| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,310,204 | G→A | 6.1% | L449L (CTG→TTG) | PP_2028 ← | TPR repeat‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,310,204 | 0 | G | A | 6.1% | 1132.3 / 39.7 | 360 | L449L (CTG→TTG) | PP_2028 | TPR repeat‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (192/146); new base A (11/11); total (203/157) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.58e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.49e-01 | |||||||||||
Only 100 of 375 total aligned reads displayed.
TTCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGTCGCCTT > NC_002947/2310055‑2310353 | ttCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGcagcag > 2:6918808/1‑150 (MQ=255) ggggCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTtg > 2:3950594/1‑150 (MQ=255) ggggCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGACTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTtg < 2:5553378/150‑1 (MQ=255) gggCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTtgc < 2:3752686/150‑1 (MQ=255) ggCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTtgct < 2:1352947/150‑1 (MQ=255) tGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCa > 1:7922/1‑150 (MQ=255) gCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCAcc > 1:6266294/1‑150 (MQ=255) ccTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAACTGCTGCAACa < 2:826482/150‑1 (MQ=255) tGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAgc > 1:1055330/1‑150 (MQ=255) tGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAgc > 1:8579739/1‑150 (MQ=255) tGTTGGTCGTCGCCGGGCGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGTAGCAACTGCTGCAACaac < 2:2898688/150‑3 (MQ=255) ttGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAgcgc > 2:4542056/1‑150 (MQ=255) ttGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGGTGCAGCAACTGCTGCAACaac < 2:1435834/148‑3 (MQ=255) ttGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGGTGCAGCAACTGCTGCAACaac > 1:1435834/1‑146 (MQ=255) tGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGcc < 2:1977299/150‑1 (MQ=255) gtcgtcGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTg > 2:1945417/1‑150 (MQ=255) tcgtcgCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTgg < 2:8280528/150‑1 (MQ=255) tcgtcgCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTgg < 2:4798056/150‑1 (MQ=255) tcgtcgCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTgg < 1:5501206/150‑1 (MQ=255) gtcgCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGtt < 1:2189898/150‑1 (MQ=255) gCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTc < 2:8462468/150‑1 (MQ=255) gCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTc < 2:1011488/150‑1 (MQ=255) ccGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCAGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGGTGCCGCGCGTGTCTTGGGCATCGCTGGCGGGCGGTTGCTCCTCGGCCTTGGCTTCAAGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTcc > 1:3148718/1‑150 (MQ=255) cGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCa < 1:493342/150‑1 (MQ=255) ggTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAgc > 1:7180192/1‑150 (MQ=255) ggTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAgc < 1:1755096/150‑1 (MQ=255) ccTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGcc > 1:5149456/1‑150 (MQ=255) ccTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGcc > 1:1210163/1‑150 (MQ=255) ccTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTACACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGcc < 2:367343/150‑1 (MQ=255) cTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCt > 1:5130992/1‑150 (MQ=255) ttGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTg < 2:7722194/150‑1 (MQ=255) tGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGc < 1:3968828/150‑1 (MQ=255) gctgctGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCggg > 2:3041418/1‑150 (MQ=255) tgctgGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCt > 2:6123350/1‑150 (MQ=255) gctgGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTg > 1:8746851/1‑150 (MQ=255) gctgGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTg < 1:375756/150‑1 (MQ=255) gctgGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCCCGACCTGCAGGCCGCGCTg < 2:3515142/150‑1 (MQ=255) gctgGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCCCGACCTGCAGGCCGCGCTg < 2:889667/150‑1 (MQ=255) ctgGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGa < 1:6087102/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGc < 2:2476221/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGc > 1:4078367/1‑150 (MQ=255) gAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGAGCGTCAGCCCGACCTGCAGGCCGCGCTggacaacc < 1:1119553/150‑8 (MQ=37) gctgctGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAg > 2:6963104/1‑150 (MQ=255) tgTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCtt > 2:1222284/1‑150 (MQ=255) gTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTg > 2:8074690/1‑150 (MQ=255) ttGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGc > 1:7647760/1‑150 (MQ=255) ttGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGc > 2:7500468/1‑150 (MQ=255) gCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTc > 1:8105946/1‑150 (MQ=255) ccTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCg > 1:5938389/1‑150 (MQ=255) ttCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTa > 1:4445852/1‑150 (MQ=255) ttCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTa > 1:8486356/1‑150 (MQ=255) ttCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTa > 1:7782200/1‑150 (MQ=255) ttCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTa < 1:3461553/150‑1 (MQ=255) tCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAg < 1:197905/150‑1 (MQ=255) tCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAg < 1:7464945/150‑1 (MQ=255) gTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCa > 1:7016510/1‑150 (MQ=255) gCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCtt > 2:6460076/1‑150 (MQ=255) gtCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAg > 2:4930718/1‑150 (MQ=255) tCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGc > 2:7097938/1‑150 (MQ=255) tCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGc > 2:4276702/1‑150 (MQ=255) ttGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTc < 2:2530379/150‑1 (MQ=255) ttGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTc > 2:7229515/1‑150 (MQ=255) ttGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTc > 2:7142020/1‑150 (MQ=255) gggCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGc < 1:2956411/150‑1 (MQ=255) ggCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGcc > 1:7421769/1‑150 (MQ=255) ggCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGcc > 1:4619388/1‑150 (MQ=255) ggCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGcc > 1:163773/1‑150 (MQ=255) gCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCa > 1:8761118/1‑150 (MQ=255) cATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCAc > 2:6741830/1‑150 (MQ=255) cGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGc > 2:5109/1‑150 (MQ=255) gCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCg > 1:1567071/1‑150 (MQ=255) ccGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGcc > 2:4739398/1‑150 (MQ=255) gggCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAg > 2:5310518/1‑150 (MQ=255) gggCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAg > 2:5380549/1‑150 (MQ=255) ggCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAgg < 2:1892352/150‑1 (MQ=255) ggCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAgg < 2:6594378/150‑1 (MQ=255) ggTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAACTCGCCACTGCGGGCCAGGGCa < 2:7697993/150‑1 (MQ=255) cTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTc < 2:4074957/149‑1 (MQ=255) cTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCg > 2:3372016/1‑150 (MQ=255) ggCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGAtt < 1:4752038/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGt > 2:4177827/1‑150 (MQ=255) cTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTa < 2:1562669/150‑1 (MQ=255) ttGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAg > 1:5673273/1‑150 (MQ=255) ggCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTg < 1:5871428/150‑1 (MQ=255) ttCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGgc > 2:788015/1‑150 (MQ=255) ttCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGgc > 1:6667805/1‑150 (MQ=255) tCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGgct < 2:6250251/150‑1 (MQ=255) ctggtgCAGCAACTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCtgctgc > 1:4041712/5‑150 (MQ=255) tgttgCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGACATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCa < 1:6918808/150‑1 (MQ=255) tggtgCAGCAACTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCa > 1:8289590/4‑150 (MQ=255) tggtgCAGCAACTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCa > 1:2439813/4‑150 (MQ=255) gttgCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAg > 1:4311005/1‑150 (MQ=255) gttgCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAg > 2:8173251/1‑150 (MQ=255) gtgCAGCAACTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAgt > 2:2657416/2‑150 (MQ=255) gcagcaGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCTGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCTGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAgtgt > 1:2784623/1‑150 (MQ=255) agcagTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGTCg > 1:7615479/1‑150 (MQ=255) agcagTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGTCg > 1:3172789/1‑150 (MQ=255) gcagTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGTCGc < 1:65850/150‑1 (MQ=255) gcagTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGTCGc < 1:8276590/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGTCGCCtt > 2:5240633/1‑150 (MQ=255) | TTCGGGGCTGGCCTGTTGGTCGTCGCCGGGTGTGCCTTGGGCCGGGCTGCTGGCCGAGCTGCTGTTGCCTTCGGTTTCGCTGCCGGGCGTGTCTTGGGCATCGCTGCCGGGCGGTTGTTCCTCGGCCTTGGCTTCACGTTGTTGCAGCAGTTGCTGCACCAGCGCCTGGTTGTCCAGCGCGGCCTGCAGGTCGGGCTGACGCTCCAGGGCTTGCTCGTAGGCATCCAGGGCGGCTTCCAGCTCGCCACTGCGGGCCAGGGCATTGCCTCGATTGTAGTGGGCTGCTGCAGTGTCGCCTT > NC_002947/2310055‑2310353 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |