Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,083,266 | A→C | 10.1% | intergenic (+59/+56) | PP_1853 → / ← PP_1854 | LysR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,083,266 | 0 | A | C | 10.1% | 511.9 / 5.1 | 212 | intergenic (+59/+56) | PP_1853/PP_1854 | LysR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (105/77); new base C (2/26); total (108/104) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.25e-07 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
GGGCAAGACCCGGGCGTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGT > NC_002947/2083117‑2083415 | gggCAAGACCCGGGCGTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATcaca < 1:6789323/150‑1 (MQ=255) gggCAAGACCCGGGCGTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATcaca < 2:1265285/150‑1 (MQ=255) gggCAAGACCCGGGCGTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATcaca < 1:5841740/150‑1 (MQ=255) gCAAGACCCGGGCGTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGCTAACACAGc > 1:4884776/1‑150 (MQ=255) ccGGGCGTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACACGGATATCACAGcccacaag > 2:8165190/1‑145 (MQ=255) gTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGGATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTg < 1:3690013/150‑1 (MQ=255) tCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTggg < 2:6859148/150‑1 (MQ=255) aTCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCCCAGGGATATAACAGCCCAGAAGACAGTGGGGt > 1:1429268/1‑150 (MQ=255) aTCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGt > 2:8440519/1‑150 (MQ=255) tCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTc > 2:1893187/1‑150 (MQ=255) gATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGGCCGCCCGCACCCAGCGGGATGTGACAGCCCTGAAGAAAGGGGGGtggt > 1:5398580/1‑147 (MQ=255) ttGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTtgtg < 2:8690267/150‑1 (MQ=255) ttGTGGTGGAGCAGTGTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTtgtg < 2:8555925/150‑1 (MQ=255) tgtgGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTTCAGGCACTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCTCCCGCACCCAGAGTGATATGACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTgg < 2:539265/150‑1 (MQ=255) tgtgGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTgg < 2:3639041/150‑1 (MQ=255) tgtgGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTgg < 1:8155976/150‑1 (MQ=255) gtggtgGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTggg > 2:3487834/1‑150 (MQ=255) tggtggAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGa < 2:1658731/150‑1 (MQ=255) ggtggAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCCCCGGGATAGAACAGCCCGGAAGACAGGGGGGTCCTTGTGGGAg > 1:7271021/1‑150 (MQ=255) ggtggAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAg > 2:3785851/1‑150 (MQ=255) gtggAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGTGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCATTTTC‑GCGGGACCTCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAgc < 1:609453/150‑1 (MQ=255) gtggAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAgc < 1:8763251/150‑1 (MQ=255) gtggAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAgc < 2:1332398/150‑1 (MQ=255) gtggAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAgc < 1:3882941/150‑1 (MQ=255) gtggAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCCCACCCACACGGCTAACACACCCCGGAAGACAGGGGGGTCCGGGGGGGAgc > 1:70323/1‑150 (MQ=255) tggAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCAGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAgcg > 2:8145838/1‑150 (MQ=255) tggAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCCCACCCACAGGGATATAACATCCCAGAAGAAAATGGGGTAATAGTGGGAgcg > 1:7854910/1‑150 (MQ=255) ggAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAgcgg < 1:5636464/150‑1 (MQ=255) ggAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATAACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAgcgg > 2:6063899/1‑150 (MQ=255) gAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCC‑TTTC‑GCGGGCCCGCCCCCCCCCCCCGGGCGATCCCCGCCCAGAAGACACGGGGGTCCGGGTGGGAgcgggc > 1:4550434/1‑150 (MQ=255) gCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCCCACCCACAGGGATATAACAGCCCGGAAGACAGTTGGGGGCTTGTGGGAgcgggcg > 1:3428163/1‑150 (MQ=255) cAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAgcgggcgg < 1:1088647/150‑1 (MQ=255) cGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCCCAGGGGTATCACAGCCCAGAAGACAGTGGGGTCCTGGGGGGAGCGGGCGGGCCcgcgc > 1:6863377/1‑149 (MQ=255) cGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCACTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCAGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATAACAGCCCAGAATACAGAGTGGTCCTTGTGTGAGAGGGCGGGCCCGCGa > 2:6688237/1‑150 (MQ=255) cAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACACGGATATAACACCCCAGAAGAAACTGGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCCAacag > 1:6930883/1‑150 (MQ=255) gggcgggcGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGTATATCACAGCCCTGAAGACTGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCTGCGAAGAGGcc < 1:5292134/150‑1 (MQ=255) ggCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACCGGGCTATCACAGCCCTGAAGACAGGGGGGTCCGGGTGGGCGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCg > 2:3199347/1‑150 (MQ=255) gattGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCAGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGGAGAGGCCg > 2:8756184/4‑150 (MQ=255) gCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACCGGGCTATAAACACCCGGAAGAAAGGGGGGTGCTTTGTGGCGCGGGGGGGCCCGCCAagcagcccg > 1:7359337/1‑143 (MQ=255) gCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGACGAGGCCgg > 2:7659154/1‑150 (MQ=255) tGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCCCCCGCACCCCCAGGGCGATCACAGCCCCCTACCCAGTGGGGGCCGGGTGGGACCGGGCGGGCCCCCGAAGCGGCCgggg > 1:6107670/1‑148 (MQ=255) gcggggcggTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATAACACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGCGGCCGGTTCa > 2:4479257/1‑150 (MQ=255) gTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCtt > 2:4260666/1‑107 (MQ=255) gTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGTGCGGGCGGGCCCGCGAAGTGGCCGGTTCAGACAACAt > 2:7389618/1‑150 (MQ=255) cgctGCCCTGCTGGCCCTTTAGAGAATTATGGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACTGGTATATCACAGCCCTGAAGCCAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGa < 2:5301458/147‑1 (MQ=255) cGAGGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGATTTATGGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCGGCCCGCACCCACCGGGATATCACAGCCCTGAAGACTGTGGGGTCCTTGTGGGTGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGa < 2:3949514/150‑1 (MQ=38) gATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACCGGGATATCACAGCCCTGAAGACTGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGAc < 2:4178172/150‑1 (MQ=255) aTGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCGGGCCCCCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACAACGACa > 2:3841410/1‑150 (MQ=255) gtGCTGGCCCTTTCGAGATTTTTTGCCTGTGCGGGCCTTTTC‑GGGGGCCCGCCCGCACCCACCGGGATAGCACCGCCCTGACGACCGTGGGGTCGTTGTGGGAGGGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGaa < 2:5402198/149‑1 (MQ=255) cTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACACTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCCCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACCACGAccaagac > 2:7577188/1‑144 (MQ=255) tGCAGGCCCTTTATAGAATTTTTGCCTGTGCCGGCCTTTGC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACCGGTATATCACCGCCCTGATGACCGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAAc < 2:1774775/150‑1 (MQ=255) tGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACCACATCGACAAAGAAc > 2:5590733/1‑150 (MQ=255) tttAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCCCCGGGGTATCACAGCCCAGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGGAGCGGGCGGGTCAGACAACAAAGACAAAGATCGagaacagg > 1:2073518/1‑143 (MQ=255) ttAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTGGGGGGCGCGGGCGGGCCCGCGCAGAGGCCGGTGCAGGCAACAGCGACCCTGCACGAGACCggtg > 2:6958419/1‑150 (MQ=255) tcgagaATTTTTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GGGGGCCGGCCCGCACCCACTGGGATATCACAGCCCTGAATACCGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTgc < 2:548644/148‑1 (MQ=255) gcgcatttttGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACCGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGGGGGGTCGTTGTGGGAGGGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTgcgc < 2:4751678/146‑1 (MQ=255) aaTTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACCACATCGACACTGAACGATACCTGTGCGcccc > 2:7823731/1‑149 (MQ=255) aaTTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCCCCCGCACCCACAGGGATATAACAGCCCGGAAGACAGGGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGCAGCGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCAGTGCGcccc > 2:2186842/1‑149 (MQ=255) atttttGCCTGGGCCGGCCTTTTG‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGTATATCACAGCCCTTAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAg < 2:3328173/150‑1 (MQ=255) tattGCCTGGGCCGGCCTTTGC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACTGGGTTAACACCGCCCTGAAGCCCGTGGGGTCGTGGGGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGt < 2:1485577/150‑1 (MQ=255) attCCCTGTGCGGGCCTTTGC‑GGGGGCCCGCCCGCACCCACTGGTATATCACCGCCCTGAATCCCGTGGGGTCGTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTg < 1:4212193/150‑1 (MQ=255) ttGCCTGTGCCGGCATTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGTATATCACAGCCATTAAGACAGTGGGTTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGc < 2:1984060/150‑1 (MQ=255) tGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATAGCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCGTTGTGGGAGGGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCa < 2:5229354/150‑1 (MQ=255) tGCCTGTGCCGCACTTTTG‑GCGGGCCCGCCCTCACCCCCATGTTTATCACAGCATTGAAGACATTGGGGTCCTTGTGGTAGCGGGGGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCa < 1:715300/150‑1 (MQ=255) ccTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATAACACACCCCAGAAGACAGTGGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCGGGCCCCCCAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACCAAGAACGATAACAGTGCGCCCCGGTGCAcc > 2:1096320/1‑150 (MQ=255) tgtgCCGGGCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTc < 2:6433848/150‑1 (MQ=255) tgtgCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACCGGGTTATCACAGCCCTTACTACCGTGGGGTCCTTGTGGGTGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTc < 1:8679508/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTTTGC‑GGGGGCCCGCCCCCACCCCCCGGTATTTCACAGCCCTTACTCCCTGGGGGTCCTTGGGGGTGGGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCa < 1:2662109/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTTGCG‑GCGGGCCCGCCCCCACCCACTGGCATACCCCCCCCATCAAGCCTGTGGGGCCCTGGGGGGTGGGGGGGGCCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCa < 1:283807/150‑1 (MQ=255) ccGGCATTTGG‑GGGGGCCCCCCCGCACCCACCGGTTTATCCCCGCCCTTAAGACTGGGGGGTCGTTGTGGGTGGGGGGGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCa < 1:4178325/150‑1 (MQ=255) cGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACCACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCAt > 2:6598495/1‑150 (MQ=255) cGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCGTGTGGGCGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATAGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCAt > 2:911641/1‑150 (MQ=255) cGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCAACCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGCAGAGGCCGGTTCAGAAAACATCGACAAAGAACGATACCTGTGCGCCCCCGGGCACCGCGTCAt > 2:119073/1‑150 (MQ=255) cGGCCCTTTCGGGGGGCCCGCCCCCACCCACTGTTTTATCACCGCCCTTAATCCTGTGGGGTCCTGGGGGGCGGGGGGGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCa < 1:8282915/150‑1 (MQ=255) ggCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTggg > 1:7205643/1‑58 (MQ=255) ccTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCa < 2:5699059/150‑1 (MQ=255) ttgcgggggCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACTGTGGGGTGCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCAccc < 1:6328453/144‑1 (MQ=255) ttC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACCGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTAAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCg > 2:6037883/1‑150 (MQ=255) gcgGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCtt > 2:1930459/1‑150 (MQ=255) gcgGCCCCGCCCGCCCCCACCGGGATATCACCCCCCGGAACACCGGGGGGACGTTGTGGGCGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCtt < 1:1024148/150‑1 (MQ=255) ggCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGATGCCCGTGGGGTCCTTGGGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGcc < 2:3684825/150‑1 (MQ=255) gcccgcccGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGccc > 1:7768402/1‑150 (MQ=255) cccgccccCACCCCCCGGTTTACCCCCCCCCTCAAGACTGGGGGGTCTTGGTGGGCGGGGGGGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCca < 1:3241217/150‑1 (MQ=255) gcccgcACCCACCGGGATATCACCGCCCTGACGACCGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGCCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCcagca < 1:640482/150‑1 (MQ=255) gcccgcACCCACCGGGATATCACAGCCCTGACGACTGGGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCcagca < 2:5900904/150‑1 (MQ=255) gcccgcACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACCGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCcagca < 2:1170169/150‑1 (MQ=255) gcccgcACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCcagca < 2:2563249/150‑1 (MQ=255) ccgcACCCACCGGGATATCACAGCCCTTAAGACTGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGt < 2:3011511/150‑1 (MQ=255) gcACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGAGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTtg < 1:1762988/150‑1 (MQ=255) aCCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTtgct > 1:6749425/1‑150 (MQ=255) ccccccgggATATCACCGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTtgctg < 2:3296637/144‑1 (MQ=255) cacaGGGATACCACCGCCCTGAAGACAGTGGGGCCCTGGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGcc < 2:921004/150‑1 (MQ=255) acaGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGccc > 2:3157944/1‑150 (MQ=255) aGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCAGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCa > 1:6381626/1‑150 (MQ=255) ggATATCACCGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAgc < 2:724506/150‑1 (MQ=255) tCACCGCCGTGCAGACAGTGGGTTCCTTGTTGGTGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGa < 2:5154094/150‑1 (MQ=255) cacaGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGAt > 1:1335295/1‑150 (MQ=255) cacaGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGAt > 1:1184461/1‑150 (MQ=255) cacaGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGAt < 2:5637688/150‑1 (MQ=255) acaGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATc > 2:7201328/1‑150 (MQ=255) | GGGCAAGACCCGGGCGTTCATCGATTTTGTGGTGGAGCAGTTTGCCGAGCAGGGGCTGGCGGGGCGGTTCGATGCCCTGCAGGCCCTTTAGAGAATTATTGCCTGTGCCGGCCTTTTC‑GCGGGCCCGCCCGCACCCACAGGGATATCACAGCCCTGAAGACAGTGGGGTCCTTGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTTCAGACAACATCGACAATGAACGATACCTGTGCGCCCAGGTGCACCTCGTCATCCACCCGCTTGCCCAGCAGTTGCTGCCCCAGCGGCGATCGT > NC_002947/2083117‑2083415 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |