| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1504392 = | 79 (0.270) | 30 (0.120) | 11/228 | NT | 30.2% | intergenic (+13/‑153) | trpS/zapE | tryptophan‑‑tRNA ligase/nucleoside triphosphate hydrolase domain‑containing protein |
| ? | NC_002947 | 1504475 = | 73 (0.300) | intergenic (+96/‑70) | trpS/zapE | tryptophan‑‑tRNA ligase/nucleoside triphosphate hydrolase domain‑containing protein | |||||
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
GCGGCCATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAAC‑GGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCATGACGCGGCGCAGGAAACTGCGGTGCG > NC_002947/1504332‑1504624 | gCGGCCATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAACC‑GGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGa < 2:6798399/150‑1 (MQ=255) cATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAAC‑GGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCCCCGGCTTTGGCGGGGTTCGCGGGCCCGCCCGCACCCACAGACTGAtttgc > 2:1544815/1‑147 (MQ=37) aTTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAAC‑GGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCa < 2:430145/150‑1 (MQ=255) tactagCCTGACCGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGTGGCTGCCAAAG‑GGTGGGTGCGGGCGGGCCCGCGAAACTGGCGCCGCGGTGCTTGGCACCGGCTTTGCCGTTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCAtt < 2:1224445/146‑1 (MQ=37) tGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAAC‑GGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTTTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGc < 1:3363073/150‑1 (MQ=255) gAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAAC‑GGTGGGAGCGGGCGTGGCCGCGGAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCCGCTTTTCCGGTGTTAGCCGGCACGCCCCCTCCCCCAGACTGATTGGCAATAATCGGGcc > 1:5613838/1‑150 (MQ=255) aaCGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAAC‑GGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCt < 2:4419571/150‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAAC‑GGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCCCGCCCACAGACTGATTGCCATTAAGAGGGCCTATc > 2:1019725/1‑150 (MQ=255) gAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAAC‑GGTGGGAGCGGGCGGGCCCGCGCAACAGGCGCCGCGGGGCATGGCCCCGGCGTTGGCGGGGTTCGCGGGCCCGCCCCCGCCCACCGACTGGTTGGCCTTAAGCggggcgatg > 1:6837017/1‑144 (MQ=255) gAAGCCTTGGAACCACAGCTGGACTGAGGCTGCCAAAC‑GGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCTAAACTGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGATTTGCCGGTGTTCGCGGCCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATc < 1:5110160/150‑1 (MQ=37) ttGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAAC‑GGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACa < 2:4474718/150‑1 (MQ=255) gCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAAC‑GGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCCAAAAAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCCGCATTGCCGGTGTTGGCGGGCCCGCCCCCGCCCCCACACAGATTGCCAATAAGCGGGCCGATCGCAACCGTg > 2:6057917/1‑150 (MQ=255) cggcggCTGCCACAC‑GGTGGGCGCGGGCGGGCCCGCGAAACCGGCGCCGCGGGGCAGGGCACCGGCTTGGCCGGGGTGCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGtttttt < 2:379105/146‑1 (MQ=37) tGAGACTGCCAAAC‑GGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCCCGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTttg > 2:4508909/1‑150 (MQ=255) gCTGCCAACC‑GGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGc < 2:4122990/150‑1 (MQ=255) ggtgcAAACGGGTGGGCGGGGGGGGGCCCGCCAAACGGGCGCCGCGGGGCTGGGCCCGGGCTTTGGGGGTTTGCGGGGCCACCCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGc < 1:1938934/146‑1 (MQ=255) TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGaa > 2:5111761‑M1/1‑150 (MQ=255) gcggggggGTGCCCGCCCACCCGGGGCCGGGGCGCCGGCCACCGGCTTGGCGGGTGTGGGGGGGCCCGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCG‑TTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCAt < 1:3098832/146‑1 (MQ=255) gcGCGGGCGTGCCCGCGACCCCGGCGCCGCGGTGCATGGCCCCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCCCGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCa > 1:1036018‑M1/3‑150 (MQ=255) CGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGa > 1:1568250‑M1/1‑150 (MQ=255) GGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGAc < 1:4269004‑M1/150‑1 (MQ=255) GGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACt < 2:1268773‑M1/150‑1 (MQ=255) gGTGCCCGCCACCCCGGCGCGGCGGTGCTGGGCAGGGGCTTGGCGGGTGTTCGCGCGCCCCCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTcc > 1:4082021‑M1/2‑150 (MQ=255) 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ccgcgaacaccggcaaagccggtgccatgcaccgcggcgcctgtttcgcgggcacgcccgctcccacAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCTCTTAg > 1:6674299‑M2/68‑150 (MQ=255) ccgcgaacaccggcaaagccggtgccatgcaccgcggcgcctgtttcgcgggcacgcccgctcccacAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAg > 2:5637944‑M2/68‑150 (MQ=255) ccgcgaacaccggcaaagccggtgccatgcaccgcggcgcctgtttcgcgggcacgcccgctcccacAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAg > 1:2485506‑M2/68‑150 (MQ=255) ccgcgaacaccggcaaagccggtgccatgcaccgcggcgcctgtttcgcgggcacgcccgctcccacAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAg > 2:6650397‑M2/68‑150 (MQ=255) CCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAg < 1:6304625‑M1/150‑1 (MQ=255) 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CGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGa < 1:4227797‑M1/150‑1 (MQ=255) CGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGa < 1:2839332‑M1/150‑1 (MQ=255) CGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGa < 1:3177079‑M1/150‑1 (MQ=255) gcgaacaccggcaaagccggtgccatgcaccgcggcgcctgtttcgcgggcacgcccgctcccacAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGaa > 2:4760940‑M2/66‑150 (MQ=255) GCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGaa < 1:696798‑M1/150‑1 (MQ=255) 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gtgtTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCAt > 1:5549487/1‑150 (MQ=255) ggagcgggcgtgcccgctcccacAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCATGAc > 2:4908792‑M2/24‑150 (MQ=255) tcgcgggcacgcccgctcccacAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCATGAcg > 1:6702792‑M2/23‑150 (MQ=255) gcgggcgtgcccgctcccacAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCATGAcgcg > 2:5547226‑M2/21‑150 (MQ=255) gcgggcacgcccgctcccacAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCATGAcgcg > 1:4939261‑M2/21‑150 (MQ=255) 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acgcccgctcccacAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCATGACGCGGCGCAg > 1:6523541‑M2/15‑150 (MQ=255) acccccgctcccacAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCATGACGCGGCGCAg < 1:1821478‑M2/136‑1 (MQ=255) ccgctcccacAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCATGACGCGGCGCAGGaaa > 1:3279992‑M2/11‑150 (MQ=255) ccgctcccacAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCATGACGCGGCGCAGGaaa > 1:4007204‑M2/11‑150 (MQ=255) gctcccacAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCATGACGCGGCGCAGGAAACt > 2:3868399‑M2/9‑150 (MQ=255) cccacAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCACGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCATGACGCGGCGCAGGAAACTGCg < 1:6172309‑M2/145‑1 (MQ=255) ccacAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCATGACGCGGCGCAGGAAACTGCgg > 2:6772500‑M2/5‑150 (MQ=255) ccacAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCGATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCATGACGCGGCGCAGGAAACTGcgt < 2:2963047‑M2/146‑2 (MQ=255) acAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCATGACGCGGCGCAGGAAACTGCGGTg > 2:1749391‑M2/3‑150 (MQ=255) acAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCATGACGCGGCGCAGGAAACTGCGGTg > 2:2024582‑M2/3‑150 (MQ=255) aGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCATGACGCGGCGCAGGAAACTGCGGTGCg < 2:5028618/150‑1 (MQ=255) | GCGGCCATTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAAC‑GGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACGTCCCGACTTCTTCCATGACGCGGCGCAGGAAACTGCGGTGCG > NC_002947/1504332‑1504624 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |