New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3582417 = | 232 (0.790) | 11 (0.040) | 8/246 | NT | 5.0% | intergenic (+19/‑161) | PP_3157/PP_3158 | inositol monophosphatase family protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3582472 = | 209 (0.790) | intergenic (+74/‑106) | PP_3157/PP_3158 | inositol monophosphatase family protein/hypothetical protein |
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
TGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTACGCGAATTTCCTCCCCCGCCTGC > NC_002947/3582323‑3582620 | tGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGgccg > 2:2348806/1‑150 (MQ=255) ggcggctgcgccgggagtcagcgcggcctggccaagcatagagcccgaaaatgggaaaaagtgcggtggctggagagaatgcaaacctgtggcGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGgccgc > 2:4264207‑M1/94‑150 (MQ=255) ggggTGTGTGGTGGCCTGTGGTTACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGTGTTGTTGCGCCACGCAATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCca < 1:3945438/149‑1 (MQ=255) gtgtgGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACACCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGt > 2:426738/1‑150 (MQ=255) tggtggCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTg > 2:826367/1‑150 (MQ=255) gtggCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCTTGCGCAGGTGCTGGAGTTGTTGCGCCACGCCATGTTATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCa < 2:3430294/150‑1 (MQ=255) gtggCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCa > 2:1903237/1‑150 (MQ=255) gtggCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCa > 1:3735959/1‑150 (MQ=255) gCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATtc > 1:6739419/1‑150 (MQ=255) cTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCTTGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGGGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATtctc < 1:1101594/150‑1 (MQ=255) cTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATtctc > 1:5064067/1‑150 (MQ=255) cTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCGTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATtctc > 2:2112079/1‑150 (MQ=255) tgtgGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATtctct > 1:4328178/1‑150 (MQ=255) gtggtgACCCTGTGCTGCATGCGCTGGTGGTGGTTTTGTTGCGCCACGCCTTGTGATCGGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGGGGGCGTGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCTAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATtctctc < 2:2477201/150‑1 (MQ=255) tggtgACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTcc < 2:1422406/150‑1 (MQ=255) ggtgACCCTGTGCTGCCTGCGCTGGTGCGGGAGATGTTGCGCCACGCCCTGTGAGCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTGGCGGGCGAGTCCCTTGTTGTGGGAGGGGGTTACCCGCGATGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCa < 2:5482280/150‑1 (MQ=255) tgACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGc > 1:6171802/1‑150 (MQ=255) aCCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCa > 2:6273664/1‑150 (MQ=255) 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ccTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGGTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCAcc > 2:2299799/1‑150 (MQ=255) tgtgCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGc > 1:307028/1‑150 (MQ=255) tgtgCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGc > 2:537379/1‑150 (MQ=255) tgctgcATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCAc > 2:5732388/1‑150 (MQ=255) tgcATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACttt > 1:1943826/1‑150 (MQ=255) 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gCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTAcg > 2:955458/1‑150 (MQ=255) cGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTAcgc > 1:6686027/1‑150 (MQ=255) gTTACCCGCGAAGAGGTCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTACGCGaa > 1:6613561/1‑150 (MQ=255) gTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTACGCGaa > 1:972183/1‑150 (MQ=255) cccgcgaagaggccGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTACGCGAATTtc > 2:2027777‑M2/15‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggccGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTACGCGAATTtcc > 1:4718931‑M2/14‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggccGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTACGCGAATTtcc > 2:3884037‑M2/14‑150 (MQ=255) gcgaagaggccGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTACGCGAATTtcctc > 1:45649‑M2/12‑150 (MQ=255) ggccGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTACGCGAATTTCCTCCCCCGcc < 1:2112079‑M2/146‑1 (MQ=255) gccGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTACGCGAATTTCCTCCCCCGCCt < 2:4075827‑M2/147‑1 (MQ=255) cGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTACGCGAATTTCCTCCCCCGCCTGc > 1:4251990‑M2/2‑150 (MQ=255) | TGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCGCGCTGACTCCCGGCGCAGCCGCCCAATATCGACCCGGTGCCGATGGTTGCAAGCTACGCGAATTTCCTCCCCCGCCTGC > NC_002947/3582323‑3582620 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |