Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 2,068,177 | C→G | 13.4% | intergenic (+42/‑165) | PP_1838 → / → PP_1839 | membrane protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,068,177 | 0 | C | G | 13.4% | 668.2 / 77.7 | 222 | intergenic (+42/‑165) | PP_1838/PP_1839 | membrane protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (77/115); new base G (8/21); total (85/137) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.24e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.74e-01 |
Only 100 of 232 total aligned reads displayed.
AGCCCGGACCAGCCGGAAATGCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACT > NC_002947/2068028‑2068326 | aGCCCGGACCAGCCGGAAATGCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTcc < 1:6771821/150‑1 (MQ=255) aGCCCGGACCAGCCGGAAATGCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTcc < 1:3332523/150‑1 (MQ=255) cccGGACCAGCCGGAAATGCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCGca < 1:19254/150‑1 (MQ=255) cccGGACCAGCCGGAAATGCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCca < 1:6548029/150‑1 (MQ=255) ccGGACCAGCCGGAAATGCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCcac < 1:5707090/150‑1 (MQ=255) cGGACCAGCCGGAAATGCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCcaca > 2:2800435/1‑150 (MQ=255) ggACCAGCCGGAAATGCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAg < 1:1029589/150‑1 (MQ=255) aCCAGCCGGAAATGCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGc < 1:4459867/150‑1 (MQ=255) cAGCCGGAAATGCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCGCACAggacc > 2:5805128/1‑147 (MQ=255) aGCCGGAAATGCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTGGCCGGGGTGGCCGCGGCCACCgggctg > 1:2528685/1‑146 (MQ=255) aGCCGGAAATGCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAtt < 2:4259911/150‑1 (MQ=255) aGCCGGAAATGCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAtt > 2:5323741/1‑150 (MQ=255) gAAATGCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCCCACGCATTTcaca > 2:1518411/1‑150 (MQ=255) aaaTGCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAg < 2:1814940/150‑1 (MQ=255) aaTGCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAgg < 1:3052834/150‑1 (MQ=255) tGCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGt > 2:1437731/1‑150 (MQ=255) gCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGtt < 2:7987904/150‑1 (MQ=255) cTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTc < 2:2512785/150‑1 (MQ=255) tCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGttag > 2:6004274/1‑148 (MQ=255) aagaagCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑a > 2:2645690/1‑150 (MQ=255) aagaagCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑a > 2:5458152/1‑150 (MQ=255) aagaagCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAGTGCACAGGGTTCGG‑a > 2:5786568/1‑150 (MQ=255) aagaagCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCGTGCCCGCGCCCACAGGCATTGCACAGGGGTCGG‑a > 1:3612747/1‑150 (MQ=255) agaagCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑Ac < 1:5323741/150‑1 (MQ=255) gaagCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCAATGCACCGGGTTCGG‑Acc > 1:4368085/1‑150 (MQ=255) agCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGTCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCtt < 2:3290798/150‑1 (MQ=255) agCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCtt < 2:5134945/150‑1 (MQ=255) agCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAAGGTCCGA‑Accct < 2:8271627/150‑3 (MQ=255) tGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCtgcac < 1:645003/150‑5 (MQ=255) ggAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGGGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGATTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTAAG‑ACCTTGTGc < 1:6153532/150‑1 (MQ=255) ggAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGc < 2:4618850/150‑1 (MQ=255) aaGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCaa < 2:6199610/150‑2 (MQ=255) cGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCCCGCACAGGACCTGCACAAGGTCCGA‑ACCCTGTGCaatgc < 1:2410129/150‑5 (MQ=25) tataTCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCGCACAGGACCTGCACAAGGTCCGA‑ACCCTGTGCaatgcct < 2:1687258/150‑7 (MQ=21) tataTCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCGCACAGGACCTGCACAAGGTCCGA‑ACCCTGTGCaatgcct < 2:237520/150‑7 (MQ=21) tataTCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCt < 1:1449579/150‑1 (MQ=255) atatCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCGTGTGTAGGTCCtg > 2:2031176/1‑150 (MQ=255) tatCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCTGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCtgt < 1:2883506/150‑1 (MQ=255) tatCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCtgt < 2:4596661/150‑1 (MQ=255) tCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGc > 2:7513104/1‑150 (MQ=255) tCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGc > 2:229969/1‑150 (MQ=255) tCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGc < 1:5458152/150‑1 (MQ=255) tCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGc < 2:7898340/150‑1 (MQ=255) 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ccGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCgg < 2:1145383/150‑1 (MQ=255) gcgACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCGCACAGGACCTGCACAAGGTCCGA‑ACCCTGTGCAATGCCTGTGGGAGCGGGc < 1:5951702/150‑1 (MQ=18) ctgctgGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGAAAGCCCGCGAAt < 2:7189743/150‑1 (MQ=255) tgctgGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCGCACAGGACCTGCACAAGGTCCGA‑ACCCTGTGCAATGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCAAATg < 2:8530094/150‑1 (MQ=17) tgctgGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATg < 2:5051006/150‑1 (MQ=255) 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cacaCCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACCGGCTTTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACAtt < 2:6940620/150‑1 (MQ=255) cGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATccc < 2:1221571/150‑1 (MQ=255) gaatgggCCGCAACGCGGCCCCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCCCAGGCATTGCCCCGGGTTCGG‑ACCTTGGGCAGGTCCGGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGCCGGAACAATATCccccccccca > 2:4924767/5‑148 (MQ=25) aCCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCaa < 2:5633478/150‑1 (MQ=255) cgggggCCGGGTGGCGGCCCTTTCGGGGGTTGGCCCGCTCCAACTGGATTTGCACTGGTTTGGG‑ACCTTGTGCCGGCCCTGTGCGAGCGGGCACGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAg < 1:4965442/148‑1 (MQ=255) atgggCCGCAACGCGGCCCATTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAGGCAGTGCACAGGGGTCGG‑TCCATGTGCAGGTCCAGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGGATGGGCCCCGCCCAAATTTACCGGGCAGTACATTATCCCCGCCCCCAgg > 1:8001131/3‑150 (MQ=255) gCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCAAAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAg < 2:6541715/150‑1 (MQ=255) cgcgTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGtt < 2:7140797/150‑1 (MQ=255) gTTGGGGCCCTTTCGGGGGCTTGCCCTCCCCCACAGCCATTGCCCCGGGTTCGC‑AGCTGGTGCCGGCCGGGGGCGCGCGGGAAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTAtt < 1:7503721/150‑1 (MQ=255) aacgCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTtgt < 1:1953149/58‑1 (MQ=255) aacgCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTtgt > 2:1953149/4‑61 (MQ=255) 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ccATTCGCGGGCTTGCCCGCACCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAACCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCCGTTATTCAGGCATc > 2:2360235/1‑150 (MQ=255) cttgcgggggCTTGCCCGCTCCCCCCGGCATTCCAGTGGGTTCGG‑ACCTTGTGCCGGCCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATca < 1:4293497/143‑1 (MQ=255) gggCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTGGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCt < 1:5789446/150‑1 (MQ=255) ggtGCCCGCGCCCACCGGCTTTGCACCGGGTTCGG‑ACGTTGTGCAGGTCCTGGGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGgt < 1:7911451/148‑1 (MQ=255) cTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGgt > 2:764665/1‑150 (MQ=255) ttGCCCGCTCGCACAGGACCTGCACAAGGTCCGA‑ACCCTGTGCAATGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGgtg > 1:5219093/1‑150 (MQ=18) ttGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGgtg > 1:4535385/1‑150 (MQ=255) gcccgcccCCCCGGGCATGGCCGTGGGTTCGG‑CCCTGGTGCTGGCCGGGTGCGCGGGGCCACGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGtt < 1:3834770/150‑1 (MQ=255) gCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGtt > 2:793279/1‑150 (MQ=255) gCCCGCACCCACCCGCATTGCAC‑GGGTTCGGCACCTTGTGCCGGGCCTGTGCGCGGGGGAAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGtt < 1:1763152/150‑1 (MQ=255) cccGCTCCCACCGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCTGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTc < 2:2464958/150‑1 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACCCACCTGGTGTTCg > 1:855484/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCg > 2:1898715/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCg > 2:2928487/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCg > 1:7184485/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCg > 1:6345888/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCg > 1:364650/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCg > 1:3552378/1‑150 (MQ=255) cGCTCGCACAGGACCTGCACAAGGTCCGA‑ACCCTGTGCAATGCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGt > 1:2467665/1‑150 (MQ=18) cGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGt > 1:2593744/1‑150 (MQ=255) 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ccACAGGCATTGAACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCAGCGAAAGGGCCCCGCACAATTTTACCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAATGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTAGTTGACt > 2:4292198/1‑150 (MQ=255) | AGCCCGGACCAGCCGGAAATGCTCAAGAAGCTGGAAGCGTATATCCAGACCGCGACCAAGAGCCTGCTGGATAACACCGCCGGCGTGGTGCACGGCACACCGAAGTAAACCGGGGCCGCGTTGCGGCCCATTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGCATTGCACAGGGTTCGG‑ACCTTGTGCAGGTCCTGTGCGAGCGGGCAAGCCCGCGAATGGGCCCCGCACAATTTTCCCGGACTGAACATTATCCCCGCCCCAAGGTCAGTTATTCAGGCATCACACACCTGGTGTTCGTTGACT > NC_002947/2068028‑2068326 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |