| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,319,678 | G→T | 5.5% | L147M (CTG→ATG) ‡ | PP_2036 ← | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,319,678 | 0 | G | T | 5.5% | 1209.7 / 39.2 | 358 | L147M (CTG→ATG) ‡ | PP_2036 | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (179/159); new base T (18/2); total (197/161) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.99e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 362 total aligned reads displayed.
GGTCAGCGGGTTGCAACCGTTGTAGAACGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGG > NC_002947/2319529‑2319824 | ggTCAGCGGGTTGCAACCGTTGTAGAACGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAg > 2:391886/1‑150 (MQ=255) tCAGCGGGTTGCAACCGTTGTAGAACGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGt > 1:8639679/1‑150 (MQ=255) tCAGCGGGTTGCAACCGTTGTAGAACGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGt < 1:1878978/150‑1 (MQ=255) tCAGCGGGTTGCAACCGTTGTAGAACGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGt > 2:2530537/1‑150 (MQ=255) aGCGGGTTGCAACCGTTGTAGAACGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCg > 1:527727/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTGCAACCGTTGTAGAACGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCgg < 1:939068/150‑1 (MQ=255) cGGGTTGCAACCGTTGTAGAACGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGt < 1:2636424/150‑1 (MQ=255) cGGGTTGCAACCGTTGTAGAACGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGt < 1:3536149/150‑1 (MQ=255) gggTTGCAACCGTTGTAGAACGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTg > 1:7382961/1‑150 (MQ=255) ggTTGCAACCGTTGTAGAACGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGc < 2:514775/150‑1 (MQ=255) gCAACCGTTGTAGAACGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCt > 2:1391511/1‑150 (MQ=255) cAACCGTTGTAGAACGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCGGCACCGACCTGTCGGTGGAGCTg < 1:6307085/150‑1 (MQ=255) ttGTAGAACGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGccc > 1:823662/1‑150 (MQ=255) tGTAGAACGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCg < 1:5156924/150‑1 (MQ=255) gTAGAACGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCgg < 1:5552071/150‑1 (MQ=255) tAGAACGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGAGGTGCTTGCGCTGGATGTCAACGGTGCTTTCGTTGACGATGGTCACCTTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCtgg < 2:6915431/150‑1 (MQ=255) aGAACGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGgt < 2:8375970/150‑1 (MQ=255) gAACGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGgtt < 2:3093045/150‑1 (MQ=255) aaCGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGgttg > 1:7830997/1‑150 (MQ=255) aaCGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGgttg > 1:7437510/1‑150 (MQ=255) cGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGgttgtt < 1:3373621/150‑1 (MQ=255) cGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGgttgtt < 1:54205/150‑1 (MQ=255) cGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGgttgtt < 1:7159410/150‑1 (MQ=255) ccTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTaga < 2:4252464/150‑1 (MQ=255) cTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAg > 1:3248309/1‑117 (MQ=255) gCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCa < 2:3752145/150‑1 (MQ=255) ccATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGgt < 2:8221319/136‑1 (MQ=255) ccATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATg > 2:7900761/1‑150 (MQ=255) aTCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGAt > 1:2176743/1‑150 (MQ=255) tAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGaa > 2:8055197/1‑150 (MQ=255) tAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGaa > 2:3592045/1‑150 (MQ=255) cgCCGTGCACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGAGACGCAGGATCAGCTCCCCCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGGTCGGAAt < 2:5795380/149‑1 (MQ=255) gTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCg < 2:174114/150‑1 (MQ=255) gTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCg < 2:5193198/150‑1 (MQ=255) gAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGAt < 1:5073944/150‑1 (MQ=255) aGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATggcg < 2:468372/150‑1 (MQ=255) ggCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATggcgg > 1:5769566/1‑150 (MQ=255) gCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGGTGTTGTAGAGCATGATCGGACTGTCGATggcggc > 2:717985/1‑150 (MQ=255) cGGTGCATGCGCTGGATGTCTCCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGgcggcg < 2:5411854/150‑1 (MQ=255) gTGCATGCGCGGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGcc < 2:1606539/150‑1 (MQ=255) aTGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGAcc > 1:4970487/1‑150 (MQ=255) aTGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGAcc > 2:3035042/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGc < 1:8573825/150‑1 (MQ=255) cTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCtt < 1:1679817/150‑1 (MQ=255) gATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTa < 1:7202533/150‑1 (MQ=255) gATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTa > 2:7424834/1‑150 (MQ=255) gATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTGGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTa > 2:3379855/1‑150 (MQ=255) gTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTg < 1:1779682/150‑1 (MQ=255) tCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTgg < 1:3703368/150‑1 (MQ=255) aCCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGc < 1:2143061/150‑1 (MQ=255) cGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTg < 1:2737428/140‑1 (MQ=255) cGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGa < 1:7623070/150‑1 (MQ=255) cGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGa < 2:1479798/150‑1 (MQ=255) cGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGa > 2:2323175/1‑150 (MQ=255) tttCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCActt > 1:8414310/1‑150 (MQ=255) tttCCTTGACCATGCTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGAGCGGACTGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCGTGTAGTGGGCGACCActt > 2:4426271/1‑150 (MQ=255) ttCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCActtc > 2:7541760/1‑150 (MQ=255) ttCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCActtc < 2:1909680/150‑1 (MQ=255) tCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCActtcg < 2:2037022/150‑1 (MQ=255) ttGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCActtcggct > 1:8074411/1‑150 (MQ=255) ttGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCActtcggct > 1:883615/1‑150 (MQ=255) aCCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCActtcggcttcg < 2:2376756/150‑1 (MQ=255) aCCATGGTCACATGGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCActtcggcttcg < 1:1254721/150‑1 (MQ=255) cATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGt > 2:6591102/1‑150 (MQ=255) aTGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTg > 2:5065513/1‑150 (MQ=255) aTGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTg > 2:8640936/1‑150 (MQ=255) tGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTGGGTGTAGGGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTGCGGCTTCGGTGa > 1:4064061/1‑150 (MQ=255) tCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCt > 2:7922909/1‑150 (MQ=255) caTTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTcc > 1:255138/1‑150 (MQ=255) aTTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCa > 1:6781950/1‑150 (MQ=255) aTTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCa < 2:6164026/150‑1 (MQ=255) tGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGt < 2:2261547/150‑1 (MQ=255) ggCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTaa < 2:872858/150‑1 (MQ=255) ggCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTaa < 1:880931/150‑1 (MQ=255) aCCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAagag > 2:2845381/1‑150 (MQ=255) cGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGgca < 2:6372850/150‑1 (MQ=255) gAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGgcag > 1:321018/1‑150 (MQ=255) ggATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGgcagca < 1:1082996/150‑1 (MQ=255) ggATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGgcagca < 1:7573118/150‑1 (MQ=255) aTACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCAcc < 2:4028053/150‑1 (MQ=255) aCGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCAt < 2:4936796/150‑1 (MQ=255) cGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATc < 1:8170030/150‑1 (MQ=255) gCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCa > 2:1119119/1‑150 (MQ=255) gCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCa > 1:4837180/1‑150 (MQ=255) gCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCa > 1:5569448/1‑150 (MQ=255) gCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCa < 1:3004227/150‑1 (MQ=255) gCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCa > 1:6371498/1‑150 (MQ=255) cAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCAGCTGGTGCCCGGGGTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTAGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGAAGCACCATCAc > 1:6423313/1‑150 (MQ=255) gATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCAccgc > 2:5724001/1‑150 (MQ=255) cagcggcACCGACCTGTCGGTGGAGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGt > 2:6241491/7‑150 (MQ=255) cagcggcACCGACCTGTCGGTGGAGCTGGTG‑CCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTa > 2:3228886/7‑150 (MQ=255) agcggcACCGACCTGTCGGTGGAGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTa > 2:5629483/6‑150 (MQ=255) aGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTa < 1:4548175/150‑1 (MQ=255) gcggcACCGACCTGTCGGTGGAGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAg > 1:7999016/5‑150 (MQ=255) gCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAg > 1:4175165/1‑150 (MQ=255) cTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATgg < 2:922738/128‑1 (MQ=255) cTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGc > 1:3412616/1‑150 (MQ=255) cACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCAcc > 1:6111015/1‑150 (MQ=255) cACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCAcc < 1:2948073/150‑1 (MQ=255) cGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCa > 1:7019059/1‑150 (MQ=255) | GGTCAGCGGGTTGCAACCGTTGTAGAACGCCACCTGCCCATCTGTAGCCGTGAACAGGCGGTGCATGCGCTGGATGTCACCGGTGCTTTCCTTGACCATGGTCACATTGGGCACCTCGCCGAGGATACGCAGGATCAGCTCCACCGACAGGTCGGTGCCGCTGGTGCCCGGGTTGTTGTAGAGCATGATCGGAATGTCGATGGCGGCGCCGACCGCCTTGTAGTGGGCGACCACTTCGGCTTCGGTGAGCTTCCAGTAAGAGATGGGCAGCACCATCACCGCCGTAGCACCGCAGG > NC_002947/2319529‑2319824 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |