Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,545,802 | G→C | 7.0% | intergenic (+23/+26) | PP_2232 → / ← PP_2233 | XRE family transcriptional regulator/isochorismatase family hydrolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,545,802 | 0 | G | C | 7.0% | 903.5 / 43.1 | 271 | intergenic (+23/+26) | PP_2232/PP_2233 | XRE family transcriptional regulator/isochorismatase family hydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (140/112); new base C (14/5); total (154/117) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.53e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.35e-01 |
Only 100 of 296 total aligned reads displayed.
ATCATCGAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAGTGGCAGGGTC > NC_002947/2545654‑2545951 | atcatcGAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCtgt > 1:7942042/1‑150 (MQ=255) tcatcGAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCtgtg < 1:4293327/150‑1 (MQ=255) catcGAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGc < 1:3462542/150‑1 (MQ=255) atcGAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCa < 2:2586986/150‑1 (MQ=255) tcGAAGAGGCCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAg > 2:6892693/1‑150 (MQ=255) aaGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGccc > 2:1075046/1‑150 (MQ=255) agagGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCACAGCAGcccc < 1:8291775/150‑1 (MQ=255) agGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCaaa < 1:908815/150‑1 (MQ=255) ggTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCaaa < 2:4272584/150‑1 (MQ=255) ggTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCaaa < 1:3224706/150‑1 (MQ=255) ggTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCACAGCAGCCCCaaa < 2:6397373/150‑1 (MQ=255) ggTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGGTCCATGTGTTCCCCAGTACCTGCCGGTATGCCTACCGTACCGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAAGGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCaaa < 2:7810186/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGACCTTTGGGGCTGCACAGCAGCCCCaaa < 1:4689846/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAg > 2:7519856/1‑150 (MQ=255) gAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGtc < 1:5708467/150‑1 (MQ=255) aTCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCaa < 2:4859290/150‑1 (MQ=255) aTCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCaa > 1:4103645/1‑150 (MQ=255) aTCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCaa > 2:211330/1‑150 (MQ=255) tCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATTCCTACCGTAACGATGTCGTGGTGTCTGTTCGGTTTGTGCGAAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCACCAAAGGTCTCAAg > 1:5274944/1‑150 (MQ=255) gCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGcc > 2:667198/1‑150 (MQ=255) cTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCg > 2:676346/1‑150 (MQ=255) cTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCg > 1:2724518/1‑150 (MQ=255) tGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGAt < 2:4083821/150‑1 (MQ=255) gCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATc < 1:3140235/150‑1 (MQ=255) tGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCtt > 2:1646563/1‑150 (MQ=255) ggCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTc < 1:5495912/150‑1 (MQ=255) ggCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTc < 2:8123854/150‑1 (MQ=255) ggCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTc < 2:6607848/150‑1 (MQ=255) gCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTca < 2:2634592/150‑1 (MQ=255) gCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTca < 1:6877809/150‑1 (MQ=255) ccATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCt > 1:8239290/1‑150 (MQ=255) ccATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCt > 2:3432890/1‑150 (MQ=255) ccATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCt > 2:1241956/1‑150 (MQ=255) aTGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCtcg > 2:386249/1‑150 (MQ=255) tgtgTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCtcgt > 2:6808121/1‑150 (MQ=255) gtgtTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGACTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCtcgtc < 2:8441037/150‑1 (MQ=255) tgtTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCtcgtcg > 1:6272595/1‑150 (MQ=255) tgtTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCtcgtcg < 1:2159192/150‑1 (MQ=255) ttCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGt > 1:759427/1‑150 (MQ=255) cccAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTCACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAATGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCtt < 1:8517036/150‑1 (MQ=255) cccAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCtt > 2:7014547/1‑150 (MQ=255) ccAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTc > 1:8024800/1‑150 (MQ=255) ccAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCAATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTc > 1:2601059/1‑150 (MQ=255) 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tGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACAtt > 2:5312754/1‑150 (MQ=255) tGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACAtt > 2:8752726/1‑150 (MQ=255) tGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACAtt > 1:1073535/1‑150 (MQ=255) tGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACAtt > 1:1482833/1‑150 (MQ=255) ggTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCa < 2:3700179/150‑1 (MQ=255) 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tGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTc > 1:1699553/1‑150 (MQ=255) tGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTc > 2:2394036/1‑150 (MQ=255) tGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTc > 1:2516961/1‑150 (MQ=255) gCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCg > 2:2455324/1‑150 (MQ=255) gCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCg > 2:4305426/1‑150 (MQ=255) cAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGa > 2:3468368/1‑150 (MQ=255) cTTTGGGGCTGCACAGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGc > 1:3289732/1‑150 (MQ=255) tttGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGcc > 2:7967572/1‑150 (MQ=255) tttGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGcc > 1:612851/1‑150 (MQ=255) tttGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGcc > 1:3690783/1‑150 (MQ=255) tttGGGGCTGCACAGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGcc > 2:3105733/1‑150 (MQ=255) tGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAg < 1:7439789/150‑1 (MQ=255) ggggCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGTCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAGt > 1:4922061/1‑150 (MQ=255) gctgctGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGc > 2:2186614/1‑108 (MQ=255) gctgctGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAGTGGc < 1:5540981/150‑1 (MQ=255) tgctgTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAGTGGCAg > 2:7103296/1‑150 (MQ=255) gctgTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAGTGGCAgg < 1:667198/150‑1 (MQ=255) ctgTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAGTGGCAggg > 2:138526/1‑150 (MQ=255) tgtgCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAGTGGCAGGGt > 2:604066/1‑150 (MQ=255) gtgCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAGTGGCAGGGTc > 1:7284981/1‑150 (MQ=255) | ATCATCGAAGAGGTCGAGCATCGCTTGCAGGTGGGGCAGTTCCATGTGTTCCCCAGTAACTGCCGGTATGCCTACCGTAACGATGGCGTGGTGGCTGTTCGGTTTGTGCGCAATGTGGCGATTTGAGCCTGCAGA‑CTTTGGGGCTGCTGTGCAGCCCCAAAGGTCTCAAGCCGATCAGCTTTTCAGCAGCTCGTCGGTCTTCACCACATTGGCATAGGCAAACGCCAACGCCGCCATCGCCGAATCATGCACATGAGCCGCCGGCACCTGCTTGCCGTCGAACGCCAGTGGCAGGGTC > NC_002947/2545654‑2545951 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |