| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4588468 = | 150 (0.510) | 11 (0.040) | 8/234 | NT | 8.8% | intergenic (‑48/+123) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
| ? | NC_002947 | 4588569 = | 99 (0.400) | intergenic (‑149/+22) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase | |||||
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
GTTCGAGTCGAAGAACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATG > NC_002947/4588319‑4588618 | ttCGAGTCGAAGAACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCC > 2:3972627‑M1/1‑150 (MQ=255) gccgaaacccagggtgaagacctgatgaacggccaccgctggtcgtggtacggcaagacccaatggatgcgcatagagccctggcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaacaaggttcagactgtgcccccccc < 1:2726843‑M1/2‑1 (MQ=255) tCGAGTCGAAGAACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCC < 1:4384333‑M1/150‑1 (MQ=255) cgaaacccagggtgaagacctgatgaacggccaccgctggtcgtggtacggcaagacccaatggatgcgcatagagccctggcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaacaaggttcagactgtgcccccccccc < 1:857001‑M1/4‑1 (MQ=255) cgaaacccagggtgaagacctgatgaacggccaccgctggtcgtggtacggcaagacccaatggatgcgcatagagccctggcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaacaaggttcagactgtgcccccccccc < 2:232087‑M1/4‑1 (MQ=255) cGAGTCGAAGAACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCC < 2:33850‑M1/150‑1 (MQ=255) gAGTCGAAGAACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC > 1:5345065‑M1/1‑150 (MQ=255) tcccagggtgaagacctgatgaacggccaccgctggtcgtggtacggcaagacccaatggatgcgcatagagccctggcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaacaaggttcagactgtgccccccCCCCC‑GTa > 1:1619841‑M1/143‑150 (MQ=255) tCGAAGAACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTA < 2:499828‑M1/150‑1 (MQ=255) tCGAAGAACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTA < 1:6780722‑M1/150‑1 (MQ=255) acccagggtgaagacctgatgaacggccaccgctggtcgtggtacggcaagacccaatggatgcgcatagagccctggcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaacaaggttcagactgtgccccccCCCCC‑GTa > 1:6217509‑M1/143‑150 (MQ=255) acccagggtgaagacctgatgaacggccaccgctggtcgtggtacggcaagacccaatggatgcgcatagagccctggcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaacaaggttcagactgtgccccccCCCCC‑GTa > 1:5225805‑M1/143‑150 (MQ=255) acccagggtgaagacctgatgaacggccaccgctggtcgtggtacggcaagacccaatggatgcgcatagagccctggcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaacaaggttcagactgtgccccccCCCCC‑GTa > 1:4167879‑M1/143‑150 (MQ=255) cagggtgaatacctgatgaacggccaccgctggtcgtggtacggcaagacccaatggatgcgcatagagccctggcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaacaaggttcagactgtgccccccCCCCC‑GTAGGa > 1:4764058‑M1/140‑150 (MQ=255) aagaaCGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGA < 2:1106032‑M1/150‑1 (MQ=255) gaaCGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGC > 2:6676883‑M1/1‑150 (MQ=255) gtgaagacctgatgaacggccaccgctggtcgtggtacggcaagacccaatggatgcgcatagagccctggcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaacaaggttcagactgtgccccccCCCCC‑GTAGGAGCgg > 1:1015113‑M1/136‑150 (MQ=255) gtgaagacctgatgaacggccaccgctggtcgtggtacggcaagacccaatggatgcgcatagagccctggcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaacaaggttcagactgtgccccccCCCCC‑GTAGGAGCgg > 2:2678615‑M1/136‑150 (MQ=255) aCGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGG < 1:5931302‑M1/150‑1 (MQ=255) cGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGG < 1:6688444‑M1/150‑1 (MQ=255) gaagaccggatgaacggccaccgctggtcgtggtacggcaagccccaatggatgcgcatcgagccctggcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaacacggttcagactgtgccccccCCCCC‑GTAGGAGCGGGt > 2:530442‑M1/134‑150 (MQ=255) cTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTT < 2:4840556‑M1/150‑1 (MQ=255) cTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTT < 1:1676358‑M1/150‑1 (MQ=255) ttGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTA < 1:3478255‑M1/150‑1 (MQ=255) aTGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTAccc < 1:3972627/150‑1 (MQ=255) aTGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTAccc < 2:3431526/150‑1 (MQ=255) gtgCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 2:5660406/150‑1 (MQ=255) gCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGa < 1:1257140/150‑1 (MQ=255) cTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAt < 1:681906/150‑1 (MQ=255) gTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACTCGCGAAGATGac < 2:2461010/150‑1 (MQ=255) tGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACcgc < 1:5433418/150‑1 (MQ=255) gACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACcgcg > 2:2132249/1‑150 (MQ=255) aCGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCgg < 1:176054/150‑1 (MQ=255) ggCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTg > 2:6192146/1‑150 (MQ=255) tCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGa < 2:3836351/150‑1 (MQ=255) tCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGa < 1:2743278/150‑1 (MQ=255) cTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAgg > 2:4090408/1‑150 (MQ=255) cTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAgg > 2:5363190/1‑150 (MQ=255) 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ccATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacggg > 2:676859‑M2/1‑132 (MQ=255) ccATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacggg < 2:857001‑M2/150‑19 (MQ=255) cATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGATCGATACCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGAGAAGATGACACAGCGGTGCCGAGGTGCATTGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAaaaacacgctcctacgggg < 1:2603792‑M2/150‑20 (MQ=255) gtgCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGCCATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGGGGGTTTACCCGCGAAGATGACCCCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAACCCCGCTCCTAC‑ggggggg < 2:4427886/150‑1 (MQ=255) tgCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTAtccgcgaacaccggcgaagccggtgccatgcacctcggcaccgcggtgtcatcttcgcgggtaaacccgctcctacgggggatc < 2:1062601‑M1/150‑85 (MQ=255) 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CCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATg < 2:3317146‑M1/150‑1 (MQ=255) | GTTCGAGTCGAAGAACGACTTGATGTGCAGCTGGTAGATGACGGCGTCCTTGTACCACAGCGGGTCGTCGATGAAGGCTGCCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATG > NC_002947/4588319‑4588618 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |