New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 1492021 | 126 (0.550) | intergenic (+81/+49) | yhdZ/degS | amino acid ABC transporter ATP‑binding protein/serine endoprotease DegS |
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
CCGGATGACTTCTTCGACCGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTT > NC_002947/1491872‑1492169 | gATGACTTCTTCGACCGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTcct > 2:1966415‑M2/1‑147 (MQ=255) aTGACTTCTTCGACCGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTcctg > 2:4274350‑M2/1‑146 (MQ=255) aTGACTTCTTCGACCGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTcctg > 1:4216982‑M2/1‑146 (MQ=255) 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tttgcgcTGGCTTTGCAGCCTGCTTATTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAActgc < 1:956394/147‑1 (MQ=255) aGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagggctgccgcgcagcccaaacagcatcaatgcaggatctggctgaggaacaacttggtccggtcactgcgcggccggtcgaagaagtcatccggcgc < 2:3677354‑M2/150‑124 (MQ=255) gcgcTGGCTTTGGAGCCTGCGTTAAAcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagggctgccgcgcagcccaaacagcatcaatgcaggatctggctgaggaacaacttggtccggtcactgcgcggccggtcgaagaagtcatccggcgcg < 1:5577533‑M2/150‑125 (MQ=255) cgcTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGcc > 1:3563625/1‑150 (MQ=255) cgcTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCCTGCCCGCGAACGGCAGCAACGCGGCCCTGGGTGTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGcc > 2:4759667/1‑150 (MQ=255) tGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGt > 2:1262081/1‑150 (MQ=255) tttGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTgcg > 1:3246147/1‑150 (MQ=255) tttGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTgcg > 1:4651077/1‑150 (MQ=255) ggAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCAt > 1:2956067/1‑150 (MQ=255) gAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCGTc > 2:3811420/1‑150 (MQ=255) ccTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCAcc > 1:2806292/1‑150 (MQ=255) tGCGTAATTcctgtgggagcgggcgtgcccgcgaagggctgccgcgcagcccaaacagcatcaatgcaggatctggctgaggaacaacttggtccggtcactgcgcggccggtcgaagaagtcatccggcgcggcctgctccacaatctc < 2:1004704‑M2/150‑142 (MQ=255) tGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTc > 2:848337/1‑150 (MQ=255) gCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCg > 1:6655474/1‑150 (MQ=255) gCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCg > 2:2495895/1‑150 (MQ=255) 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aTTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGt > 1:3123575/1‑150 (MQ=255) ttCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGtt > 1:6554132/1‑150 (MQ=255) | CCGGATGACTTCTTCGACCGGCCGCGCAGTGACCGGACCAAGTTGTTCCTCAGCCAGATCCTGCATTGATGCTGTTTGGGCTGCGCGGCAGCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTTTAGCGCTGGCTTTGGAGCCTGCGTAATTCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGGGCCGCAACGCGGCCCTGGGTTTATTTCTCTTCCTGGCTGGCAGCCGGCGCCGGTGGCGGCCGCAGCCCCACCTCGGCGATCAGCTTCAACTGCTGCCCGTTGCGCATCACCTCGATGGTT > NC_002947/1491872‑1492169 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |