New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 4155017 = | 159 (0.540) | 15 (0.060) | 11/238 | NT | 11.7% | intergenic (+23/‑374) | PP_3654/PP_3655 | leucine‑responsive regulatory protein/cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein |
? | NC_002947 | 4155084 = | 88 (0.350) | intergenic (+90/‑307) | PP_3654/PP_3655 | leucine‑responsive regulatory protein/cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein |
Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
AGCCAAGGACCTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCGCCTGC‑AAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCC > NC_002947/4154868‑4155165 | cttaagcgggtgacggtagcaaggagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctc > 1:4735123‑M1/150‑150 (MQ=255) gCCAAGGACCTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCt > 2:2454415/1‑150 (MQ=255) gcgggtgacggtagcaaggagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTcgc > 1:6081031‑M1/145‑150 (MQ=255) gcgggtgacggtagcaaggagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTcgc < 1:3508423‑M1/6‑1 (MQ=255) aGGACCTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTcgc < 2:2805575/150‑1 (MQ=255) gggtgccggtagcaaggagagtgcccgctggcggacggccgtggggtagcggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGC‑gg > 1:6355248‑M1/143‑150 (MQ=255) gggtgacggtagcatggagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGC‑gg > 1:4628904‑M1/143‑150 (MQ=255) gggtgacggtagcaaggagagtgccagctggctgacggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGC‑gg > 2:2700980‑M1/143‑150 (MQ=255) gggtgacggtagcaaggagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGC‑gg > 2:3241535‑M1/143‑150 (MQ=255) gggtgacggtagcaaggagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGC‑gg < 1:2527061‑M1/8‑1 (MQ=255) gggggccggtcgcacggagagtgccagcgggctgacggccttggggtcgcggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGC‑gg > 1:1096241‑M1/143‑150 (MQ=255) aCCTGCCGGCGTTTCAGCAGCTGTATGACGAGCACCGGACCAGTATTCCCACTGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGGTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑ggg < 2:6582694/150‑1 (MQ=255) ccTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCGGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGt < 2:1232155/150‑1 (MQ=255) ccTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGt > 2:4097961/1‑150 (MQ=255) gacggtagcaaggagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGC‑GGGTaa < 1:4097961‑M1/12‑1 (MQ=255) acggtagcaaggagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGC‑GGGTaaa > 2:49723‑M1/138‑150 (MQ=255) cggtagcaaggagagtgccagctggctgaaggccttggggtagaggggcggcgggggtggcaaccggatcacggtgggctgggttggtgcgatgtgcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGC‑GGGTAAAc > 1:4891353‑M1/137‑150 (MQ=255) ccGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAAc < 2:5253448/150‑1 (MQ=255) 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tCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCGCCt < 1:5025629/150‑1 (MQ=255) tCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCGCCt < 1:2660240/150‑1 (MQ=255) tCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCGCCt < 2:464537/150‑1 (MQ=255) aGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTTTACCc‑gcgaaggg < 2:2290596/150‑6 (MQ=255) aGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCGCCTGc > 2:2732134/1‑150 (MQ=255) 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gCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCGCCAGC‑AAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCCCGAAGAggccggc > 2:5495326/1‑150 (MQ=255) gACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCGCCTGC‑AAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCCAAGAGGCCGGCCCAg > 2:4445607/1‑150 (MQ=255) gACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑CCGCCAGC‑AAAGGTGACGTATCCCCTCGCAGGAGCCGGTTTACCCCCGAAGAGGCCGGCCCAg > 2:1158194/1‑150 (MQ=255) aaggaagTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCTGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCGCCGGC‑AAGGGTGCCCTAGCCCGGCGCAGGGGCGGGTTTACCCGCCAAGAGGCCGGCCCAGGCCACCattaaaa > 2:669897/1‑146 (MQ=255) agTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAAACC‑CCGCCGGC‑AAAGGTGACGTAGCCCGGCGCAGGAGCGGGTTTACCCCCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCGTTAATCTGccc > 2:2958698/1‑150 (MQ=255) tCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑CCCCCGGC‑AAAGGTGAGGTAGCCCCTCGCAGGAGCGGGGTTACCCCCGAAGAGGCCGGCCCAGGCCACCGTTCATCTGCCCAGaaa > 1:4531108/1‑150 (MQ=255) cAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAAACC‑GCGCCGGC‑AAAGGTGTCGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTTCCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCCAACGTTCATAAGCCCTGaaaaa > 2:2527061/1‑149 (MQ=38) aGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCGCCAGC‑AAACGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCCCCAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCAAAGGCCCAGAAAAcg > 2:3350551/1‑150 (MQ=255) ggttCGGTTGCTCCCCATTTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTCCGG‑GGGTAAACCC‑GCGCCTGC‑AAAGGTGAGGTAGCCGGTCGCAGTTGGGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAAcgc < 2:3447003/147‑1 (MQ=255) tCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTGTCCTCTTGTGCCGGCCCCTCCGC‑GGGTAACCCC‑GCGCCTGC‑AAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGca < 2:6662330/150‑1 (MQ=255) gcgcgttttcagggcagatgaaaggttgcctgggccggcctCTTCGC‑GGGTAAACCc‑g < 2:2636590‑M1/17‑1 (MQ=255) cTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCGCCTGC‑AAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCa < 2:5391323/150‑1 (MQ=255) cccATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCGCCTGC‑AAAGGTGACGTAGCCCGGCGCCGGCGCCGGTTTAACCCCGCACAGCCCGGCCCCCGCAACCTTTCAACTGCCCGGACAACCCGCACCACccacca > 2:3501985/1‑150 (MQ=255) cccATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCGCCTGC‑AAAGGTGACGTAGCCCGGCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCATTCATCTGCCCGGAAAACGCGCACATCGCACCa > 2:5643989/1‑150 (MQ=255) cATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCGCCTGC‑AAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAAc < 2:4550709/150‑1 (MQ=255) aGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑CCGCCAGC‑AAAGGTGTCCTATCCCCGCGCAGGAGCGGGTTTAACCCCCAACAGGCCGGCCCCGGCAACCATTAATAAGCCCAGAAAAAGCGCACAAAGCAcccacccacc > 1:6215913/1‑148 (MQ=255) tttCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAAACC‑CCGCCTGC‑AAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCCGGTTTACCCCCGAAGAGGCCGGCCCCGGCAACCATTAATCTGCCCGGAAAAAGCGCACAAAGCACCAAAccaccccacc > 1:6860543/1‑150 (MQ=255) tgtCCTCTGGTGCCGGCCCCTCCGC‑GGGTAACCCC‑GCGCCGGC‑AAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCTCATCGCTCCTACGCAGCCCAcc < 2:727918/148‑1 (MQ=38) tctTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCGCCTGC‑AAAGGTGACGTAGc < 1:82961/52‑1 (MQ=255) tctTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCGCCTGC‑AAAGGTGACGTAGc > 2:82961/1‑52 (MQ=255) ttGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCGCCTGC‑AACGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATcc < 2:2413947/150‑1 (MQ=255) ttGGGCCGG‑CCCTTTGG‑GGGTAAACCCGGCGCCTTA‑AATGTTGACGTAGCCGTTGGCTGGTGGGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATcc < 1:6532048/150‑1 (MQ=255) gCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCGCCTGC‑AAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGtt < 2:2104774/150‑1 (MQ=255) cGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCGCCTGC‑AAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGTAAACGCGCACATCGCACAAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGc < 2:3087043/150‑1 (MQ=255) ccTTCGC‑GGTTAACCCC‑GCGCCTGC‑ATTGGTGCCGTAGCCTGTGGCAGGTGGGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCAccc < 1:3350551/150‑1 (MQ=255) ccTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCGCCTGC‑AAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCCCCAACCCAGCCCACCCTGATCCGGGTGCCAccc > 2:4209566/1‑150 (MQ=255) | AGCCAAGGACCTGCCGGCGTTTCAGAAGCTGTATGACGAGCACCTGACCAGTATTCCCAATGTGAAACGCTTGAGCTCGACCTTGGTGATGAAGGAAGTGATCCAGGATCGGTTGCTCCCCATGTAGCTGTTTCCTCTTGTGCCGGCCCCTTCGC‑GGGTAAACCC‑GCGCCTGC‑AAAGGTGACGTAGCCCGTCGCAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCAGGCAACCTTTCATCTGCCCTGAAAACGCGCACATCGCACCAACCCAGCCCACCGTGATCCGGTTGCCACCC > NC_002947/4154868‑4155165 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |