| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5524822 = | 194 (0.660) | 21 (0.080) | 17/254 | NT | 10.1% | intergenic (‑96/‑130) | PP_4852/PP_4853 | AraC family transcriptional regulator/DMT superfamily permease |
| ? | NC_002947 | 5524907 = | 193 (0.710) | intergenic (‑181/‑45) | PP_4852/PP_4853 | AraC family transcriptional regulator/DMT superfamily permease | |||||
Only 100 of 252 total aligned reads displayed.
ACCGGGGCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCTGTTCCCC > NC_002947/5524674‑5524969 | acCGGGGCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGcc > 1:186522/1‑150 (MQ=255) aagccgatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCtt < 2:6016634‑M1/4‑1 (MQ=255) aagccgatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCtt < 1:2768470‑M1/4‑1 (MQ=255) aagccgatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgcaaagcagcccca > 1:6154782‑M1/147‑148 (MQ=255) ggggCCGGCGGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTc < 1:2147197/150‑1 (MQ=255) ggCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTcgc < 1:6280056/150‑1 (MQ=255) ccgatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTcgc > 1:2631558‑M1/144‑150 (MQ=255) cgatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTcgcg < 1:5490840‑M1/8‑1 (MQ=255) gatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTCGCgg > 2:88221‑M1/142‑150 (MQ=255) gatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTCGCgg > 2:2432473‑M1/142‑150 (MQ=255) gatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTCGCgg < 1:3820434‑M1/9‑1 (MQ=255) gatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTCGCgg > 1:2716682‑M1/142‑150 (MQ=255) gTTGGGTGACCTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTc‑cc < 2:5887787/150‑1 (MQ=255) gTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACGGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTc‑cc < 2:5063006/150‑1 (MQ=255) ttGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTc‑ccc > 2:4048002/1‑150 (MQ=255) ttGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTc‑ccc < 1:1627780/150‑1 (MQ=255) ggTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCt > 2:3149712/1‑150 (MQ=255) tGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAg > 1:5019971/1‑150 (MQ=255) gggATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGAt < 1:3340676/150‑1 (MQ=255) atCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTgcg > 1:1046393/1‑150 (MQ=255) cGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGcc < 1:3149712/150‑1 (MQ=255) gAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCa < 2:5365078/150‑1 (MQ=255) gAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCa > 2:1401500/1‑150 (MQ=255) gAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCGCCCACAGGATCTGCGCCa > 1:370972/1‑150 (MQ=255) tttACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTcc > 2:3086131/1‑150 (MQ=255) tACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAg < 2:1878898/150‑1 (MQ=255) tACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAg < 2:5529210/150‑1 (MQ=255) tACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAg < 1:3990661/150‑1 (MQ=255) aCGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAgg < 2:4454829/150‑1 (MQ=255) aCGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCACCAgg > 1:5415816/1‑150 (MQ=255) gCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCtgt < 2:6677470/150‑1 (MQ=255) gCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCtgt < 1:4647021/150‑1 (MQ=255) acggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCtgt > 2:4930982‑M1/99‑150 (MQ=255) tGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATcc < 1:2021621/150‑1 (MQ=255) tGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTATATcc > 2:485462/1‑150 (MQ=255) gTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATccc > 2:2630444/1‑150 (MQ=255) tGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTc < 1:4856825/102‑1 (MQ=255) tGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACCGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCGGTGTATCCCCCg > 1:2932147/1‑150 (MQ=255) gcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggattggggctgctttgcagcCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAg > 2:554466‑M1/87‑150 (MQ=255) tGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGa < 2:2729635/150‑1 (MQ=255) agatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGc > 1:57362‑M1/83‑150 (MQ=255) gatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCg > 1:5641876‑M1/82‑150 (MQ=255) gggTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCgg < 1:2935303/150‑1 (MQ=255) gggTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCgg < 2:4552538/150‑1 (MQ=255) 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ataGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCaaa < 2:186522/150‑1 (MQ=255) taGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCCCTCCCACAGGATATGCGCCACCCGCCAGGCCAGTGTATACCCCGTACGAGCGGGTTCAACCCCGAAGGGCGGCAAag > 1:6424459/1‑150 (MQ=255) gtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgccttgcaggCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCTTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAagca > 2:2135232‑M1/55‑150 (MQ=255) ggCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAagca < 1:1887202/150‑1 (MQ=255) gCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAagcag > 2:2334209/1‑150 (MQ=255) 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gTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGcccc > 2:3214797/1‑150 (MQ=255) agacagacACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCTTTGCAGcccttc < 2:2952397/150‑4 (MQ=255) acagacaCTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCACGCCTGTGTATACCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCCAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCAATc > 1:6054912/1‑150 (MQ=255) acagacaCTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCCCCAGCCACCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCAATc > 1:4722144/1‑150 (MQ=255) cacTAGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGcc < 1:4350670/150‑1 (MQ=255) cTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCCCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCGCCAGGCCTGTGTATACCCCCTAGGAGCGGGTTCACCCGCCAAGGGCTGCAAAGCACCCCCATTACCGcccc > 1:6016167/1‑150 (MQ=255) tCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCACAGCAGCCCCATTCCAGccccc > 1:6854701/1‑150 (MQ=255) tCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCAGCGCCACCCTCCCGGCCTGTGTATCCCCCCGAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCACCCCCCATCCAGccccc > 1:6603151/1‑150 (MQ=38) tCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCAC‑CCCGCTACCACAGGATCTGCCCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGGAGGAGCGGGTTAACCCCCGAAAGGCAGCAAAGCAGCCCCAATCCAcccccc > 1:5373300/1‑150 (MQ=255) cGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCa < 2:3254927/150‑1 (MQ=255) aataCAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGa < 1:2685702/150‑1 (MQ=255) aataCAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGa < 1:2911487/150‑1 (MQ=255) aataCAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGa < 2:6466662/150‑1 (MQ=255) taCAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCGC‑CCCCCACCCCCACGATCTGCGCCACCCACCAGGCCTGTGTATCCCCCGGGGGAGCGGGTTCACCCCCCAAGGGCAGCAAAACACCCCCAAAACAACCCCCacccacg > 1:1767866/1‑144 (MQ=255) gCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCct < 2:663285/150‑1 (MQ=255) tATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCctgct < 2:716444/150‑1 (MQ=255) tATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCctgct > 2:1487091/1‑150 (MQ=255) gAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCAt < 1:6357385/150‑1 (MQ=255) aGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATg < 1:2132327/150‑1 (MQ=255) gcTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCt < 1:2219434/149‑1 (MQ=255) ccTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCt < 1:1115917/150‑1 (MQ=255) ccTTGCAGGCCTTCGCGGGCTA‑CCCGCACCCACATGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCAGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGGTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCAGCTGCATGAACTACCt > 2:3592399/1‑150 (MQ=38) ttGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCGGCATGAACTACCTGt > 2:5944249/1‑150 (MQ=255) ggCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCTGTTcccc < 2:6370167/150‑1 (MQ=255) ggCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCTGTTcccc < 2:167302/150‑1 (MQ=255) | ACCGGGGCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTC‑CCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCTGTTCCCC > NC_002947/5524674‑5524969 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |