New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 5764409 = | 79 (0.270) | 21 (0.090) | 6/210 | NT | 27.9% | intergenic (+13/+143) | trmL/secB | tRNA (cytosine(34)‑2'‑O)‑methyltransferase TrmL/protein‑export protein SecB |
? | NC_002947 | 5764501 = | 48 (0.210) | intergenic (+105/+51) | trmL/secB | tRNA (cytosine(34)‑2'‑O)‑methyltransferase TrmL/protein‑export protein SecB |
Only 100 of 308 total aligned reads displayed.
AGGTGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTT‑GCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGT‑AAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCGCCGGCAACAAAAAAGCGCCCCGAGAGGCGCTTTCTTGAAACCGGCAGTAATTACTG > NC_002947/5764260‑5764557 | aGGTGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTT‑GCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTG < 1:5435867‑M1/150‑1 (MQ=255) tcccggcgctgatgctgtcgccggtcaacttcgacgccctgtacgcgcaagaaatgcagcgtatgcaggaagcgggtgaagcgcctactgtgcagtaattactgccggtttcaagaaagcgcctctcggggcgcttttttgttgccggcg < 2:6703919‑M1/1‑1 (MQ=255) cccggcgctgatgctgtcgccggtcaacttcgacgccctgtacgcgcaagaaatgcagcgtatgcaggaagcgggtgaagcgcctactgtgcagtaattactgccggtttcaagaaagcgcctctcggggcgcttttttgttgccggcgc > 1:5723466‑M1/149‑150 (MQ=255) tGCTGGACCGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTT‑GCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGG < 1:1276977‑M1/150‑1 (MQ=255) tGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTT‑GCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGG < 1:6118915‑M1/150‑1 (MQ=255) tGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTT‑GCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGG < 2:4953372‑M1/150‑1 (MQ=255) tGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTT‑GCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGG < 2:5554714‑M1/150‑1 (MQ=255) cggcgctgatgctgtcgccggtcaacttcgacgccctgtacgcgcaagaaatgcagcgtatgcaggaagcgggtgaagcgcctactgtgcagtaattactgccggtttcaagaaagcgcctctcggggcgcttttttgttgccggcGCgg > 1:2475084‑M1/147‑150 (MQ=255) cggcgctgatgctgtcgccggtcaacttcgacgcccggtacgcgcaagaaatgcagcgtatgcaggaagcgggtgaagcgcctactgtgcagtaattacggccggtttcaagaaagcgcctctcggggcgcttttttgttgccggcGCgg > 2:5998706‑M1/147‑150 (MQ=255) gcgctgatgctgtcgccggtcaacttcgacgccctgtacgcgcaagaaatgcagcgtatgcaggaagcgggtgaagcgcctactgtgcagtaattactgccggtttcaagaaagcgcctctcggggcgcttttttgttgccggcGCGGGc > 1:1530257‑M1/145‑150 (MQ=255) gcgctgatgctgtcgccggtcaacttcgacgccctgtacgcgcaagaaatgcagcgtatgcaggaagcgggtgaagcgcctactgtgcagtaattactgccggtttcaagaaagcgcctctcggggcgcttttttgttgccggcGCGGGc > 1:1636473‑M1/145‑150 (MQ=255) gcgctgatgctgtcgccggtcaacttcgacgccctgtacgcgcaagaaatgcagcgtatgcaggaagcgggtgaagcgcctactgtgcagtaattactgccggtttcaagaaagcgcctctcggggcgcttttttgttgccggcGCGGGc > 2:4433149‑M1/145‑150 (MQ=255) ggACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTT‑GCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCT > 1:3395197‑M1/1‑150 (MQ=255) 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cAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTT‑GCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGT‑AAACCCCCTCCAACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCGgtaggagcgggttttcc < 2:3685601‑M2/150‑18 (MQ=255) aaTACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTT‑GCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGT‑AAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTgtaggagcgggtttaccc > 2:1039807‑M2/1‑132 (MQ=255) aCGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTT‑GCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGT‑AAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTgtaggagcgggtttacccgcg < 2:6752441‑M2/150‑22 (MQ=255) ggTGGGGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAAGGGGTTT‑GCCGGGAGCTGTTGTGTTGCCTGTGGGGGCCTCTTCGCGGGT‑AAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaa > 2:2610049‑M2/1‑127 (MQ=255) ggTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTT‑GCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGT‑AAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaa > 1:6808293‑M2/1‑127 (MQ=255) ggTGGCGGGGACGGTGTATGAGGCGGGGCGGCAGAACGGGTTT‑GCGGGGAGCTGATGTTTTGCCTGGGCGGGCCTCTTCGCGGGT‑AAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGAAATCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaa > 2:1322172‑M2/1‑127 (MQ=255) gTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTT‑GCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGT‑AAA > 1:2670921‑M1/1‑87 (MQ=255) cGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTT‑GCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCACTTCGCGGGT‑AAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTgtcggagcgggtttacccgcgaagaggc > 2:6866785‑M2/1‑122 (MQ=255) tGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTT‑GCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGT‑AAAACCCCTACAACGCAGGCCGAGGGAACCGCGCAAAACCCCgtaggagcgggtttaaccgcgcagaggcccc < 2:3060670‑M2/150‑32 (MQ=255) gcgggTGTTTGTGGGGTGGGGGCTG‑ACGGGTTTGGCGGGGCGCTGATGTGTTGCGTGGGGGGGCCTCTTCGGGGTT‑AAACCCGCGCCTCCGCTGGCGTTGGTAAGGGCGAAACCCCGTTTTGTTGGGGTTTTACCCGCGAAGAGGCCcgc < 2:6497057/147‑1 (MQ=255) gtATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTT‑GCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGT‑AAACCCGCTCCTACGCAGGCCGa < 2:2291154/93‑1 (MQ=255) tATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTT‑GCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGT‑AAAACCGCTCCGACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCCATCCCCGGTAGGAGCGGGTTTACCCCCGCAGAGGCCCGCGCCGGca > 2:3595008/1‑150 (MQ=255) gcAGAACGGGTTT‑GCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGTGGGT‑AAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTgtaggagcgggtttacccgcgaa > 1:6018941‑M2/1‑97 (MQ=255) gcAGAACGGGTTT‑GCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGT‑AAAACCGCTCCCAACCACGCCGCGGGGACCGCGCAAAACCCCGTAGGAGCGGGGTTAACCGCCAAGAGGCCCCCGCCGGCAACAAAAAAACGccc > 1:5041375/1‑150 (MQ=255) cTGTTGTGTGGCGTGGGGGGGCCTGTGCGGGGGC‑AACCGCGCTCCTCCGCAGGCCGAGGGACCGGCGCAATCCCCTGTCGGCGGGGGTTTCCCCGCGAAGAGGCCCGCGCCGGCAACAAAAAAGCGCCCCGAGAGGCGCTTTCTTGAAAc < 2:3395197/150‑1 (MQ=255) tGATGTGTGGCCTGGGCGGGCCTCTTCGCGGGT‑AACCCCGCCCCTACGCCGGCCGCGGGAACGGCGCACCCCCCTGTAGGCGGGGGTTTCCCCGCGAAGAGGCCCGCGCCGGCAACAAAAAAGCGCCCCGAGAGGCGCTTTCTTGAAAcc < 2:2107637/150‑1 (MQ=255) ttGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGT‑AAACCCCCACCCACCCACGCCCCGGGGACCGCGCAAAACCCGGTAGGCGCGGGGTTTCCCCCGAAGAGGCCCCCCCCCGCAACAAAAAAGCGCCCCGAACGGCGCGGTCTTGGAAACCGCAGTa > 2:5887688/1‑150 (MQ=255) | AGGTGCTGGACAGCCTGCCGGCCGAGCATCGCCTGCGCCTGCCGATGCGGCCGGGGTGCCGTAGCCTGAACCTGTCCAATACGGTGGCGGTGACGGTGTATGAGGCGTGGCGGCAGAACGGGTTT‑GCCGGGAGCTGATGTGTTGCCTGTGCGGGCCTCTTCGCGGGT‑AAACCCGCTCCTACGCAGGCCGAGGGAACGGCGCAATCCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCCGCGCCGGCAACAAAAAAGCGCCCCGAGAGGCGCTTTCTTGAAACCGGCAGTAATTACTG > NC_002947/5764260‑5764557 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |