| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,300,837 | A→C | 6.1% | intergenic (+91/+42) | PP_5496 → / ← PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,300,837 | 0 | A | C | 6.1% | 580.3 / 3.2 | 228 | intergenic (+91/+42) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (117/89); new base C (17/4); total (134/94) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.65e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
AGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTT > NC_002947/2300688‑2300976 | gctggaggggtggctggcttctgagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCa > 1:8199508‑M1/80‑150 (MQ=255)gctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCa > 2:5369673‑M1/80‑150 (MQ=255)aGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTTTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGAAGCGGGCa < 1:3364641/150‑1 (MQ=255)aGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCa < 2:1458002/150‑1 (MQ=255)aGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGAAGCGGGCa < 1:3364177/150‑1 (MQ=255) gTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGAAGCGGGCac < 2:7406630/150‑2 (MQ=255) gTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGAAGCGGGCac < 2:6926734/150‑2 (MQ=255) gTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGAAGCGGGCac < 2:2483029/150‑2 (MQ=255) ctggtggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCAt > 2:77190‑M1/79‑150 (MQ=255) ctggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtccgTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCAt > 1:7115241‑M1/79‑150 (MQ=255) aaattggcgcCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCAt > 2:7296706/7‑150 (MQ=255) ggaggggtggctggcttcggagctgttcaaggcaatcatggtccgctgattaaacatcgggctgcacatgggtcctTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGc > 2:8630518‑M1/77‑150 (MQ=255) tGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCCTGCCCg > 1:544746/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGTCGCGGGCCGGccccc > 1:1808316/1‑148 (MQ=255) gcgcCAGAGCGCCAATTTCAATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGTGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGACCGCTTCGCAGGCATGCCAGc > 2:888271/1‑150 (MQ=38) ccAGAGCGCCAAGTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCGGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTcc < 2:4912164/150‑1 (MQ=255) agCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCTGCTCCcaca < 2:457194/150‑1 (MQ=255) cAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGAc > 1:1280279/1‑150 (MQ=255) ttCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTTATCTGTCTTGTGTGTGGTCCTTGTGGGAGGGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAt < 1:4206387/150‑1 (MQ=255) gtgttcaaggcaatcatggtccgcttattaaacatcgggctgcacttgggtcctTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAtgt > 1:5083788‑M1/55‑150 (MQ=255) cATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCCtgtg > 1:6503926/1‑150 (MQ=255) gCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAg > 1:7849686/1‑150 (MQ=255) cGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCCCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACCCACCCAAGTGCAGc > 1:6150555/1‑150 (MQ=255) ggCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGcc > 2:1220555/1‑150 (MQ=255) ccTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGa < 2:5747454/150‑1 (MQ=255) ccTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGa > 2:8481650/1‑150 (MQ=255) ctgcggggCACGCCCCCCCAGTGCTGTGGCTTGTGTGCGGTCCTTGTGGGAGGGGGCCGGCCCGCGACCACCGGCAGCGCCGGTGCCATCCCCCGCGGTGCCCGCTGCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGAt < 1:685401/144‑1 (MQ=25) tGAGTGGCACGCACCACCACTGATCGGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATg < 2:356694/150‑1 (MQ=255) gtttGGAAAGCACCACCACTGATCTGGATTGTGTGTGGTCCTTGGGGGAGCGGGCATGCCCGCCAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGGGGGGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGt < 1:2028107/147‑1 (MQ=37) tGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTa > 2:2883871/1‑150 (MQ=255) aaGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCCTGTGCAGCCCGATGTTTAAtaa > 1:8416325/1‑148 (MQ=255) gCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGc < 2:5721272/150‑1 (MQ=255) caccaccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCg < 2:1289216/150‑1 (MQ=255) accaccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTTATCAGCgg > 2:8112556/1‑150 (MQ=255) accaccacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGTCGCGGGCCTGCCCGCGCCCCCACCGACCCCTGTGCAGCCCGATGTTTAATAAGCgg > 1:6744551/1‑150 (MQ=37) accacTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGTCGCGGGCATGCCCCCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCCAAGTTTAAAAAGCGGAcc > 1:6015593/1‑150 (MQ=37) aTCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTg > 2:151119/1‑150 (MQ=255) tGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCAGGATTGCCt > 2:8134237/1‑150 (MQ=255) gggtggtgtgCGGTCTTTGGGGGAGGGGGCTGGCCCGCGAACCCCGCCCGCGCGGGGGCCACCCCCCGGGGGGCCGGCTCCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCtt < 1:45091/145‑1 (MQ=255) ttGTGTGTGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGTCGGTGCCAACCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGaa < 2:6430852/150‑1 (MQ=255) ttGTGTGAGGTCCTTGTGGGTGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGaa < 2:4358571/150‑1 (MQ=255) ttGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGaa < 2:3432439/150‑1 (MQ=255) gtgtgAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACGCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACa < 2:6126276/150‑1 (MQ=255) gAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCcaca < 2:681652/93‑1 (MQ=255) cggTCCTTGTGGGCGCGGGCCGGCCCGCTAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCCCCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCAGGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTcc < 1:1898946/149‑1 (MQ=38) aGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGTCCCGGGCCAGCCCCCGCCCCCACCGACCCAAGTGCACCCCCCGGGTTAATCCGCGGGCCAAGATTGGCTTGTACAGCGcc > 1:6655021/1‑150 (MQ=16) gTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCCCGTCGCGGGCAGGCCCGCACCCACCCGGACCCAAGTGCAGCCCCATGTTTAAAAAGCGGACCCTGATTTCCATGGAAAGCTccca > 1:2332859/1‑148 (MQ=21) gTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGAGCCCGCTTCGCGGGCATGACCGCTACCACAACCAACCATGTGCAGCACCATGTTTAAACACCTGACCATGATTGCCTTGAACAgaaacga > 1:8640392/1‑144 (MQ=21) tCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGaa > 1:4945947/1‑150 (MQ=255) tCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCAGGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGaa < 1:7688193/150‑1 (MQ=255) ttGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAagcc > 2:7073115/1‑150 (MQ=255) gggtgggggCTTGCCCGCTAACACCGGCCGCGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCAGGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAagccagcc < 1:8299164/144‑1 (MQ=38) GAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCAc > 2:5796167‑M1/1‑150 (MQ=255) AGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCAcc < 2:7796489‑M1/150‑1 (MQ=255) CGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCCGACCATGATTGCCTTGAACACCTCCGAAGCCCGCCAcccc < 2:2989268‑M1/150‑1 (MQ=255) GGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCt > 2:4291933‑M1/1‑150 (MQ=255) CATGCCCGCGAACACCGGCTGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCAGGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTcca > 1:4628257‑M1/1‑150 (MQ=255) TGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGTACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTccagc < 2:5648282‑M1/150‑1 (MQ=255) TGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCAAGTGCAGCCCGATGTTTAATAAGCGGACCATGATTGCCTTGAAAAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCAccagc < 1:3348257‑M1/150‑1 (MQ=255) GCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAAACAGCGGACCATGATTGCCTTGTACAGCTCCGAAGCCAGCCACCcctccaacc < 1:7215487‑M1/150‑4 (MQ=255) CCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCCAGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCtccagccac < 2:1768506‑M1/150‑2 (MQ=255) CCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTTATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTccagccag < 1:7273457‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCCGGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCCGCCACCCCTccagccag < 2:4124835‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGGTTAATCAGCGGCCCAGGATTGCCGTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTccagccag < 2:6707152‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAACGACCCAAGTGCAGCCCGATGTTTAAACAGCGGACCATGATTGCCGTGAACACCACCGAAGCCAGccaccccaccaccccc < 1:6781398‑M1/150‑6 (MQ=255) gacccccGGCAGAGCGGGTGCCATCCACCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCAGGCCCGCCCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTcc < 1:1047384/145‑1 (MQ=255) GAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTcc > 2:6264729‑M1/1‑150 (MQ=255) GAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTcc > 2:8622464‑M1/1‑150 (MQ=255) acCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGTCCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCCTGATTGCCGTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGcac > 2:4429539/1‑150 (MQ=255) acCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGcac > 2:8292120/1‑150 (MQ=255) acCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGcac > 1:6428060/1‑150 (MQ=255) acCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCACCAGCCAGCTCCGcac > 2:409231/1‑150 (MQ=255) gccgagCCGGTGCCACCCACCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACAcgc < 1:5597823/147‑1 (MQ=255) gCAGAGCCGGTGCCATCCCCCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACAcgc < 2:5140729/150‑1 (MQ=255) agCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGGCCGATGTTTAATAAGCGGACCCTGATTGCCTTGGACCGCGCCGAAGCCCGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGAt > 2:6774521/1‑150 (MQ=39) gCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGCTTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCGCCAGCCCGCTCCGCACACGCGGATa > 2:7570200/1‑150 (MQ=255) cgggTGCCAGCCCCCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCATCCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATaa < 1:919680/148‑1 (MQ=255) ccGGTGCCCTCCACCGCGGTGCCCGCTGCGCGGCCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATaa < 1:6781159/150‑1 (MQ=255) ccGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATaa > 2:2146970/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATaa < 2:2024097/150‑1 (MQ=255) ccGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGTCGCGGGCCTGCCCCCTCCCACACCGCCCCATTTGCAGCCCGATTTTTAATCAGCGGACCATGATTTCCTTTAAAAACTCCCAAGCCACCCACCCCACCACCCACCTCCCCACACCCGGATaa > 1:5923104/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCCATCCACCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATaa < 2:6088896/150‑1 (MQ=255) ccGGTGCCACCCCCCGCGGTACCCGGTTGGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATaa < 1:900137/150‑1 (MQ=255) ggTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCAGGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAgc < 1:6302245/150‑1 (MQ=255) ggTGCCATCCACCGCGGGGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAgc < 1:2989268/150‑1 (MQ=255) gTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGTCGCGGGCAATCCCCCGCCCACACGGACCCAAGTGCAGCCCGAGGTTTAATAAGCGGACCATGATTTCCTTGAACACCACCGAAGCCACCCACCCCACCCGCCACCTCCCCACACCCGGATAAgcc > 1:385379/1‑150 (MQ=255) tGCCATCCACCGCGGTGCCCGCGTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCCTGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCGTGAACAGCTCCCAAGCCAGCCACCCCACCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAgccg > 2:90848/1‑150 (MQ=255) gCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACCCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAgccgc < 1:1522580/150‑1 (MQ=255) cATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCt > 1:5857901/1‑150 (MQ=255) aTCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCACGATTTCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTc > 2:1119648/1‑150 (MQ=255) aTCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGAGGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCACCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAgccgccac > 2:333634/1‑148 (MQ=255) cACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTGCCACAAGGACCCAAGTGCAGCCCGATGTTTAATAAGCGGACAATTATTGCCTTGAAAAGCTCCGAACCCCGCCAACCCTACAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAATCCGCCACGGc > 1:2814300/1‑150 (MQ=255) aCCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCACCAGCCAGCTCCCCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCg > 1:6354088/1‑150 (MQ=255) aCCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCACCCACAAGGAACCAAGTGCAGCCCGATGTTTAATAAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCACCAGCCAGCTACGCACACGCCGATAAGCCGCCTCGGCg > 1:5302306/1‑150 (MQ=255) ccGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCACGGCGa > 2:4217959/1‑150 (MQ=255) cgcgGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGaa > 2:1963557/1‑150 (MQ=255) gcgGTGCCCGCTTCGCGGGCAGGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAAc < 2:8373004/150‑1 (MQ=255) gCCCGCTTCGCGGGCAGGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTg < 1:2614634/150‑1 (MQ=255) cccGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGc < 2:4776567/150‑1 (MQ=255) cTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGtt < 2:3666181/150‑1 (MQ=255) | AGTACCTGCGCCAGAGCGCCAATTTCCATGCGGCCCTGAGTGGCAAGCACCACCACTGATCTGGCTTGTGTGAGGTCCTTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAGAGCCGGTGCCATCCACCGCGGTGCCCGCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTT > NC_002947/2300688‑2300976 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |