New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 365 total aligned reads displayed.
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tgcCACGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTcgcccgcccccacaggttcaccccggccctaaggccatgcgatatcccagtgggagcgggcaagcccgcgaaga < 1:3759948‑M1/150‑75 (MQ=255) tgcCAAGCTGGCTCCGCTGGTTTGCCGCACGCGCCTGCACTGATTTTGTACCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCGGGGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGagcccgcgaaga > 1:6482828‑M2/1‑138 (MQ=255) tgcCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGGGTGCCCGCACCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCAGTGGGGGCGGGCGagcccgcgaaga < 1:6041270‑M2/150‑13 (MQ=255) tgcCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGagcccgcgaaga < 2:6764024‑M2/150‑13 (MQ=255) gggagaggtggcagttggtcacagccgcgcttgaaacctggtttttgtatggcctgCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAaga > 2:450975‑M1/57‑150 (MQ=255) ccAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGagcccgcgaagagg < 1:3898915‑M2/150‑15 (MQ=255) ccAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCGTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGagcccgcgaagggg < 1:5487339‑M2/150‑15 (MQ=255) cAAGCGGGCTCAGCTGTTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCCCGGGTATATCGCATGGCCTTTGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGagcccgcgaagaggc > 2:221406‑M2/1‑135 (MQ=255) aaGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCGTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCCCGGGGATATCGCATGGCCGTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGagcccgcggagaggcc < 1:965752‑M2/150‑17 (MQ=255) tGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGTCTTAGGGCCGTGGTGAACCGGTGGGGGCGGGCGagcccgcgaagaggccggtg < 2:3253989‑M2/150‑21 (MQ=255) tCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGGTATCGCATGGCCGTAGGGCCGTGGTGGACCGGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGGAGAGGCCGGTGCAgg > 1:4257903/1‑150 (MQ=39) aGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCa > 2:3888484/1‑150 (MQ=255) gCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGCTATCGCATGGCCGTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCaa > 2:1516161/1‑150 (MQ=255) tttGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACaa > 2:5719362/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCGTAGGGCCGTGGTGAACCGGGGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCCGGCAAAACaaa > 1:3867953/1‑150 (MQ=39) ccGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCGTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACTGGGCTATCGCATGGCCGTAGGGCCGGGGTGGCCCGGTGGGGGCGGGCGGGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCCATAAAAAAAc > 1:5981735/1‑150 (MQ=255) cGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGTTATCGCATGGCCGTAGGGCCGGGGTGGACCGGTGGGGGCGGGGGCGCCCCCGACGAGGCCGGGGGCGGGCCTACAAAAAcc > 1:5856743/1‑150 (MQ=255) gCACGCGCCGGCACGGATTTTGTAGCGCCTCACCGGCCTCTCCGCGGGCTGGCCCGCTCCCCCTGGGATCTCGCAGGGCCTTCGGGCCGTGTTGAACCTGGGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCa < 1:2676348/150‑1 (MQ=255) cacgcgcCGGCACTTATTTTGGATCGCCTCACCGGCCTCTGCGCGGGCTGGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCGGGGGGGGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAg < 1:4411647/147‑1 (MQ=255) cccTGCCGTGTTTTTGTAGCGCCCCCCCGGCCTCTGCGCGGGCTGCCCCGCGCCCACTGGGATATCGCCGGGCCTTCGGGCGGTGGTTAACCGGGGGGGGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTc < 1:3826766/149‑1 (MQ=255) aCTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACTGGGATTTCGCATGGCCGTAGGGCCGTGGTGCACCGGTGGGGGCGGGCGCGCCCGCGGAGAGGCCGGTGCTGGCACTACAAAAACCAGGTTTCAAgggc > 1:3517586/1‑150 (MQ=255) tGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCgg > 2:3702639/1‑150 (MQ=255) aTTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGGGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCt < 1:1987743/150‑1 (MQ=255) ttttGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTg > 2:4302080/1‑150 (MQ=255) tttGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTGGCCCGCACCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGCGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTga < 2:4577122/150‑1 (MQ=255) ccTCACCGGCCTCGTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAGGGATAGCGCATGGCCTTAGGGCCGGGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGCAGAGGCCGGGGCCGGCAATACAAAAACCACGTTTCAAGCGCGGCGGAGACCAAcag > 2:1905527/1‑148 (MQ=37) | TGTCGAGGTGTTCAACCCGGTGTTCGATGTAACGCCGGCCGACCTGATCGATGTGATCGTGACCGAACGCGGCATCGTCGAGCGCCCGGATGCTGCCAAGCTGGCTCAGCTGGTTTGCCGCAAGCGCCTGCACTGATTTTGTATCGCCTCACCGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACTGGGATATCGCATGGCCTTAGGGCCGTGGTGAACCTGTGGGGGCGGGCGAGCCCGCGAAGAGGCCGGTGCAGGCAATACAAAAACCAGGTTTCAAGCGCGGCTGAGACCAACTGCC > NC_002947/1975563‑1975860 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |