Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_002947	4987187	4987313	127	2 [1]	[1] 2	flgD	flagellar basal‑body rod modification protein FlgD

CGTTGCTACCCATGGTCACACTGGTAACCGAGGCCGGCAGGTTGGTGGTCATGGCCGTGGCCTTGCCATCGATCGAGGCGGTGGCCTTGAAGGTGTAGGTCCCGGCGGCCGCGACTTCACCGTCATCGTTCAGGCCATCCCAGGTAAAGTCGATGCT  >  NC_002947/4987051‑4987207                                                                                                                                        |                      cGTTGCTACCCATGGTCACACTGGTAACCGAGGCCGGCAGGTTGGTGGTCATGGCCGTGGCCTTGCCATCGATCGAGGCGGTGGCCTTGAAGGTGTAGGTCCCGGCGGCCGCGACTTCACCGTCATCGTTCAGGcc                       <  2:387848/136‑1 (MQ=255)                      tGGTAACCGAGGCCGGCAGGTTGGTGGTCATGGCCGTGGCCTTGCCATCGATCGAGGCGGTGGCCTTGAAGGTGTAGGTCCCGGCGGCCGCGACTTCACCGTCATCGTTCAGGCCATCCCAGGTAAAGTCGAtgct  >  2:423956/1‑136 (MQ=255)                                                                                                                                        |                      CGTTGCTACCCATGGTCACACTGGTAACCGAGGCCGGCAGGTTGGTGGTCATGGCCGTGGCCTTGCCATCGATCGAGGCGGTGGCCTTGAAGGTGTAGGTCCCGGCGGCCGCGACTTCACCGTCATCGTTCAGGCCATCCCAGGTAAAGTCGATGCT  >  NC_002947/4987051‑4987207

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑