| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,083,255 | A→C | 17.8% | intergenic (+48/+67) | PP_1853 → / ← PP_1854 | LysR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,083,255 | 0 | A | C | 17.8% | 428.9 / 16.5 | 220 | intergenic (+48/+67) | PP_1853/PP_1854 | LysR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (94/73); new base C (12/31); total (106/114) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.07e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
AAGCTGTTGCCGGGCAAGACCCGGGCGTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCA > NC_002947/2083106‑2083404 | aaGCTGTTGCCGGGCAAGACCCGGGCGTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCcaca > 2:2499745/1‑150 (MQ=255) aGCTGTTGCCGGGCAAGACCCGGGCGTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAg < 1:718004/150‑1 (MQ=255) gCTGTTGCCGGGCAAGACCCGGGCGTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCGTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGGCCGCCCGCACCcccacg > 1:921004/1‑148 (MQ=255) cTGTTGCCGGGCAAGACCCGGGCGTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAggg < 1:7963871/150‑1 (MQ=255) tGCCGGGCAAGACCCGGGCGTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCCGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCCCGCCCCCCgggggat > 1:4751678/1‑146 (MQ=255) gggCAAGACCCGGGCGTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATcaca < 1:6789323/150‑1 (MQ=255) gggCAAGACCCGGGCGTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATcaca < 2:1265577/150‑1 (MQ=255) gCAAGACCCGGGCGTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGc < 1:6253707/150‑1 (MQ=255) aGACCCGGGCGTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACCGGGATATAACAGcccg > 2:3241217/1‑149 (MQ=255) ccGGGCGTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGaat > 2:8165182/1‑149 (MQ=255) cGGGCGTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCCCCCGCACCCACACGGCAATAAAAACCCagaaga > 1:2490214/1‑150 (MQ=255) gTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGGATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTg < 1:3690013/150‑1 (MQ=255) gTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTg < 2:1244039/150‑1 (MQ=255) aTCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGAAAGTGGGGt > 2:1381241/1‑150 (MQ=255) cGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTcc < 2:650256/150‑1 (MQ=255) cGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTcc < 1:5254478/150‑1 (MQ=255) gATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGGCCGCCCGCACCCAGCGGGATGTGACAGCCCTGAAGAAAGGGGGGtggt > 1:5398580/1‑147 (MQ=255) gATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCCCCCCCACAGGGCTATAAAAGACCAGAAAAAACGGGGGTccg > 1:3097858/1‑149 (MQ=255) ttGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTtgtg < 2:8690267/150‑1 (MQ=255) gtggtgGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTggg > 2:3487834/1‑150 (MQ=255) ggtggAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAg > 2:3785851/1‑150 (MQ=255) gtggAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGTGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCATTTTCGCGGGACCTCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAgc < 1:609453/150‑1 (MQ=255) gtggAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGTAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAgc < 1:7827290/150‑1 (MQ=255) gtggAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAgc < 1:3882941/150‑1 (MQ=255) gtggAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCCCACCCACACGGCTAACACACCCCGGAAGACAGGGGGGTCCGGGGGGGAgc > 1:70323/1‑150 (MQ=255) ggAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAgcgg < 1:5636464/150‑1 (MQ=255) gAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCC‑TTTCGCGGGCCCGCCCCCCCCCCCCGGGCGATCCCCGCCCAGAAGACACGGGGGTCCGGGTGGGAgcgggc > 1:4550434/1‑150 (MQ=255) gCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCCCAGGGAGATCACAGCCCGGCAGACAGGGGGGTCCTTGTGGGAgcgggcg > 2:4541793/1‑150 (MQ=255) gCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCCCACCCACAGGGATATAACAGCCCGGAAGACAGTTGGGGGCTTGTGGGAgcgggcg > 1:3428163/1‑150 (MQ=255) cAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAgcgggcgg < 1:1088647/150‑1 (MQ=255) gTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCgggcgggc < 2:5556738/150‑1 (MQ=255) gTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCGGGAGACAGTGGGGTCCGTGTGGGTgcggggcggc > 1:1394846/1‑145 (MQ=255) tttGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCAGAAGACAGAGGGGTCCTTGTGGGAGCGggccggcc > 2:6974151/1‑150 (MQ=255) cGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCCCAGGGGTATCACAGCCCAGAAGACAGTGGGGTCCTGGGGGGAGCGGGCGGGCCcgcgc > 1:6863377/1‑149 (MQ=255) gAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGATTTTTTGCCTGTGGCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACTGGTATTTCACACCCCTGATTACTGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGaa < 2:1851174/150‑1 (MQ=255) gCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGCTGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAaga < 2:3640349/150‑1 (MQ=255) cAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACACGGATATAACACCCCAGAAGAAACTGGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCCAacag > 1:6930883/1‑150 (MQ=255) ggggGTGGGGGGGCGGTTCGATGCCCTGCTGGCCCTTTAGTGATTTATTGCCTGTGCGGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACCGGTATATCACAGCCCTGAAGACCGTGGGTTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGc < 2:6919098/150‑1 (MQ=255) ggCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCCCACCCACAGGGATAAAACACCCCAGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCg > 2:3199265/1‑150 (MQ=255) gattGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCAGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGGAGAGGCCg > 2:8756184/4‑150 (MQ=255) gCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGACGAGGCCgg > 2:7659154/1‑150 (MQ=255) ggcggggcggTTCGATGCCCTGCCGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCCCAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGACGAGGCCGGGTc > 2:3596339/1‑150 (MQ=255) ggcggggcggTTCGAAGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGACTTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGAAATCAAATACCTTAATAAAGTTCGGTCCTGGTGGGAGCAGGCGGGCACACGCAGAGGCCGGtac > 2:5115774/1‑148 (MQ=255) gcggggcggTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGTATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCa < 2:5697641/150‑1 (MQ=255) gTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCtt > 2:4260666/1‑107 (MQ=255) gTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGTGCGGGCGGGCCCGCGAAGTGGCCGGTTCAGACAACAt > 2:7389618/1‑150 (MQ=255) ttCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGGGGGAGCGGGCGGGCCCGCGACGAGGCCGGTTCAGACAACATc > 2:7317874/1‑150 (MQ=255) gATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACCGGGATATCACAGCCCTGAAGACTGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGAc < 2:4178172/150‑1 (MQ=255) aTGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCGGGCCCCCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACAACGACa > 2:3841410/1‑150 (MQ=255) aTGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCACCCGCACCCACAGGGCTATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTGCGTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGGCGAGGCCGGGTCAGACCACAACGACa > 1:4023566/1‑150 (MQ=255) tGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGACAACAGCGACaa > 2:8396148/1‑150 (MQ=255) cccTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGGTCAGACCACATCGACaaag > 1:8683913/1‑148 (MQ=255) cTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACACTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCCCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACCACGAccaagac > 2:7577188/1‑144 (MQ=255) tGCTGGCCCTTTCGATAATTTTTGCCTGGGCCGGCCTTTGCGCGGGCCCGCCCGCACCCCCCGGGATATCACAGCCCTGAAGACCGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAAc < 2:5297098/150‑1 (MQ=255) tGCAGGCCCTTTATAGAATTTTTGCCTGTGCCGGCCTTTGCGCGGGCCCGCCCGCACCCACCGGTATATCACCGCCCTGATGACCGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAAc < 2:1774775/150‑1 (MQ=255) tGCAGGCCCTTTAGTGAATTTTGGCCTGGGCGGGCCTTTTGGCGGGCCCGCCCGCACCCACCGGTTTATCCCCGCCCTGAAGACTGTGGGGTCCTTGGGGGCGGGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAAc < 2:3097858/150‑1 (MQ=255) tGCAGCCCCTTTACACAATTATCGCCTGCCCCGGCCTTTTCGCGGCCCCCCCCGCACCCACAGGCAAAACACACCCCTGAACACACTGGGCACCTTGTGGCAGCGGCCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAAc < 2:5398580/150‑1 (MQ=255) gCCCTTTAGAGACTTAGTGCCTGTGCCGGCCTTTGCGCGGGCCCGCCCGCACCCCCCGGTATATCCCAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATAc < 2:5439974/150‑1 (MQ=255) tttcgcgaATTATGGCCGGTGCCGGCCTTTTGGGGGGCCCGCCCGCACCCACGGGGTTATCACCGCCCTGACGACTGTGGGGTCGTTGTGGGCGGGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCtgt < 2:6708088/144‑1 (MQ=255) tttAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCCCCGGGGTATCACAGCCCAGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGGAGCGGGCGGGTCAGACAACAAAGACAAAGATCGagaacagg > 1:2073518/1‑143 (MQ=255) gcgcatttttGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACCGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGGGGGGTCGTTGTGGGAGGGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTgcgc < 2:4751678/146‑1 (MQ=255) gaATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCAACCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACACTGGGGTCCTGGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACAAAGACAAAGAACGAAACCAGTGCGccc > 2:2636676/1‑150 (MQ=255) aaTTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTGCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCa > 2:7769832/1‑150 (MQ=255) atttttGCCTGGGCCGGCCTTTTGGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGTATATCACAGCCCTTAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAg < 2:3328173/150‑1 (MQ=255) attattGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGTTATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAg < 2:661279/150‑1 (MQ=255) attCCCTGTGCGGGCCTTTGCGGGGGCCCGCCCGCACCCACTGGTATATCACCGCCCTGAATCCCGTGGGGTCGTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTg < 1:4212193/150‑1 (MQ=255) ttGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACCGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGGGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGc < 2:5794561/150‑1 (MQ=255) ttGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGTATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGc < 2:1983619/150‑1 (MQ=255) tggCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACCGGGATATCACAGCCCTGAAGACTGTGGGGTCGTTGTGGGAGGGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGc < 2:4059181/148‑1 (MQ=255) gCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCAc < 2:2144225/150‑1 (MQ=255) ccTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGGGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCAcc < 2:8581294/150‑1 (MQ=255) ccTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATAACACACCCCAGAAGACAGTGGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCGGGCCCCCCAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACCAAGAACGATAACAGTGCGCCCCGGTGCAcc > 2:1096320/1‑150 (MQ=255) cTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCCAAGAGGCCGGTTCAGACAACCACGACAATGAAAGATACCTGTGCGCCCAGGGGCACCt > 2:3699440/1‑150 (MQ=255) tgtgCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGGTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCCGGTGCACCTc > 2:6039160/1‑150 (MQ=255) ggggCCGGCCTGTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCCCCGGGATATCACAGCCCTGAAGAACGTGGGGTCGTTGTGGGTGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTc < 2:5331087/147‑1 (MQ=255) ccGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCCCCGGTATACCACCGCCCTGAAGACAGGGGGGTCCTGGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCa < 2:6022907/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTTTGCGGGGGCCCGCCCCCACCCCCCGGTATTTCACAGCCCTTACTCCCTGGGGGTCCTTGGGGGTGGGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCa < 1:2662109/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTTTGCGGGGCCCCGCCCGCACCCACCGGCATACCCCAGCCATTAAGACTGGGGGGGCGGTGTGGGCGGGGGGGGCCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCa < 1:8282715/150‑1 (MQ=255) cGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCGTGTGGGCGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATAGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCAt > 2:911641/1‑150 (MQ=255) ggCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTggg > 1:7205643/1‑58 (MQ=255) ttttCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATAACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCCGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACAACGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCGCGTCCGCCAcc > 2:8129364/1‑150 (MQ=255) ttgcgggggCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACTGTGGGGTGCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCAccc < 1:6328453/144‑1 (MQ=255) tCGGGGCCCCCCCCGCACCCACCGTTATATCCCTCCCCTTACTACTGTGGGGTCGGTGGGGGCGGGGGGGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGc < 1:1712586/150‑1 (MQ=255) tCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCCCCGCCCTTAAGACCGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGc < 2:1509578/150‑1 (MQ=255) gtgcgggcggGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGc > 2:634865/3‑150 (MQ=255) ggggggccccgcccgCACCCACAGGTATTACACCCCCCTGACGCAGGGGGGGTCGTGGGGGGCGCGGGCGGCCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGc < 1:7431764/143‑1 (MQ=255) gcgGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACCGTGGGGTCCTGGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACCTCGACCATGAACGATACCTGTGCGCCCCGGTGCACCTCGGCATCCACCCGCtt > 2:1930149/1‑150 (MQ=255) gcgGCCCCGCCCGCCCCCACCGGGATATCACCCCCCGGAACACCGGGGGGACGTTGTGGGCGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCtt < 1:1024148/150‑1 (MQ=255) gcccgcccGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGccc > 1:7768402/1‑150 (MQ=255) ccgcccgcACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGAGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCcag > 2:1762988/1‑150 (MQ=255) gcccgcACCCCCCGGTATATCACAGCCCTTAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCcagca < 1:640363/150‑1 (MQ=255) gcccgcACCCACCGGGATACCACAGCCCTCAAGCCAGTGGGGTCCTGGTGGGAGGGGGGGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCcagca < 1:669855/150‑1 (MQ=255) gcccgcACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACCGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCcagca < 2:1170169/150‑1 (MQ=255) aCCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTtgct > 1:6749559/1‑150 (MQ=255) ccACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTtgctgc > 1:8327222/1‑150 (MQ=255) ccACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTtgctgc > 1:7258844/1‑150 (MQ=255) cacaGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGcc > 1:5665769/1‑150 (MQ=255) cacaGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGcc > 1:3376140/1‑150 (MQ=255) cacaGGGATACCACCGCCCTGAAGACAGTGGGGCCCTGGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGcc < 2:921004/150‑1 (MQ=255) acaGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGccc > 2:8525118/1‑150 (MQ=255) | AAGCTGTTGCCGGGCAAGACCCGGGCGTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCA > NC_002947/2083106‑2083404 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |