| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,386,394 | T→G | 8.3% | intergenic (+31/+56) | oprF → / ← cobA | porin F/uroporphyrinogen‑III C‑methyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,386,394 | 0 | T | G | 8.3% | 813.1 / 50.5 | 274 | intergenic (+31/+56) | oprF/cobA | porin F/uroporphyrinogen‑III C‑methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (119/131); new base G (14/9); total (134/140) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.17e-01 | |||||||||||
Only 100 of 276 total aligned reads displayed.
CAGCCGTGTTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGCAAACCAAACGCCCGC > NC_002947/2386246‑2386543 | aGCCGTGTTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCg > 2:6548753/1‑150 (MQ=255) aGCCGTGTTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCg > 2:7679125/1‑150 (MQ=255) cGTGTTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGcc < 2:258493/150‑1 (MQ=255) tgtTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCgg < 2:4703476/150‑1 (MQ=255) gtTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCggg < 2:2111534/150‑1 (MQ=255) gtTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCGAGGCCggg < 1:103033/150‑1 (MQ=255) ttGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCGAGGCCGGGt < 2:5571568/150‑1 (MQ=255) gACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGttt < 1:7766794/150‑1 (MQ=255) gACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCGAGGCCGGGttt < 2:6917334/150‑1 (MQ=255) aCTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGtttt > 1:7541140/1‑150 (MQ=255) tCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTc < 1:1233603/150‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCt < 1:4421113/150‑1 (MQ=255) ggTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCGAGGCCGGGTATTTcat < 2:6462143/150‑3 (MQ=255) gTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCttt < 1:6404344/150‑1 (MQ=255) gTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCttt > 2:1747430/1‑150 (MQ=255) gTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCGAGGCCGGGTTTTTcatg < 2:4628839/150‑4 (MQ=255) tACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTgg < 1:6750170/150‑1 (MQ=255) tACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTgg < 1:740703/150‑1 (MQ=255) tACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTgg > 2:6062411/1‑150 (MQ=255) tACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTgg > 1:3514031/1‑150 (MQ=255) tACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGGTTTTCTTTGCCTgg > 2:6264808/1‑150 (MQ=255) aCGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTggg < 2:1254576/150‑1 (MQ=255) gCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTTCCTGGGttt < 1:5642220/150‑1 (MQ=255) gAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTa > 1:6226152/1‑150 (MQ=255) gAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTa < 2:8685100/150‑1 (MQ=255) gAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTa < 1:2950943/150‑1 (MQ=255) aCCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGCTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTACGTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAAcc < 1:1865831/150‑1 (MQ=255) cccGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCg < 1:2392332/150‑1 (MQ=255) ccGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCgg > 2:3745307/1‑150 (MQ=255) ccGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCgg < 2:2286050/150‑1 (MQ=255) cGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGc < 2:4238346/150‑1 (MQ=255) atCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTTATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGcc > 2:6680534/2‑150 (MQ=255) ttGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAg < 1:5286054/150‑1 (MQ=255) cAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTc < 2:6886103/150‑1 (MQ=255) aaCGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTcc > 1:1386/1‑150 (MQ=255) cGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTg < 2:1682672/150‑1 (MQ=255) ccACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCg < 1:8520485/150‑1 (MQ=255) aCCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGt < 2:4889159/150‑1 (MQ=255) cGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCa < 1:4463528/150‑1 (MQ=255) aagaagGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGc > 2:4143424/1‑150 (MQ=255) agGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCtgc < 1:3681232/150‑1 (MQ=255) ggCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCtgcg > 1:184116/1‑150 (MQ=255) tGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCtgcgattgcgat < 1:8317853/150‑1 (MQ=255) gacAACCGGCCCGATGAAGCACAGGGAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTAGAAGCTACATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTACTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCAGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATc < 2:3307214/148‑1 (MQ=255) aCCTTCGCTTTTATGCTAAGTTAGAAGCCATGGCAATTTAATTGTTTTTAAGCTTAATTAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGcc < 1:2613295/150‑1 (MQ=255) aCCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGcc < 2:7039910/150‑1 (MQ=255) aCCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGcc < 1:4129051/150‑1 (MQ=255) aCCGTCGCGTAGAAGCTCAGGTACAAGCCCACGCCAACTAATTCCTATGAAGCTTCATGAAAAACCCCGCCTCGGCCGGGTTTTTCATTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGcc < 2:8396606/150‑1 (MQ=255) ccGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGccc < 1:3556696/150‑1 (MQ=255) cGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAATCCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTGTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGcccc > 2:5349121/1‑150 (MQ=255) cgTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGc < 2:2022933/150‑1 (MQ=255) gTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGcc > 1:3882006/1‑150 (MQ=255) ttGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCct > 1:1123042/1‑150 (MQ=255) gAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCctgc < 2:7811988/150‑1 (MQ=255) gCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCtgctgc > 2:3913210/1‑150 (MQ=255) tCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCtgcgatt < 1:6875903/124‑1 (MQ=255) tCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCAGCTGCTc > 1:4643958/1‑150 (MQ=255) ggTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTcccc < 1:6899703/150‑1 (MQ=255) gTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCa > 1:6711734/1‑150 (MQ=255) aGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAaccac < 2:1806255/150‑1 (MQ=255) cccAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCt > 1:8775840/1‑150 (MQ=255) cccAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCt > 1:7136327/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTc > 2:4391565/1‑150 (MQ=255) cAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTcc < 1:8496062/150‑1 (MQ=255) ggCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTcccc < 2:2833809/150‑1 (MQ=255) ccAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCaa < 2:7213371/150‑1 (MQ=255) cAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAAt > 1:5458712/1‑150 (MQ=255) cAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCACCCCaag > 1:6510456/1‑149 (MQ=255) aGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCa < 2:2991363/150‑1 (MQ=255) aaTTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCa < 2:3217638/150‑1 (MQ=255) aaTTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCa < 2:1773717/150‑1 (MQ=255) aaTTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCa > 1:3257708/1‑150 (MQ=255) aaTTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCa < 1:8054065/150‑1 (MQ=255) aTTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTGTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAg > 1:5953458/1‑150 (MQ=255) aTTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAg > 2:8737488/1‑150 (MQ=255) ttGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAgg > 2:4008440/1‑150 (MQ=255) tGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGa < 1:7843942/150‑1 (MQ=255) tGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCACGa > 1:4804814/1‑150 (MQ=255) gTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGAtt > 1:2941534/1‑150 (MQ=255) tttGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCACCCACCTCCCCAAACACCAGGATTg > 2:8509957/1‑150 (MQ=255) tGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGcc < 2:1446109/150‑1 (MQ=255) tGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGcc < 1:863055/150‑1 (MQ=255) aaGCTTCATGCAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCAGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCgg < 1:7055777/150‑1 (MQ=255) aGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCTCCAGGATTGCCggg < 1:6548753/150‑1 (MQ=255) tCATGAAAAACCCGGTCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTAc > 2:8292555/1‑150 (MQ=255) cATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACg > 2:798293/1‑150 (MQ=255) cATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACg > 2:7369904/1‑150 (MQ=255) aaagAAAAACCCGGCCGAGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACg > 1:3745393/4‑150 (MQ=255) aTGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGc > 2:1307604/1‑150 (MQ=255) tGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCAGCTGCTCCCCAACCACCACCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGca > 2:3434953/1‑150 (MQ=255) gAAAAACCCGGCCGAGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaa > 1:792291/1‑150 (MQ=255) aaaaCCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGATGCTCCCAAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaac > 2:117597/1‑150 (MQ=255) aaaaCCCGGCCGAGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaac > 2:2422955/1‑150 (MQ=255) aCCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGCTTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcacaccaa > 1:982125/1‑150 (MQ=255) ccGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaaccaaac < 1:6062411/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaaccaaac > 2:1731323/1‑150 (MQ=255) ccGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaaccaaac < 2:6792188/150‑1 (MQ=255) ccGGCCGAGGCCGGGTTTTTCATTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATCGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGcaaaccaaac > 1:4631766/1‑150 (MQ=255) cGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGCAAACCAAACg > 2:5518629/1‑150 (MQ=255) ggCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGCAAACCAAACGc > 1:7261293/1‑150 (MQ=255) | CAGCCGTGTTGACTCGGTTGGCTACGGCGAAACCCGTCCGGTTGCTGACAACGCCACCGAAGAAGGCCGTGCTGTCAACCGTCGCGTTGAAGCTCAGGTAGAAGCCCAGGCCAAGTAATTGGTTTGAAGCTTCATGAAAAACCCGGCCTCGGCCGGGTTTTTCTTTGCCTGGGTTTTAACCGGCCCTGAAGGCCGCTCCTGCGGTCAGCCTGCGATTGCGATCCGCCCCATAGCCTGCTGCTCCCCAACCACCTCCCCAATCACCAGGATTGCCGGGCTACGCAAACCAAACGCCCGC > NC_002947/2386246‑2386543 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |