Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 2,589,975 | A→C | 6.3% | V171G (GTT→GGT) | folD‑II ← | bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 2,589,975 | 0 | A | C | 6.3% | 818.1 / 2.2 | 296 | V171G (GTT→GGT) | folD‑II | bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (155/111); new base C (2/27); total (157/139) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.34e-08 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 301 total aligned reads displayed.
CCCACTCACCCTTGACCAGGCCCGGCTTGCCGGCAGCCACGACCACCAGGTCGGCACGCCCGACGTGGCCGGCCAGGTCCTTGGTGAAGCGGTGGCAGACGGTCACGGTGCAGCCGGCCAGCAGCAGTTCCATGGCCATCGGGCGGCCAACGATGTTGGACGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTGGGCCAGGCGGCCGATGTTGTACGGGTGGAAGCC > NC_002947/2589826‑2590123 | cccACTCACCCTTGACCAGGCCCGGCTTGCCGGCAGCCACGACCACCAGGTCGGCACGCCCGACGTGGCCGGCCAGGTCCTTGGTGAAGCGGTGGCAGACGGTCACGGTGCAGCCGGCCAGCAGCAGTTCCATGGCCATCGGGCGGCCaa > 2:1714543/1‑150 (MQ=255) ccACTCACCCTTGACCAGGCCCGGCTTGCCGGCAGCCACGACCACCAGGTCGGCACGCCCGACGTGGCCGGCCAGGTCCTTGGTGAAGCGGTGGCAGACGGTCACGGTGCAGCCGGCCCGCAGCAGTTCCATGGCCATCGGGCGGCCAAc > 1:6089421/1‑150 (MQ=255) ccACTCACCCTTGACCAGGCCCGGCTTGCCGGCAGCCACGACCACCAGGTCGGCACGCCCGACGTGGCCGGCCAGGTCCTTGGTGAAGCGGTGGCAGACGGTCACGGTGCAGCCGGCCAGCAGCAGTTCCATGGCCATCGGGCGGCCAAc > 2:8039070/1‑150 (MQ=255) ccACTCACCCTTGACCAGGCCCGGCTTGCCGGCAGCCACGACCACCAGGTCGGCACGCCCGACGTGGCCGGCCAGGTCCTTGGTGAAGCGGTGGCAGACGGTCACGGTGCAGCCGGCCAGCAGCAGTTCCATGGCCATCGGGCGGCCAAc > 1:4225843/1‑150 (MQ=255) aCTCACCCTTGACCAGGCCCGGCTTGCCGGCAGCCACGACCACCAGGTCGGCACGCCCGACGTGGCCGGCCAGGTCCTTGGTGAAGCGGTGGCAGACGGTCACGGTGCAGCCGGCCAGCAGCAGTTCCATGGCCATCGGGCGGCCAACGa > 2:2371161/1‑150 (MQ=255) cTCACCCTTGACCAGGCCCGGCTTGCCGGCAGCCACGACCACCAGGTCGGCACGCCCGACGTGGCCGGCCAGGTCCTTGGTGAAGCGGTGGCAGACGGTCACGGTGCAGCCGGCCAGCAGCAGTTCCATGGCCATCGGGCGGCCAAcatc < 2:74298/150‑4 (MQ=255) cTCACCCTTGACCAGGCCCGGCTTGCCGGCAGCCACGACCACCAGGTCGGCACGCCCGACGTGGCCGGCCAGGTCCTTGGTGAAGCGGTGGCAGACGGTCACGGTGCAGCCGGCCAGCAGCAGTTCCATGGCCATCGGGCGGCCAACGAt < 2:3213334/150‑1 (MQ=255) cTCACCCTTGACCAGGCCCGGCTTGCCGGCAGCCACGACCACCAGGTCGGCACGCCCGACGTGGCCGGCCAGGTCCTTGGTGAAGCGGTGGCAGACGGTCACGGTGCAGCCGGCCAGCAGCAGTTCCATGGCCATCGGGCGGCCAACGAt > 1:5243435/1‑150 (MQ=255) 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ccATGGCCATCGGGCGGCCAACGATGTTGGACGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCGCGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTGGGCCAGGCGGCCGa > 2:2772033/1‑150 (MQ=255) cATGGCCATCGGGCGGCCAACGATGTTGGACGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTGGGCCAGGCGGCCGAt > 1:1542222/1‑150 (MQ=255) aTGGCCATCGGGCGGCCAACGATGTTGGACGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTGGGCCAGGCGGCCGAtg > 2:7290285/1‑150 (MQ=255) gggCCAGCGGGCGGCCAACGTTGTTGGACGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTGGGCCAGGCGGCCGAtgt < 2:5324599/149‑1 (MQ=255) ggCCATGGGGCGGCCAACGATGTTGGACGCGCCGACGATCACCGCGTTCATGCCGTACAGGTCCTGGCCGGTGCTTTCCAGCAGGGTCATGATGCCTTTCGGTGTGCACGGGCGCAGCAGTGGAATACGCTGGGCCAGGCGGCCGAtgtt < 1:8039070/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |