| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | 4591116 = | 105 (0.350) | intergenic (+206/+11) | PP_4061/PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase | |||||
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| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
GGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCG‑TGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTT‑TACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGC > NC_002947/4590977‑4591264 | gggTCCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGAGCGGGCCGGCCGCTGAGCGGGTAAACACCCACCGAACAGCGACAG‑TGCAGGCCGTTAAAGCCGCGCAGGCCCACGTAGGAGCGGGGT‑TGACAGCCGAGGGGCCGGCCGCGGCCGcac > 2:3644407/1‑149 (MQ=255) cTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAACCGCTACGAACACGGACCC‑TGCCGGCCTTGAATTCGGCGCTGCCCCGGGGAGGAGCGGGTT‑TACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCCGCACATCaa > 2:3541844/1‑149 (MQ=38) ccctctCGGGGGTAAACCCCCCCCCACCCGGGCCCGCCGCCGGCCTCCAGGGCGCCGCCCCCCCTGGTCGG‑CCGGTTTACACCCGCCACGCGCCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGAt < 2:6211560/144‑1 (MQ=255) 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cccGCTCCTACCAGGGACCG‑TGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTT‑TACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACCTCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACt > 1:4811850/1‑149 (MQ=255) cccGCTCCTACCAGGGACCG‑TGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTT‑TACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACt > 1:6198091/1‑149 (MQ=255) cccGCTCCTACCAGGGACCG‑TGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTT‑TACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACt > 1:182226/1‑149 (MQ=255) cccGCTCCTACCAGGGACCG‑TGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTT‑TACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCGCACGCATGCGGAACt > 2:5270215/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCTACCAGGGACCG‑TGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTT‑TACCCGCGCAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACtt > 1:1692514/1‑149 (MQ=255) 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ccggccgCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGAt > 2:2376612/1‑149 (MQ=255) ccggccgCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGAt > 2:3751721/1‑149 (MQ=255) ccggccgCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGAt > 2:4749866/1‑149 (MQ=255) cggccgCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATg > 1:5489645/1‑149 (MQ=255) cggccgCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCATGAAGTGTGCGATg > 1:8690985/1‑149 (MQ=255) 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gcgcCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGc < 2:7600396/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGc < 1:4621894/149‑1 (MQ=255) | GGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCG‑TGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTT‑TACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATGCAGCCGCAATCTCCGCCACACTGATCTCACGCATGCGGAACTTCTGCACCTTGCCGGTCACGGTCATCGGGTACTCGTCGACAAAACGTATATACCGCGGCACCTTGAAGTGTGCGATGCGTGC > NC_002947/4590977‑4591264 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |