| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 5764468 | 48 (0.210) | intergenic (+72/+84) | trmL/secB | tRNA (cytosine(34)‑2'‑O)‑methyltransferase TrmL/protein‑export protein SecB | |||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
AGGTGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCC‑GGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5764260‑5764440‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgggcctcttcgcgggtaaacccgctcctacAGGGGATTGCGCCGTTCCCTCGGCCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACACATCAGCTCCCGGCAAACCCGTTCTGCCGCCACGCCTCATACACCGTCACCGCCACCGTATTGGACAGGTTCAGGCTAC < NC_002947/5764468‑5764320 AGGTGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCC‑GGGAGCTGATGTGTTGCCTGTG < 1:5435867/150‑1 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< 2:5589225/150‑1 TGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCC‑GGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGG < 1:1531182/150‑1 TGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCC‑GGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGG > 2:6788553/1‑150 TGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCC‑GGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGG < 2:4191706/150‑1 TGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCC‑GGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGG < 1:1856104/150‑1 TGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCC‑GGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGG > 2:3326784/1‑150 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ACCCGCTCCTACAGGGGATTGCGCCGTTCCCTCGGCCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACACATCAGCTCCCGGCAAACCCGTTCTGCCGCCACGCCTCATACACCGTCACCGCCACCGTATTGGACAG > 2:754028/1‑150 ACCCGCTCCTACAGGGGATTGCGCCGTTCCCTCGGCCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACACATCAGCTCCCGGCAAACCCGTTCTGCCGCCACGCCTCATACACCGTCACCGCCACCGTATTGGACAG > 1:5083650/1‑150 CCCGCTCCTACAGGGGATTGCGCCGTTCCCTCGGCCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACACATCAGCTCCCGGCAAACCCGTTCTGCCGCCACGCCTCATACACCGTCACCGCCACCGTATTGGACAGG > 1:5688/1‑150 CCCGCTCCTACAGGGGATTGCGCCGTTCCCTCGGCCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACACATCAGCTCCCGGCAAACCCGTTCTGCCGCCACGCCTCATACACCGTCACCGCCACCGTATTGGACAGG > 2:359255/1‑150 CCCGCTCCTACAGGGGATTGCGCCGTTCCCTCGGCCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACACATCAGCTCCCGGCAAACCCGTTCTGCCGCCACGCCTCATACACCGTCACCGCCACCGTATTGGACAGG > 1:2043546/1‑150 CCCGCTCCTACAGGGGATTGCGCCGTTCCCTCGGCCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACACATCAGCTCCCGGCAAACCCGTTCTGCCGCCACGCCTCATACACCGTCACCGCCACCGTATTGGACAGG > 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GCTCCTACAGGGGATTGCGCCGTTCCCTCGGCCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACACATCAGCTCCCGGCAAACCCGTTCTGCCGCCACGCCTCATACACCGTCACCGCCACCGTATTGGACAGGTTC < 2:2703019/150‑1 CTCCTACCGGGGATTGCGCCGTCCCCTCGGCCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACACATCAGCTCCCGGCAAACCCGTTCTGCCGCCACGCCTCATACACCGTCACCGCCACCGTATTGGACAGGTTCA < 2:153429/150‑1 TCCTACAGGGGATTGCGCCGTTCCCTCGGCCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACACATCAGCTCCCGGCAAACCCGTTCTGCCGCCACGCCTCATACACCGTCACCGCCACCGTATTGGACAGGTTCAG > 2:2933414/1‑150 CTACAGGGGATTGCGCCGTTCCCTCGGCCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACACATCAGCTCCCGGCAAACCCGTTCTGCCGCCACGCCTCATACACCGTCACCGCCACCGTATTGGACAGGTTCAGGC > 2:1259202/1‑150 TACAGGGGATTGCGCCGTTCCCTCGGCCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA > 2:5741992/1‑56 TACAGGGGATTGCGCCGTTCCCTCGGCCTGCGTAGGAGCGGGTTTACACGAGAAGAGGCCCGCACAGGCAACACATCAGATCCCGGCAAACCCGTTCTGCCGCCACGACTCATACACCGTCACCGCCACCGTATTGGACAGGTTCAGGCT > 1:815217/1‑150 TACAGGGGATTGCGACGTTCCCTCGGCCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACACATCAGCTCCCGGCAAACCCGTTCTGCCGCCACGCCTCATACACCGTCACCGCCACCGTATTGGACAGGTTCATGCT > 2:2901767/1‑150 ACAGGGGATTGCGCCGTTCCCTCGGCCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACACATCAGCTCCCGGCAAACCCGTTCTGCCGCCACGCCTCATACACCGTCCCCGCCACCGTCGTGGACAGGTTCAGGCTA > 2:5938790/1‑150 CAGGGGATTGCGCCGTTCCCTCGGCCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACACATCAGCTCCCGGCAAACCCGTTCTGCCGCCACGCCTCATACACCGTCACCGCCACCGTATTGGACAGGTTCAGGCTAC > 2:6405719/1‑150 AGGTGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTTGCC‑GGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5764260‑5764440‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgggcctcttcgcgggtaaacccgctcctacAGGGGATTGCGCCGTTCCCTCGGCCTGCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCACAGGCAACACATCAGCTCCCGGCAAACCCGTTCTGCCGCCACGCCTCATACACCGTCACCGCCACCGTATTGGACAGGTTCAGGCTAC < NC_002947/5764468‑5764320 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |