New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4164062 = | 112 (0.380) | 39 (0.150) | 18/248 | NT | 23.8% | intergenic (+17/‑192) | PP_3661/PP_3662 | membrane protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 4164150 = | 149 (0.560) | intergenic (+105/‑104) | PP_3661/PP_3662 | membrane protein/hypothetical protein |
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
GGCATGGAGACCCGCTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATG > NC_002947/4163914‑4164209 | ctttggggctgacggatgcattgatgacatggcgttgaggcatctaagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctg > 2:1083977‑M1/148‑150 (MQ=255) ctttggggctgacggatgcattgatgacatggcgttgaggcatctaagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggccgtgaaaaaccttgagaccgagctgcctg < 1:1600143‑M1/3‑1 (MQ=255) ttggggctgacggatgcattgatgacatggcgttgaggcatctaagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCt > 2:1766631‑M1/146‑150 (MQ=255) aTGGAGACCCGCTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGACGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGggtgga > 2:4881939/1‑148 (MQ=255) aTGGAGACCCGCTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGgctgct < 1:2914183/150‑1 (MQ=255) gctgacggatgcattgatgacctggcgttgcggcatctaagtctttcctgtgcgggtacaacatccttctttgacaccaccataccgagaactgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTcg‑cg > 2:5530746‑M1/141‑150 (MQ=255) gctgacggatgcattgatgacatggcgttgaggcatctaagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTcg‑cg < 2:2796410‑M1/10‑1 (MQ=255) aCCCGCTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑Cgg < 1:1150485/150‑1 (MQ=255) tgacggatgcagtgatgacatggcgttgaggcatctcagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑Cggg > 2:6750115‑M1/139‑150 (MQ=255) cAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCC < 1:3947407‑M1/150‑1 (MQ=255) gcattgatgacatggcgttgaggcatctaagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCg > 2:223040‑M1/131‑150 (MQ=255) gCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGC < 1:5526323‑M1/150‑1 (MQ=255) ccAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCT < 1:4531669‑M1/150‑1 (MQ=255) cAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTC < 2:1485543‑M1/150‑1 (MQ=255) aGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTTTACCCGCgaa < 2:5657080‑M1/150‑4 (MQ=255) gATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTGG‑CGGGGAAAACCccaccg > 2:1942017‑M1/1‑144 (MQ=255) gATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTGAAACCGCGCCa > 2:5153215‑M1/1‑149 (MQ=255) tCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACA < 1:6115156‑M1/150‑1 (MQ=255) tCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACA < 2:1029741‑M1/150‑1 (MQ=255) ggcgttgaggcatctaagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaacctggagaccgagtcggCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAggtgg > 2:1966267‑M1/118‑150 (MQ=255) aGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAggtgg < 1:4720235/150‑1 (MQ=255) ggCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTGAACCCGCTCCTACAGGggcc < 2:3815258‑M1/150‑5 (MQ=255) gCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGtgctgc < 2:3752542/150‑1 (MQ=255) aCGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCt < 1:2388333/150‑1 (MQ=255) atctaagtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTg < 1:4045439‑M1/44‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGaa < 1:3794834/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGCTGCCTGCTTCG‑CGGGTGAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttca < 2:6588738‑M1/150‑17 (MQ=255) ggCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGCTGCCTGCTTCG‑CGGGTGAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttca < 2:5468800‑M1/150‑17 (MQ=255) ggCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTAAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGaa < 1:6280413/150‑1 (MQ=255) agtctttcctgtgcgggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctggCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGAc > 2:6357016‑M1/102‑150 (MQ=255) tGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggca < 1:5986560‑M1/150‑22 (MQ=255) gCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACA < 2:4971459‑M1/125‑1 (MQ=255) ccACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCaa < 1:1548239/150‑1 (MQ=255) ccGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGc < 2:5768779/150‑1 (MQ=255) ccGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGc < 2:798857/150‑1 (MQ=255) tGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcct > 1:1479454‑M2/1‑147 (MQ=255) gggtaaataatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaacctgtagaccgagtcggCTGCTTCG‑CTGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGTAGACGGCAAGGCCCCTGt > 1:6158822‑M1/88‑150 (MQ=255) gATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCGGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGCAGACGGCAAGGCCcctgta > 2:5210279‑M2/1‑144 (MQ=255) gtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAg > 1:6374682‑M1/86‑150 (MQ=255) aTCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGTTGAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtag < 1:1516134‑M1/150‑36 (MQ=255) aTCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtag < 2:3502101‑M1/150‑36 (MQ=255) aTCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtag > 2:6432776‑M2/1‑143 (MQ=255) tCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTGAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtagg < 1:5801047‑M1/150‑37 (MQ=255) tCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtagg > 1:2006660‑M2/1‑142 (MQ=255) ccTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtagga < 1:1016144‑M1/150‑38 (MQ=255) ccTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtagga > 1:433684‑M2/1‑141 (MQ=255) aaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGa > 2:138087‑M1/84‑150 (MQ=255) aaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGa > 1:1864134‑M1/84‑150 (MQ=255) tCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGGTGGGTGG‑CGGGGAAAACCCCACCAAAAGGTGGGGGGTGGCCAGTATAAGGCCAGGCCCCGGGAGGAGc > 2:2907759/1‑150 (MQ=255) tCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagc < 2:2346108‑M1/150‑40 (MQ=255) tCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagc > 1:1248829‑M2/1‑139 (MQ=255) tCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCGTAG‑CGGGGAAAAACCCGCCCACAGGGGGGTGGTGCCCAGAAGAAGGCAACGCCCCACGAGGAGc > 2:5824630/1‑150 (MQ=255) tCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCGGCTTCG‑CCGGTGAAACCCCACCCAAAAGTGGGGGGGGGCCGGAAGAAGGCCAGGCCCCAGGAGGGGc > 1:2796410/1‑150 (MQ=255) aacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGc > 1:1696640‑M1/82‑150 (MQ=255) aaCCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagcgg < 1:6790077‑M1/150‑42 (MQ=255) aaCCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagcgg > 1:6538812‑M2/1‑137 (MQ=255) aaCCTGTGGCTGGGTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagcgg < 1:5350130‑M1/150‑42 (MQ=255) aCCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagcggg > 1:971441‑M2/1‑136 (MQ=255) aCCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagcggg > 2:136464‑M2/1‑136 (MQ=255) aCCGGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagcggg > 2:3677744‑M2/1‑136 (MQ=255) tccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTGAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGt > 1:1363252‑M1/78‑150 (MQ=255) tccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGt > 1:510285‑M1/78‑150 (MQ=255) tctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCAc > 2:5912190‑M1/74‑150 (MQ=255) tctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaacctggagaccgagtcggCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCAc > 2:2317994‑M1/74‑150 (MQ=255) tGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCcgc < 1:3154769/150‑1 (MQ=255) gacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCgg < 2:2223846‑M1/71‑1 (MQ=255) gacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCgg > 1:2223846‑M1/69‑139 (MQ=255) ttGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTGAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagcgggtttacccgcgaa < 1:3565474‑M1/150‑55 (MQ=255) ttGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa < 1:4431366/150‑1 (MQ=255) gggggggCTGGCGATTACGCTGGGGGTGCAGACGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑GGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAgcag < 1:2464215/149‑1 (MQ=255) cGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGTAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGGTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTCCAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAgcag < 2:2143459/150‑1 (MQ=255) ggggggCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAgcagg < 2:5275735/150‑1 (MQ=255) gggggCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGCCTGCTTCG‑CGGGTGAACCCGCTCCTACAGGggccttgccgtcttcagggcagcacccacctgtaggagcgggtttacccgcgaagcagcc < 1:2195337‑M1/150‑61 (MQ=255) 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aTTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCGGCCCTGAAGACGGCACGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGtctc < 2:3972413/150‑1 (MQ=255) ttACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACAGAGTCGGGGGCTTCGCCGGGGAAACCC‑CCCCGACACGTGGGGGGGGGCCGGAAGACGGCAAGGCCCCCGGGGGAGCGGGGTGACCCCCCAAGCACGCCGCTccggggga > 2:1199445/1‑143 (MQ=255) ggggacggcaacgtggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagtcggCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCGTGTTGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTTGGTCTCaa > 1:832097‑M1/48‑150 (MQ=255) tggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTGAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCgg > 2:369493‑M1/47‑117 (MQ=255) gggTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTCTTTc < 2:1637440/150‑1 (MQ=255) tGCATAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTcaca < 1:426969/150‑1 (MQ=255) tGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTcaca < 1:6210568/150‑1 (MQ=255) aGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGcc < 2:3453165/150‑1 (MQ=255) ttGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGGTGCGTGG‑CGGGTTAACCCCCGCCGACAGGTGGGTGCTGGCCGGTAGACGGCCAGGCCCCCGGAGGTGGGGGTTGACCCCCGAAGCAGGCACCTCGGTCAGAAGGGTTTTATAAGccccccacca > 2:726061/1‑146 (MQ=255) tGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGTTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGtt < 1:3675101/150‑1 (MQ=255) tGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAACCCCGCTCCTACTGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGGGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGtt < 1:700795/150‑1 (MQ=255) gggCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCGTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTCCAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCCAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTg < 2:680655/150‑1 (MQ=255) tGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGt < 2:4167790/150‑1 (MQ=255) gccTGGCGCCCGCGGCGGCTGCTTCG‑CGGGTAACCCCGCGCCTACCGGTGGGGGCGGCCCTGAAGCCGGCACGGCCCGTGTCGGCGCGGGTTCCCCCGCGATGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTc < 1:655614/148‑1 (MQ=255) cTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAATCCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCACGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCca < 2:3617949/150‑1 (MQ=255) cTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACTGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGGGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCca < 1:4881939/150‑1 (MQ=255) cTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCca < 2:204731/150‑1 (MQ=255) cTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCca < 2:910395/150‑1 (MQ=255) aCCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTtc < 1:3504361/150‑1 (MQ=255) gAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgta < 2:6221449‑M2/71‑7 (MQ=255) ggCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTAtg < 2:3175746/150‑1 (MQ=255) | GGCATGGAGACCCGCTTCAGCCAGATTCGCCAGGCTGGGCCACGGGCGCTGGCCACCGGTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATG > NC_002947/4163914‑4164209 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |