| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 2,321,030 | 0 | A | T | 6.3% | 1049.4 / 36.8 | 321 | intergenic (‑87/‑159) | PP_2037/PP_2038 | aldolase/long‑chain‑fatty‑acid‑‑CoA ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (162/138); new base T (8/13); total (170/151) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.80e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 324 total aligned reads displayed.
AGCATCTGTTGCTGGGCGAGTTTGACAAGCTGGTCCTTGGGGGTGTGCATGGTGGTCGTCATAGGCGGTACCTGCAGGGGGTTGAGACTAGGAATGGCTGATCGGCGTGGAGGCGACGCCAGGACACGGCGTTGATCATAATGACACAAAGTGTCATATGCAAGCGATGTGTCATCCTTGCCTCAGGGCGTCAACCCATCAGTGCCAGCGCAATCTGTTATGGCGTGCATACGCAACTGGTATTACTTGCCCCGGCTTCACGCTGTTTAGCATCGATCGGGTCTTAACCGTCGACGA > NC_002947/2320882‑2321178 | aTCTGTTGCTGGGCGAGTTTGACAAGCTGGTCCTTGGGGGTGTGCATGGTGGTCGTCATAGGCGGTACCTGCAGGGGGTTGAGACTAGGAATGGCTGATCGGCGTGGAGGCGACGCCAGGACACGGCGTTGATCATAATGACACAAAgtg < 1:8352373/150‑1 (MQ=255) tCTGTTGCTGGGCGAGTTTGACAAGCTGGTCCTTGGGGGTGTGCATGGTGGTCGTCATAGGCGGTACCTGCAGGGGGTTGAGACTAGGAATGGCTGATCGGCGTGGAGGCGACGCCAGGACACGGCGTTGATCATAATGACACAAAgtgt > 2:2499581/1‑150 (MQ=255) cTGTTGCTGGGCGAGTTTGACAAGCTGGTCCTTGGGGGTGTGCATGGTGGTCGTCATAGGCGGTACCTGCAGGGGGTTGAGACTAGGAATGGCTGATCGGCGTGGAGGCGACGCCAGGACACGGCGTTGATCATAATGACACAAAGTGTc < 1:1568757/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |