGGGATATCGCATGGCCGTAGGGCCGGGGGGAACCTGTGGGGGCGGGCGGGCCCGCGGAGAGGCCGGTGCCGGCCAGACAAAAAACa > 1:3406644/1‑150 (MQ=255) cacgcgcCTGAACTTATTTGGTAGCCCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCACCCACTGGTTTACCGCATGGCCTTCGGGCCGTGTTGAACCTGGGGGGGCGGGCGCGCCCGCCAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAg < 2:4003812/147‑1 (MQ=255) cAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAg > 2:4171147/1‑150 (MQ=255) aGCGCCTGCACTGATTTTGTAGCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCAGGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGt < 2:8194758/150‑1 (MQ=255) cTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGGGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCACTACAAAAACCAGGCTTCaa > 2:8069774/1‑150 (MQ=255) cACTGATTTTGCATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAgcg < 2:6657298/150‑1 (MQ=255) aCTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAgcgc > 2:2109196/1‑150 (MQ=255) aCTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAgcgc > 2:5213547/1‑150 (MQ=255) TTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTTTGGCCGTGGTGAACCTGTTGGGGCGGGCGAGCCCGCGAATAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTg < 2:447845‑M1/150‑1 (MQ=255) aTTGTCTCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTga > 2:1806036‑M1/2‑150 (MQ=255) TTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTga > 2:189899‑M1/1‑150 (MQ=255) TCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTGAGACCaa < 2:8131284‑M1/150‑1 (MQ=255) | GCCGGGTGTCGAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCT‑CACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTGAGACCAAC > NC_002947/1975557‑1975856 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |