| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2417935 = | 211 (0.720) | 33 (0.120) +AGGG |
7/266 | NT | 12.8% | intergenic (+207/‑214) | rlmM/PP_2114 | 23S rRNA (cytidine(2498)‑2'‑O)‑methyltransferase RlmM/transposase |
| ? | NC_002947 | 4027275 = | 252 (0.860) | coding (24/942 nt) | PP_3547 | NAD(P)‑binding oxidoreductase | |||||
CCCTTACGGCGGGTCACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGCGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/2418038‑2417935‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGC‑GGAGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCA‑GGATGGGGCCTTCGGCGCGGTCCTGCCGGGAGCAAGGCCGGAGTGAGG > NC_002947/4027275‑4027373 |||| CCCTTACGGCGAGTCACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGCGCTCCCATCATCCGGCCCCTGCGCTGCGCTCCGGGGTTCCCTCACGCAGGCCTTGC‑GGAGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCT < 2:5156742/150‑1 TCACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTG‑GCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTCAGGGCTTGC‑GAAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGG < 1:2666453/150‑1 ggCAAAAAGGAACCAAAAACCG‑TCGGCTCCCATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTCCCCTCGCTCCGGGCTTGC‑GGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGCGCGGTCCT < 1:4822154/148‑1 AAAGTAACCAAAAAACGCTGCGCTCCCATCATCCGGCCCCTGCGCTGCGCTCCGGGGTCCCCTCACTCCGGCCTCGCTCCCGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCA‑GGATGGGGCCTTCGGCGCGGTCCTGC < 2:364695/150‑1 AAAGTAACCAAAAAACGCTGCGCTCCCATCATCCGGCCCCTGCGCTGCGCTCCGGGGTCCCCTCACTCCGGCCTCGCTCCCGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCA‑GGATGGGGCCTTCGGCGCGGTCCTGC < 2:1828996/150‑1 GTAACCAAAAAACGCTGCGCTCCCATCATCCGGCCCCTGCGCTGCGCTCCGGGGTCCCCTCACTCCGGCCTTGCTCCCGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCA‑GGATGGGGCCTTCGGCGCGGTCCTGCCGG < 2:43819/150‑1 GTAACCAAAAAACGCTG‑GCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTCCGGGCTTGCTCCCGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGCGCGGTCCTCCCGGGA < 1:3030807/150‑1 GTAACCAAAAAACGCTG‑GCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTCCGGGCTTGCTCCCGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGCGCGGTCCTCCCGGGA < 2:2559134/150‑1 GTAACCAAAAAACGCTG‑GCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGGTCCCTCGCTCCGGGCTTGCTCCCGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGCGCGGTCCTCCCGGGA < 2:5599258/150‑1 AACCAAAAAACGCTGCGCTCCCATCATCCGGCCCCTGCGCTGCGCTCCGGGGTTCCCTCACTCCGGCCTTGCTCCCGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCA‑GGATGGGGCCTTCGGCGCGGTCCTGCCGGGA < 2:2308503/150‑1 AACCAAAAAACGCTGCGCTCCCATCATCCGGCCCCTGCGCTGCGCTCCGGGGTCCCCTCACTCCGGCCTTGC‑GGAGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCA‑GGATGGGGCCTTCGGCGCGGTCCTGCCGGGAG < 2:2413789/150‑1 AAAAACGCTGCGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTCCGGGCTTGC‑GAAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCATGGATGGGGCCTGCAGCGC‑GTACTCCCGGGAGCAAGc < 2:3762707/150‑2 AAAACGCTGCGCTCCCATCATCCGGCCCCTGCGCTGCGCTCCGGGGTCCCCTCACTCAGGCCTTGC‑GAAGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCA‑GGATGGGGCCTTCGGCGCGGTCCTGCCGGGAGCAAGGC < 2:2275920/150‑1 AAACGCTGCGCTCCCATCATCCGGCCCCTGCGCTGCGCTCCGGGGTCCCCTCACTCCGGCCTTGC‑GGAGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCA‑GGATGGGGCCTTCGGCGCGGTCCTGCCGGGAGCAAGGCC < 2:5176929/150‑1 AACGCTGCGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCGCCGGGGTTCCCTCGCTCAGGGCTTGC‑GAAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCATGGATGGGGCCTGCAGCGC‑GTACTCCCGGGAGCAAGCCCG < 1:2326219/150‑1 AACGCTGCGCTCCCATCATCCGGCCCCTGCGCTGCGCTCCGGGGTTCCCTCACTCCGGCCTTGC‑GGAGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCA‑GGATGGGGCCTTCGGCGCGGTCCTGCCGGGAGCAAGGCCG < 2:6610631/150‑1 AACGCTG‑GCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTCCGGGCTTGC‑GAAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGCGCGGTCCTCCCGGGAGCAAGCCCGGA < 2:4455179/150‑1 AACGCTG‑GCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTCCGGGCTTGC‑GAAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGCGCGGTCCTCCCGGGAGCAAGCCCGGA < 2:4455145/150‑1 CGCTGCGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTCCGGGCTTGC‑GAAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCATGGATGGGGCCTGCAGCGC‑GTACTCCCGGGAGCAAGCCCGGA < 1:3148595/150‑1 CGCTGCGCTCCCCTCATCCGGCCCCTGCGCTGCGCTCCGGGGTCCCCTCACTCCGGCCTTGC‑GAAGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCA‑GGATGGGGCCTTCGGCGCGGTCCTGCCGGGAGCAAGGCCGGA < 1:394397/150‑1 CGCTGCGCTCCCATCATCCGGCCCCTGCGCTGCGCTCGGGGGTTCCCTCTCTCCGGCCTTGC‑GGAGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCGGTCAAGCGCTGAGGCCCCA‑GGATGGGGCCTTCGGCGCGGTCCTGCCGGGAGCAAGGCCGGA < 1:4403220/150‑1 CGCTGCGCTCCCATCATCCGGCCCCTGCGCTGCGCTCCGGGGTTCCCTCACTCAGGCCTTGC‑GGAGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCA‑GGATGGGGCCTTCGGCGCGGTCCTGCCGGGAGCAAGGCCGGA < 1:2782060/150‑1 CGCTGCGCTCCCATCATCCGGCCCCTGCGCTGCGCTCCGGGGTCCCCTCACTCCGGCCTTGC‑GGAGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCA‑GGATGGGGCCTTCGGCGCGGTCCTGCCGGGAGCGAGGCCGGA < 2:955541/150‑1 CGCTGCGCTCCCATCATCCGGCCCCTGCGCTGCGCTCCGGGGTCCCCTCACTCAGGCCTTGC‑GGAGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCA‑GGATGGGGCCTTCGGCGCGGTCCTGCCGGGAGCAAGGCCGGA < 1:5854900/150‑1 CGCTGCGCTCCCATCATCCGGCCCCTGCGCTGCGCTCCGGGGTCCCCTCACTCAGGCCTTGC‑GGAGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCA‑GGATGGGGCCTTCGGCGCGGTCCTGCCGGGAGCAAGGCCGGA < 2:1909917/150‑1 CGCTGCGCTCCCATCATCCGGCCCCTGCGCTGCGCTCCGGGGTCCCCTCACTCAGGCCTTGC‑GAAGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCA‑GGATGGGGCCTTCGGCGCGGTCCTGCCGGGAGCAAGGCCGGA < 1:6784011/150‑1 ctgGCTCCTATCATCCGGCCCCGGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTCAGGGCTTGC‑GAAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGCGCGGTCCTCCCGGGAGCAAGCCCGGAGCGA < 1:3789256/147‑1 tgGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTCAGGGCTTGC‑GAAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGCGCGGTCCTCCCGGGAGCAAGCCCGGAGCGAG < 1:543530/148‑1 tgGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCGCAGGGCTTGC‑GAAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGCGCGGTCCTCCCGGGAGCAAGCCCGGAGCGAG < 2:694186/148‑1 gGCTCCCATCATCCGGCCCCTACGCTACGCTCCGGGGTCCCCTCACTCAGGGCTTGC‑GGAGGGAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTG‑GGCCCCA‑GGATGGGGCCTGCAGCGCGGTCCTCCCGGGAGCAAGCCCGGAGTGAGG < 2:291941/149‑1 CGCTCCCATCATCCGGCCCCTGCGCTGCGCTCCGGGGTCCCCTCACTCCGGCCTTGC‑GGAGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCA‑GGATGGGGCCTTCGGCGCGGTCCTGCCGGGAGCAAGGCCGGAGTGAG < 2:3946764/150‑1 CGCTCCCATCATCCGGCCCCTGCGCAGCGCTCCGGGGTCCCCTCACTCCGGCCTTGC‑GGAGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCA‑GGATGGGGCCTTCGGCGCGGTCCTGCCGGGAGCAAGGCCGGAGTGAG < 2:3946782/150‑1 CTCCCATCATCCGGCCCCTGCGCTGCGCTCCGGGGTTCCCTCACTCCGGCCTTGCTCCCGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCA‑GGATGGGGCCTTCGGCGCGGTCCTGCCGGGAGCAAGGCCGGAGTGAGG < 2:2495346/150‑1 |||| CCCTTACGGCGGGTCACTTTTTGTCAAACGCGACAAAAAGTAACCAAAAAACGCTGCGCTCCTATCATCCGGCCCCTGCGCTACGCTCCGGGGTTCCCTCGCTC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/2418038‑2417935‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTTGC‑GGAGGCAGGTGACGGGCATGGATGCCCGTCAAGCGCTGAGGCCCCA‑GGATGGGGCCTTCGGCGCGGTCCTGCCGGGAGCAAGGCCGGAGTGAGG > NC_002947/4027275‑4027373 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |