New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1143486 = | 260 (0.890) | 21 (0.080) | 9/246 | NT | 8.5% | intergenic (‑62/+103) | arcC/arcB | carbamate kinase/ornithine carbamoyltransferase |
? | NC_002947 | 1143575 = | 216 (0.820) | intergenic (‑151/+14) | arcC/arcB | carbamate kinase/ornithine carbamoyltransferase |
Only 100 of 312 total aligned reads displayed.
TGGAATGTCCTTTAGCGAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTAT > NC_002947/1143426‑1143724 | gTCCTTTCGCTAAAGATTGAATGGAGTGGCGCTGCCCGGATGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGGGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGc < 1:4938097/150‑1 (MQ=255) ccTTTAGCGAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCgg < 2:6277675/150‑1 (MQ=255) cTTTAGCGAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCggg > 2:2232004/1‑150 (MQ=255) tttAGCGAAAGAATGAATGGACTGTCGATGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGAAGATGCGGCAGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCGACCACAGGGCCTGCGGGc > 2:1974898/1‑150 (MQ=255) aaaGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACGGCGGGCTACTtat > 1:488604/1‑150 (MQ=255) aaGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGATGCTGCGGTGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGATATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTtata < 1:464706/150‑1 (MQ=255) aaGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTtata < 2:4562744/150‑1 (MQ=255) aGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAg > 2:3307785/1‑150 (MQ=255) gaatgaatGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACATGACATAATCGATGATTCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTtatata > 2:1960148/1‑148 (MQ=255) aatgaatgGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACGTATAGAt > 1:3343429/1‑150 (MQ=255) aatgGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGc < 2:1877589/150‑1 (MQ=255) tgGACTGTCGCTGCAGGGAAGCTGGGTTGTTCGCTGTGGGTGGGGGCTTGCCCGCGACGAGGCCATACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCa < 1:4326689/150‑1 (MQ=255) tCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACCTCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACGTATAGATCAGCCAGGGTCGa > 1:6617687/1‑150 (MQ=255) tCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGa > 2:6222190/1‑150 (MQ=255) tCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCAGGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGa < 2:2589407/150‑1 (MQ=255) gttgctgggATGCTGGGGTGTTCGGTGTGGGAGGGGGCATGCCCGCTACGCGGCCAGACCTGACATCATCGATGAGGCGGCTGAGGCCTTCGCGGCCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATa < 1:3601725/143‑1 (MQ=255) tGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATAcc > 1:1626138/1‑150 (MQ=255) gCACGGTCGGTGGGGATTTCGCTGGGGGAGCGGCCAGGCCCGCTACGAGCCCCGACCGGACACCACCGATGAGGCGGCTGCCGCCTCCGCGGGCCCGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCa < 1:3033464/150‑1 (MQ=255) 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gAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATc < 2:4909170/150‑1 (MQ=255) gCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGc > 2:2646550/1‑150 (MQ=255) gCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATAAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGc > 1:132274/1‑150 (MQ=255) TGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCCGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCAt < 2:4604210‑M1/150‑1 (MQ=255) TGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGTTGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGTCTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCAtgg > 2:5908416‑M1/1‑149 (MQ=255) 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gcccgctcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTgg > 1:178481‑M2/15‑150 (MQ=255) ccgctcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGcc > 1:3823842‑M2/13‑150 (MQ=255) cgctcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCa < 1:4417906‑M2/139‑1 (MQ=255) cgctcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCa > 2:5727632‑M2/12‑150 (MQ=255) gctcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAg < 2:969525‑M2/140‑1 (MQ=255) gctcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAg > 1:4506861‑M2/11‑150 (MQ=255) ctcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGAGACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAgg < 2:6088707‑M2/141‑1 (MQ=255) tcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGt > 1:789020‑M2/9‑150 (MQ=255) tcccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGt > 1:5666058‑M2/9‑150 (MQ=255) ccacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGAAACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCATTGGCCAGGTcc > 2:2883172‑M2/7‑150 (MQ=255) cacagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCg > 2:4997244‑M2/6‑150 (MQ=255) acagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCgg < 2:471297‑M2/146‑1 (MQ=255) acagGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCgg < 1:6770056‑M2/146‑1 (MQ=255) agGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGt > 2:3409195‑M2/3‑150 (MQ=255) gGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATTGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTa < 2:6808291‑M2/149‑1 (MQ=255) ggACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTAt > 2:6573523/1‑150 (MQ=255) ggACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTAt < 2:6680954/150‑1 (MQ=255) | TGGAATGTCCTTTAGCGAAAGAATGAATGGACTGTCGCTGCACGGAAGCTGCGGAGTTCGCTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGAGGCCAGACCTGACATCATCGATGATGCGGCTGACGCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGACTGCGGGCTACTTATAGATCAGCCAGGGTCGATACCAGGATCGCCTTGATCGTGTGCATGCGGTTTTCCGCCTGCTCGAAGGCGATGCACGCTGGCGACTCGAACACGTCATCGGTCACTTCGATGCCGTTGGCCAGGTCCGGGTAT > NC_002947/1143426‑1143724 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |