| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 100443 = | 311 (1.060) | 14 (0.050) | 7/240 | NT | 5.4% | intergenic (‑35/+87) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 100525 = | 215 (0.840) | intergenic (‑117/+5) | PP_0094/PP_0095 | 5'‑nucleotidase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 369 total aligned reads displayed.
GGTCCGGTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGC > NC_002947/100294‑100592 | ggTCCGGTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCcttct < 1:3822566/150‑1 (MQ=255)ggTCCGGTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCcttct < 1:2789406/150‑1 (MQ=255)agtggctacctgtacatgggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgaccaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcat < 1:4564419‑M1/1‑1 (MQ=255) gtggctacctgtacatgggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcatt > 2:4199165‑M1/149‑150 (MQ=255) gctacctgtacatgggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTcgc < 1:5941988‑M1/5‑1 (MQ=255) gTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCgg < 1:3627786/150‑1 (MQ=255) gTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCgg < 1:233376/150‑1 (MQ=255) ctgtacatgggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCGGGCa > 1:1596387‑M1/141‑150 (MQ=255) ctgtacatgggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCGGGCa < 2:1617362‑M1/10‑1 (MQ=255) tcgATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATg > 2:3551734/1‑150 (MQ=255) cgATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGc < 2:4424267/150‑1 (MQ=255) catgggcagtccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCGGGCATGccc > 2:5028309‑M1/136‑150 (MQ=255) gCCCAGCTTGGCCCGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGc > 2:1027664/1‑150 (MQ=255) gCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGc < 2:611656/150‑1 (MQ=255) cccAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCt < 1:2159954/150‑1 (MQ=255) ccAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTc > 1:4126447/1‑150 (MQ=255) ccAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTc > 1:5050028/1‑150 (MQ=255) cAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGTGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGCCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTcc > 1:3705199/1‑150 (MQ=255) 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tccggtgaaacaggcccggctgctgaacgacaaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCGGGCatgcccgcgaatgcg > 2:6523829‑M1/127‑143 (MQ=255) aGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTaaa < 2:2936395/150‑1 (MQ=255) aGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTaaa < 2:405481/150‑1 (MQ=255) ggCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAgc < 2:3425013/150‑1 (MQ=255) gTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCa < 2:1160788/150‑1 (MQ=255) 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gATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCtt > 1:3508557/1‑150 (MQ=255) cgagcgagTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCTAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGaa < 1:6631720/150‑1 (MQ=255) cgagcgagTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGaa < 2:5934590/150‑1 (MQ=255) gTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCa < 1:1891632/150‑1 (MQ=255) caaggagcgcgcatttttctcctacagcgccggcaactacgtgaagctcaaggaccagcacctggccgaaggctacgatcaacctgaatgaccgcaTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTc > 1:1647332‑M1/97‑150 (MQ=255) 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> 1:3905936/1‑150 (MQ=255) cAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGt > 1:3164304/1‑150 (MQ=255) cAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGt > 2:2147930/1‑150 (MQ=255) gTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTg < 2:2035505/150‑1 (MQ=255) ttCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTgg > 1:5634313/1‑150 (MQ=255) ttCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTgg < 2:3237204/150‑1 (MQ=255) ccACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCGGCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTc < 1:1016263/150‑1 (MQ=255) cACTTGTGTGCTGGGTGGCATACTGGGCGGGCAGGCCCGCCCCCACCGGTACCGCGCTGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCGGCGGGGGCGGGATTGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTcc < 1:33256/150‑1 (MQ=255) aCTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCt > 2:4130081/1‑150 (MQ=255) aCTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCt > 1:5387113/1‑150 (MQ=255) aCTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCt > 1:1191452/1‑150 (MQ=255) aCTTGAGTGCTGCGGGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCt < 2:4237633/150‑1 (MQ=255) cTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCtt < 2:6584291/150‑1 (MQ=255) cTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCtt > 2:5242469/1‑150 (MQ=255) tGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGa < 1:1101742/150‑1 (MQ=255) tgctgcGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCtt > 2:5120043/1‑150 (MQ=255) tgctgcGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGCGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCAATCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGAGCTGGTCCTTGAGCtt > 2:2409907/1‑150 (MQ=255) tgcGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCAc < 2:4614881/150‑1 (MQ=255) tgcGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCAc > 1:4347178/1‑150 (MQ=255) gcGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTg < 2:563071/53‑1 (MQ=255) cGTGGCCTCCTGCGCGGGCTAGCCCGCCCCCCCAGGAAAAGCGCCGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGt < 1:3996276/150‑1 (MQ=255) gTGGCCTTCTTGGGGGGCTTGCCCGCTCCCACAGTTAACGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACGTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTa < 1:6307339/150‑1 (MQ=255) ggCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGt > 1:5189871/1‑150 (MQ=255) gCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGtt > 2:3448230/1‑150 (MQ=255) ccTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTg > 2:2801647/1‑150 (MQ=255) ttcttcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCACCCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGcc > 2:5378570/1‑150 (MQ=255) cttcGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCgg > 2:2268734/1‑150 (MQ=255) | GGTCCGGTTCGTCGATGCCCAGCTTGGCCAGGGCGTACTGGATCGAGCGAGTGATGCCCAGGCGTGGGTCGGTCAGGGTGCCGTCGAGGTCGAAGAGGATGTTTTGCTGGTGCATGTACAGGGTTCCACTTGAGTGCTGCGTGGCCTTCTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAGGTAAAGCGCAGGCCTTGAAGGGGCCACTCAACCTGCGGGGGCGGGCATGCCCGCGAATGCGGTCATTCAGGTTGATCGTAGCCTTCGGCCAGGTGCTGGTCCTTGAGCTTCACGTAGTTGCCGGC > NC_002947/100294‑100592 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |