New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1119824 = | 164 (0.560) | 34 (0.140) | 13/224 | NT | 23.0% | intergenic (‑64/+115) | rlmF/valS | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F/valine‑‑tRNA ligase |
? | NC_002947 | 1119900 = | 93 (0.390) | intergenic (‑140/+39) | rlmF/valS | ribosomal RNA large subunit methyltransferase F/valine‑‑tRNA ligase |
Only 100 of 256 total aligned reads displayed.
TCAGGGTGGGCCTTGATCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGA > NC_002947/1119675‑1119973 | tCAGGGTGGGCCTTGATCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTg < 1:6586747/150‑1 (MQ=255) cgacaaggccccgcctgcggtgatcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcgc > 2:3916867‑M1/149‑150 (MQ=255) aGGGTGGGCCTTGATCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCg < 2:46392/150‑1 (MQ=255) acaaggccccgcctgcggtgatcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGa > 2:5435029‑M1/147‑150 (MQ=255) acaaggccccgcctgcggtgatcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGa > 2:1461770‑M1/147‑150 (MQ=255) ggTGGGCCTTGATCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGac > 2:1899931/1‑150 (MQ=255) gccccgcctgcggtgatcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACaa > 1:915701‑M1/142‑150 (MQ=255) cccgcctgcggtgatcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAgg < 1:1895566‑M1/11‑1 (MQ=255) cccgcctgcggtgatcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAgg > 2:37093‑M1/140‑150 (MQ=255) cccgcctgcggggatcgagcaggaacgcgccaggctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggacgctgtacggccctttcGCGCCACAAgg < 2:5206022‑M1/11‑1 (MQ=255) ccgcctgcggtgatcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGc < 1:2426667‑M1/12‑1 (MQ=255) cccgcctgcggtgatcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccctggggctgctgcgcagcccttttGCGACACAAGGc < 1:5286180‑M1/12‑1 (MQ=255) cTTGATCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGc > 1:3317464/1‑150 (MQ=255) gATCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGc > 1:4111664/1‑150 (MQ=255) aTCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCt < 1:5000433/150‑1 (MQ=255) aTCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCt > 2:5355694/1‑150 (MQ=255) aTCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCt > 2:6542944/1‑150 (MQ=255) gcggtgatcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTcc > 1:586059‑M1/133‑150 (MQ=255) ggtgatcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCca > 1:2572876‑M1/131‑150 (MQ=255) ggtgatcgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCca > 1:6039014‑M1/131‑150 (MQ=255) ggCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCca < 1:698183/150‑1 (MQ=255) gCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCcac < 1:4424003/150‑1 (MQ=255) gggAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACagga < 1:3866504/150‑1 (MQ=255) gggAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTATCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACagga < 1:1072776/150‑1 (MQ=255) cgagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACaggag > 2:6755867‑M1/125‑150 (MQ=255) gagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCcaca > 1:4596035‑M1/124‑145 (MQ=255) gagaaggaacgcgccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCACCcccaggtcg < 1:3475198‑M1/27‑4 (MQ=255) aaGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAggg < 2:197859/150‑1 (MQ=255) aGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGt < 1:3716577/150‑1 (MQ=255) aGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCAGCTCCCACAGGAGGGt < 1:586437/150‑1 (MQ=255) cGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGgc < 2:719619/150‑1 (MQ=255) cGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGgc < 1:1645665/150‑1 (MQ=255) gTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGGGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGgc‑g > 1:102063/1‑150 (MQ=255) aCCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGa > 1:3104479/1‑150 (MQ=255) aCCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGa < 2:4378866/150‑1 (MQ=255) cccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGaa < 2:4827355/150‑1 (MQ=255) cccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGaa < 1:5997884/150‑1 (MQ=255) ccaagctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGaa > 1:2031757‑M1/111‑150 (MQ=255) ccTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAg < 2:5715172/150‑1 (MQ=255) tggtggCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGt > 2:3475037/1‑150 (MQ=255) agctggccgagtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGt > 2:4489571‑M1/108‑150 (MQ=255) ggtggCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGtt < 1:735297/150‑1 (MQ=255) gtggCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTg < 1:2833783/150‑1 (MQ=255) ggCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGgc < 1:5200238/150‑1 (MQ=255) gCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGgcg < 2:5833896/150‑1 (MQ=255) gtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTc > 1:4487235‑M1/98‑150 (MQ=255) gtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacagcccttttGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTc > 2:1394712‑M1/98‑150 (MQ=255) agtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccctggggctgctgcgcagcccttttGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTc > 1:654234‑M1/98‑150 (MQ=255) agtccgaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccctggggctgctgcgcagcccttttGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTc > 1:2665389‑M1/98‑150 (MQ=255) gaacaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagggctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCtgt > 1:1716683‑M1/94‑150 (MQ=255) ggTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTgg < 2:3123767/150‑1 (MQ=255) ggTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCGATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTACTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTgg < 2:3564807/150‑1 (MQ=255) acaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTgg > 1:5126750‑M1/92‑150 (MQ=255) acaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTgg > 2:6598895‑M1/92‑150 (MQ=255) acaggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTgg > 2:2343644‑M1/92‑150 (MQ=255) caggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTggg > 1:3134239‑M1/91‑150 (MQ=255) tGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGa < 1:1312480/150‑1 (MQ=255) aggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggctgctgcgcagcccttgtGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGa > 2:459487‑M1/90‑150 (MQ=255) aggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGa > 2:4522916‑M1/90‑150 (MQ=255) aggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacagccattttGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGa > 1:6284386‑M1/90‑150 (MQ=255) aggccctggccaacgtcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtactcactcgagagaccgttggggccgcggtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACCGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGa > 2:5579730‑M1/90‑150 (MQ=255) ggccctggccaacttcaccgagcagcatgcgcggattgcagcgctgtaatcactagagagaccgttggggccgctgtacggccctttcGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAg > 2:6217974‑M1/89‑150 (MQ=255) cAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGACGGCGCCAA‑CCTTCAAGG‑CGCCACCCTCCTGTGGGAGc < 2:4305211/150‑1 (MQ=18) 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ggtCCAGCCCGCGCCGCGCGGGGGCGTGCCGACCCTGGGGCGGCGGCGCAGCCCTTTTGCGACACCCGGCCGCGCCCCCCGGCGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGGCCTGTGGGAGCGGCCTTGGGTCGCGACAGGGCCGTACAGc < 2:6335463/149‑1 (MQ=255) tCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCgg > 1:4272745/1‑150 (MQ=255) cAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACTGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGcc < 1:4848704/150‑1 (MQ=255) aGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGccc > 1:5446555/1‑150 (MQ=255) ccTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCaa > 2:1739438/1‑150 (MQ=255) ggggTGGCTTTAAGACCCTGGGGCGGCTGCGCAGCCCTTTGGCGACCCAAGGCCGCTCCCACCGGCGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGACGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGtctctc < 1:4788181/148‑1 (MQ=255) gCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGTTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCATGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGtctctc < 1:6182782/150‑1 (MQ=255) gCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGtctctc < 2:4193482/150‑1 (MQ=255) gCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGtctctc < 2:4746446/150‑1 (MQ=255) tGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGt < 2:3290149/150‑1 (MQ=255) cTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGAt < 1:3852469/150‑1 (MQ=255) ttGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGAtt > 2:1895566/1‑150 (MQ=255) gaGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCCCAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACa < 2:5286180/149‑1 (MQ=255) aaGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACa < 2:2784284/150‑1 (MQ=255) aaGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACa > 2:1488325/1‑150 (MQ=255) aCCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAgcg > 2:5646935/1‑150 (MQ=255) ccTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCt > 2:2640543/1‑150 (MQ=255) cTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTcgc > 1:6281480/1‑100 (MQ=255) cTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTg < 2:2156922/150‑1 (MQ=255) tGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGc > 1:3949540/1‑150 (MQ=255) gggCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACACGGCCGCTCCCACAGGAGGGGGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCtcgta < 2:1132647/150‑5 (MQ=255) ctgctgCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATcc < 2:5446555/150‑1 (MQ=255) gctgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCGGGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCGAGTGATTACAGCGCTGCAATCcgc > 1:1328018/1‑150 (MQ=255) tgcGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCgcgc < 2:5972337/150‑1 (MQ=255) gcAGCCCATTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTGGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCAtg < 1:5355694/150‑1 (MQ=255) tttGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGTTCgg > 2:3208675/1‑150 (MQ=255) GCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGACGGCGCC‑AACCTTCAAGGC‑GCCACCCTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCAAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGa < 2:1733808‑M1/150‑1 (MQ=255) | TCAGGGTGGGCCTTGATCAGGCTGGGGAAGTCGTAGCGACCCTGGTGGCGGTTGCGCGGGTGCAGGGTGGGTTTGTTCGGGGTCATGGCAGTGTCCAGCCCTATACGAGCGGTGGCTTGAAGACCCTGGGGCTGCTGCGCAGCCCTTTTGCGACACAAGGCCGCTCCCACAGGAGGGTGGC‑G‑CCTTGAAGGTTGGCGCCGTCCTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGCCGTACAGCGGCCCCAACGGTCTCTCTAGTGATTACAGCGCTGCAATCCGCGCATGCTGCTCGGTGA > NC_002947/1119675‑1119973 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |