| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 1431801 | NA (NA) | coding (743/1422 nt) | PP_1250 | group II intron‑encoding maturase | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
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GGCGAGAGCGGGCCGCCTTGCGGCGTCCCCTCCTGCCGTGGGCTGACGACACCGCCCGACATGATCCCGGCTTCAAGGTAGCGGCGGATAAGCCTGAGTACGCACTTGTCTCTGATCCGACGTTCGATGCAGGCCATGAGGATGTCGTGA < 2:4097986/150‑1 GGCGAGAGCGGGCCGCCTTGCGGCGTCCCCTCCTGCCGTGGGCTGACGACACCGCCCGACATGATCCCGGCTTCAAGGTAGCGGCGGATAAGCCTGAGTACGCACTTGTCTCTGATCCGACGTTCGATGCAGGCCATGAGGATGTCGTGA < 1:4382066/150‑1 GGCGAGAGCGGGCCGCCTTGCGGCGTCCCCTCCTGCCGTGGGCTGACGACACCGCCCGACATGATCCCGGCTTCAAGGTAGCGGCGGATAAGCCTGAGTACGCACTTGTCTCTGATCCGACGTTCGATGCAGGCCATGAGGATGTCGTGA < 1:4315810/150‑1 GGCGAGAGCGGGCCGCCTTGCGGCGTCCCCTCCTGCCGTGGGCTGACGACACCGCCCGACATGATCCCGGCTTCAAGGTAGCGGCGGATAAGCCTGAGTACGCACTTGTCTCTGATCCGACGTTCGATGCAGGCCATGAGGATGTCGTGA < 2:2928059/150‑1 GGCGAGAGCGGGCCGCCTTGCGGCGTCCCCTCCTGCCGTGGGCTGACGACACCGCCCGACATGATCCCGGCTTCAAGGTAGCGGCGGATAAGCCTGAGTACGCACTTGTCTCTGATCCGACGTTCGATGCAGGCCATGAGGATGTCGTGA < 1:4168374/150‑1 GCGAGAGCGGGCCGCCTTGCGGCGTCCCCTCCTGCCGTGGGCTGACGACACCGCCCGACATGATCCCGGCTTCAGGGTAGCGGCGGATAAGCCTGAGTACGCACTTGTCTCTGATCCGACGTTCGATGCAGGCCATGAGGATGTCGTGAT < 2:185370/150‑1 GCGAGAGCGGGCCGCCTTGCGGCGTCCCCTCCTGCCGTGGGCTGACGACACCGCCCGACATGATCCCGGCTTCAAGGTAGCGGCGGATAAGCCTGAGTACGCACTTGTCTCTGATCCGACGTTCGATGCAGGCCATGAGGATGTCGTGAT > 2:27252/1‑150 GCGAGAGCGGGCCGCCTTGCGGCGTCCCCTCCTGCCGTGGGCTGACGACACCGCCCGACATGATCCCGGCTTCAAGGTAGCGGCGGATAAGCCTGAGTACGCACTTGTCTCTGATCCGACGTTCGATGCAGGCCATGAGGATGTCGTGAT < 2:5392639/150‑1 GCGAGAGCGGGCCGCCTTGCGGCGTCCCCTCCTGCCGTGGGCTGACGACACCGCCCGACATGATCCCGGCTTCAAGGTAGCGGCGGATAAGCCTGAGTACGCACTTGTCTCTGATCCGACGTTCGATGCAGGCCATGAGGATGTCGTGAT > 1:2537648/1‑150 GCGAGAGCGGGCCGCCTTGCGGCGTCCCCTCCTGCCGTGGGCTGACGACACCGCCCGACATGATCCCGGCTTCAAGGTAGCGGCGGATAAGCCTGAGTACGCACTTGTCTCTGATCCGACGTTCGATGCAGGCCATGAGGATGTCGTGAT > 2:1479333/1‑150 GCGAGAGCGGGCCGCCTTGCGGCGTCCCCTCCTGCCGTGGGCTGACGACACCGCCCGACATGATCCCGGCTTCAAGGTAGCGGCGGATAAGCCTGAGTACGCACTTGTCTCTGATCCGACGTTCGATGCAGGCCATGAGGATGTCGTGAT < 1:6428529/150‑1 GCGAGAGCGGGCCGCCTTGCGGCGTCCCCTCCTGCCGTGGGCTGACGACACCGCCCGACATGATCCCGGCTTCAAGGTAGCGGCGGATAAGCCTGAGTACGCACTTGTCTCTGATCCGACGTTCGATGCAGGCCATGAGGATGTCGTGAT > 2:336782/1‑150 GCGAGAGCGGGCCGCCTTGCGGCGTCCCCTCCTGCCGTGGGCTGACGACACCGCCCGACATGATCCCGGCTTCAAGGTAGCGGCGGATAAGCCTGAGTACGCACTTGTCTCTGATCCGACGTTCGATGCAGGCCATGAGGATGTCGTGAT > 2:3439960/1‑150 GCGAGAGCGGGCCGCCTTGCGGCGTCCCCTCCTGCCGTGGGCTGACGACACCGCCCGACATGATCCCGGCTTCAAGGTAGCGGCGGAAAAGCCTGAGTACGCACTTGTCTCTGATCCGACGTTCGATGAAGGCCATGAGGATGTCGTGAT > 1:2537652/1‑150 CGAGAGCGGGCCGCCTTGCGGCGTCCCCTCCTGCCGTGGGCTGACGACACCGCCCGACATGATCCCGGCTTCAAGGTAGCGGCGGATAAGCCTGAGTACGCACTTGTCTCTGATCCGACGTTCGATGCAGGCCATGAGGATGTCGTGATT < 1:3243816/150‑1 CGAGAGCGGGCCGCCTTGCGGCGTCCCCTCCTGCCGTGGGCTGACGACACCGCCCGACATGATCCCGGCTTCAAGGTAGCGGCGGATAAGCCTGAGTACGCACTTGTCTCTGATCCGACGTTCGATGCAGGCCATGAGGATGTCGTGATT < 2:2661898/150‑1 CGAGAGCGGGCCGCCTTGCGGCGTCCCCTCCTGCCGTGGGCTGACGACACCGCCCGACATGATCCCGGCTTCAAGGTAGCGGCGGATAAGCCTGAGTACGCACTTGTCTCTGATCCGACGTTCGATGCAGGCCATGAGGATGTCGTGATT < 2:1512182/150‑1 CGAGAGCGGGCCGCCTTGCGGCGTCCCCTCCTGCCGTGGGCTGACGACACCGCCCGACATGATCCCGGCTTCAAGGTAGCGGCGGATAAGCCTGAGTACGCACTTGTCTCTGATCCGACGTTCGATGCAGGCCATGAGGATGTCGTGATT < 2:1232910/150‑1 GTGGAACTCGATCTGGAGAAGTTTTTCGATCGGGTCAATCACGACATCCTCATGGCCTGCATCGAACGTCGGATCAGAGACAAGTGCGTACTCAGGCTTATCCGCCGCTACCTTGAAGCCGGGATCATGTCGGGCGGTGTCGTCAGCCC‑ACGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/1431617‑1431770‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acggcGAGAGCGGGCCGCCTTGCGGCGTCCCCTCCTGCCGTGGGCTGACGACACCGCCCGACATGATCCCGGCTTCAAGGTAGCGGCGGATAAGCCTGAGTACGCACTTGTCTCTGATCCGACGTTCGATGCAGGCCATGAGGATGTCGTGATT < NC_002947/1431801‑1431653 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |