| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,176,494 | T→A | 5.8% | intergenic (+37/+366) | PP_5484 → / ← PP_1924 | hypothetical protein/phosphinothricin N‑acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,176,494 | 0 | T | A | 5.8% | 1106.7 / 35.6 | 335 | intergenic (+37/+366) | PP_5484/PP_1924 | hypothetical protein/phosphinothricin N‑acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (173/140); new base A (8/12); total (182/153) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.47e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 341 total aligned reads displayed.
CGATCTCCCGTGCGAAGAATTACTACTTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCA > NC_002947/2176345‑2176642 | cgATCTCCCGTGCGAAGAATTACTACTTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCtt < 1:3485243/150‑1 (MQ=255) gATCTCCCGTGCGAAGAATTACTACTTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTg > 1:5920082/1‑150 (MQ=255) gATCTCCCGTGCGAAGAATTACTACTTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTg > 2:8607756/1‑150 (MQ=255) tcCCGTGCGAAGAATTACTACTTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGc > 1:5699225/1‑150 (MQ=255) cccGTGCGAAGAATTACTACTTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACAAGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCg > 2:4406926/1‑150 (MQ=255) tGCGAAGAATTACTACTTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGAt < 1:5057082/150‑1 (MQ=255) tGCGAAGAATTACTACTTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCCAAGAGCgggtc < 2:8147471/150‑3 (MQ=255) tGCGAAGAATTACTACTTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCCAAGAGCgggtc < 1:3077414/150‑3 (MQ=255) tGCGAAGAAGTACTACTGTGCTCGACAGCTTTCGGCGGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACACTTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCAGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCCAAGAGCgggtc < 2:8323534/150‑3 (MQ=255) gaagaaTTACTACTTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTa > 1:5432450/1‑150 (MQ=255) gaagaaTTACTACTTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTa > 1:1119154/1‑150 (MQ=255) gaagaaTTACTACTTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTa > 2:1964143/1‑150 (MQ=255) gaagaaTTACTACTTTGCTCGACAGCATTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATATTCCCTGAGCGCCGGTACAGATTGACGACATCCGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCATGGAGCGGGAATTa > 1:3246481/1‑150 (MQ=255) agaaTTACTACTTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATc > 2:3850328/1‑150 (MQ=255) agaaTTACTACTTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATc < 1:6844184/150‑1 (MQ=255) agaaGTACTACTTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGTTTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATc < 2:4813800/150‑1 (MQ=255) gaaTTACTACTTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATcc < 1:7194299/150‑1 (MQ=255) actactGTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTgg < 2:8219018/150‑1 (MQ=255) ctactTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTggg < 2:5777384/150‑1 (MQ=255) tactTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTgggg < 2:3427300/150‑1 (MQ=255) tactTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTgggg > 2:1444131/1‑150 (MQ=255) tactTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTgggg > 1:1749528/1‑150 (MQ=255) ctTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGt > 1:1281056/1‑150 (MQ=255) tttGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTa > 2:5260039/1‑150 (MQ=255) tCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCg > 2:2783918/1‑150 (MQ=255) tCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCg < 1:8061822/150‑1 (MQ=255) tCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATACAGTGGGGGTAGGGCg > 1:6193384/1‑150 (MQ=255) cGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCgg < 1:7750430/150‑1 (MQ=255) gACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCggg < 2:6317278/150‑1 (MQ=255) gACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCggg > 2:2974583/1‑150 (MQ=255) accgCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACACTTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACAGGGGTAGGCGACGTTTCGACCCGCTCTAGGTGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCgggg > 2:1155784/4‑150 (MQ=255) cAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGt > 1:4602724/1‑150 (MQ=255) aGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTa > 2:7890114/1‑150 (MQ=255) cTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTGTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAac < 1:8329475/150‑1 (MQ=255) tttCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAacg > 2:7653290/1‑150 (MQ=255) tCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAacgac > 2:267540/1‑150 (MQ=255) tCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAacgac < 1:1067616/150‑1 (MQ=255) tGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGcc > 2:3273244/1‑150 (MQ=255) tGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGcc < 1:6724942/150‑1 (MQ=255) tGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGcc > 2:6081979/1‑150 (MQ=255) tGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGcc < 1:6412066/150‑1 (MQ=255) gCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCTGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCg < 2:4644009/150‑1 (MQ=255) gCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCg < 1:8753137/150‑1 (MQ=255) cccGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGtt < 2:6427128/150‑1 (MQ=255) tGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGt < 2:3004775/150‑1 (MQ=255) gATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTg < 1:7674823/150‑1 (MQ=255) aTTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGc < 2:6523521/150‑1 (MQ=255) gggTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCttt < 2:3721447/150‑1 (MQ=255) ggTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTa > 2:1516654/1‑150 (MQ=255) gTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTAt > 2:7006946/1‑150 (MQ=255) ttCCGCCAGTTAACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGTTTGACGACATGGGTAGGCTAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATg < 1:6589546/150‑1 (MQ=255) cGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAg < 2:7154399/110‑1 (MQ=255) cGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCa < 1:2343322/150‑1 (MQ=255) gCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAg < 2:3333104/150‑1 (MQ=255) ccAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGc > 2:4551490/1‑150 (MQ=255) aGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCaa < 1:7257754/150‑1 (MQ=255) cacaATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACAcc < 1:6473880/150‑1 (MQ=255) cacaATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACAcc < 1:3687325/150‑1 (MQ=255) caATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCg < 1:1454439/150‑1 (MQ=255) tCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGAtt > 2:20631/1‑150 (MQ=255) aGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGAGCCGCTGTTGGTGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAAAACCCGGAttta > 2:4055141/1‑148 (MQ=255) aGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGa < 2:8636714/150‑1 (MQ=255) aGCTGCATTGTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGa < 2:557674/150‑1 (MQ=255) gCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAg < 1:1964143/150‑1 (MQ=255) cTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGc > 2:2435712/1‑150 (MQ=255) cTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGc < 1:245533/150‑1 (MQ=255) cTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGc > 2:1000612/1‑150 (MQ=255) gtCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCa < 2:5537641/149‑1 (MQ=255) tCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCAt < 2:4227746/150‑1 (MQ=255) ccTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGc < 2:278895/150‑1 (MQ=255) tGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTTGAGCGGGATTTATCAAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTAAGTGCTCTTTATGTCAGAAACACCCGGATTGAGCCTCGCCATGCaa > 2:1607346/1‑150 (MQ=255) tGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCaa > 2:7793908/1‑150 (MQ=255) gTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACa < 1:2218812/150‑1 (MQ=255) gTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACa > 2:2215688/1‑150 (MQ=255) aTTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTAt < 1:2761281/101‑1 (MQ=255) aTTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCtctc > 1:7132602/1‑150 (MQ=255) aTTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCGCGTGGAGCGGGATTTATACAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCtctc > 1:3436662/1‑150 (MQ=255) acATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCga < 2:3987710/150‑1 (MQ=255) cATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCACTAGCCGACAGCTCTCCCGCCaag > 2:8388992/1‑150 (MQ=255) gggTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACa < 1:5014550/150‑1 (MQ=255) ggTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTTGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAg < 1:7887055/94‑1 (MQ=255) ggTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAg < 1:4284054/150‑1 (MQ=255) ggCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTgg < 1:8561790/150‑1 (MQ=255) gCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGc < 1:3850328/150‑1 (MQ=255) gAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTa > 2:5858535/1‑150 (MQ=255) gAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTa > 2:7515217/1‑150 (MQ=255) gAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTAATTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACACCAGGcaa > 2:7480302/1‑148 (MQ=255) aaGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATACAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGATACGTTCTCTTTATTTCAGCAACACCCGGAATGAGCGAAGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCCAGACAGCAGGCTAt > 2:4954521/1‑150 (MQ=255) tttCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATccc > 1:3967360/1‑150 (MQ=255) tttCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATccc > 2:6698584/1‑150 (MQ=255) ttCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATcccc > 2:8120456/1‑150 (MQ=255) aaatcccGCTCCAAGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCa > 1:6985059/5‑150 (MQ=255) gACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACt > 2:5039939/1‑150 (MQ=255) gACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGAATGAGCGTCGCCATGCAAAAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACt > 1:4643148/1‑150 (MQ=255) tcccGCTCCAAGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACtt > 1:4766499/2‑150 (MQ=255) tcccGCTCCAAGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGGTGCGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACtt > 2:6776911/2‑150 (MQ=255) aCCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACtt < 1:6769410/150‑1 (MQ=255) aCCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACtt > 1:5806009/1‑150 (MQ=255) aCCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACtt < 1:1000612/150‑1 (MQ=255) ttGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCa > 2:1849856/1‑150 (MQ=255) | CGATCTCCCGTGCGAAGAATTACTACTTTGCTCGACAGCTTTCGGCTGCACCCGTGATTTGGGGTTCCGCCAGTTCACAATTCAGCTGCATTTTCCCTGAGCGCCGGTACTGATTGACGACATGGGTAGGCGAAGTTTCGACCCGCTCTTGGAGCGGGATTTATCCAGTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCA > NC_002947/2176345‑2176642 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |