Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 2,260,969 | A→C | 5.2% | intergenic (+37/‑667) | asd → / → PP_1990 | aspartate‑semialdehyde dehydrogenase/transposase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 2,260,969 | 0 | A | C | 5.2% | 1198.3 / 35.7 | 349 | intergenic (+37/‑667) | asd/PP_1990 | aspartate‑semialdehyde dehydrogenase/transposase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (169/161); new base C (5/13); total (175/174) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.77e-02 | |||||||||||
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Only 100 of 359 total aligned reads displayed.
CGCAAGCTGAACATGGGGTCGCAGTACCTGGGCGCGTTCACCGTGGGTGACCAGCTGCTGTGGGGCGCCGCCGAACCGCTGCGCCGCATGTTGCGGATTCTGCTGGAGCGTTGATCGTTCAGGCTTCACCTGAAAAATACCGCACTGGTGACAGTGCGGTATTTTTTTATGCCTGAAAGTATGCATTTGGGTCGCGGGCCTAATCGCCGGATAATTCATGCCGCTGTTTAATGGCGAAATGTCTGCTCTGACAGAGCCGTTGCCGTTGCCGTTGCTTTTGCTTTTGCTTCTAAGTGCGCG > NC_002947/2260819‑2261118 | cgcATGCTGAACATGGGGTCGCAGTACCTGGGCGCGTTCACCGTGGGTGACCAGCTGCTGT‑GGGCGCCGCCGAACCGCTGCGCCGCATGTTGCGGATTCTGCTGGAGCGTTGATCGTTCAGGCTTCACCTGAAAAATACCGCACTGGTGa < 2:153261/150‑1 (MQ=255) gcAAGCTGAACATGGGGTCGCAGTACCTGGGCGCGTTCACCGTGGGTGACCAGCTGCTGTGGGGCGCCGCCGAACCGCTGCGCCGCATGTTGCGGATTCTGCTGGAGCGTTGATCGTTCAGGCTTCACCTGAAAAATACCGCACTGGTGa < 2:1823241/150‑1 (MQ=255) tGAACATGGGGTCGCAGTACCTGGGCGCGTTCACCGTGGGTGACCAGCTGCTGTGGGGCGCCGCCGAACCGCTGCGCCGCATGTTGCGGATTCTGCTGGAGCGTTGATCGTTCAGGCTTCACCTGAAAAATACCGCACTGGTGACAGTGc > 1:5827457/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |