New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4164091 | 138 (0.470) | 31 (0.120) | 15/242 | NT | 19.4% | intergenic (+46/‑163) | PP_3661/PP_3662 | membrane protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 4164119 | 136 (0.530) | intergenic (+74/‑135) | PP_3661/PP_3662 | membrane protein/hypothetical protein |
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
GTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCAT > NC_002947/4163972‑4164268 | tGCGATCCACAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcct > 2:6516795‑M2/1‑147 (MQ=255) gggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaacctggagaccgagtcggCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGt > 1:6158826‑M1/88‑150 (MQ=255) gtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAg > 1:6374682‑M1/86‑150 (MQ=255) aTCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCGGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtag > 1:5756120‑M2/1‑143 (MQ=255) ccTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAATCCCGCTGCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtagga > 1:972086‑M2/1‑141 (MQ=255) aaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGa > 2:6600960‑M1/84‑150 (MQ=255) aaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaacctggagaccgagtcggCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGa > 1:2887256‑M1/84‑150 (MQ=255) cTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAAACCCCTCCAACACGGGGGTGGTGCCCAGAAGACGGCAAGGCCccgggaggag < 2:4993519‑M2/150‑11 (MQ=255) aacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTGAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGc > 1:1050816‑M1/82‑150 (MQ=255) aacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGc > 1:1696640‑M1/82‑150 (MQ=255) ggtaaaacatccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgactggagaccgagtcggCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCgg > 1:950278‑M1/80‑150 (MQ=255) catccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCgg > 1:5077780‑M1/80‑150 (MQ=255) aaCCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagcgg > 1:6018192‑M2/1‑137 (MQ=255) atccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCggg > 1:4289448‑M1/79‑150 (MQ=255) tccttctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTGAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGt > 1:1363252‑M1/78‑150 (MQ=255) ccTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGGTGCGTAG‑CGGGGAAACACCCACCAAAACGTGGGTGGTGCCCCGAACACCGCCACGCCCCCGGAGGGGCgggg > 2:1985643/1‑149 (MQ=255) cTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgt > 1:5220807‑M2/1‑134 (MQ=255) cTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgt < 2:5220807‑M2/139‑6 (MQ=255) gtgGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCa < 2:1800126/150‑1 (MQ=255) tgGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGGGGGGTCGCCGGGTAAAACC‑CACCAACAGGTGGGTGGTGCCCAGAATAACGCCAGGCCCCCGGGGGAGCCGGTTGAc > 1:2189719/1‑150 (MQ=255) ctttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCAcc > 2:4045439‑M1/73‑150 (MQ=255) tttgacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCAccc > 2:241360‑M1/72‑150 (MQ=255) gCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCGGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCAccc < 1:2441218/150‑1 (MQ=255) gacaccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCgg < 2:2223846‑M1/71‑1 (MQ=255) ttGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa < 2:5204258/150‑1 (MQ=255) ttGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa < 1:4431366/150‑1 (MQ=255) caccaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa > 1:3805952‑M1/67‑150 (MQ=255) accaccataccgagaaatgtggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTGAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGccc > 2:634888‑M1/66‑124 (MQ=255) gggggggCTGGCGATTACGCTGGGGGTGCAGACGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑GGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAgcag < 1:2464215/149‑1 (MQ=255) ggggggCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAgcagg < 1:2319665/150‑1 (MQ=255) ggggggCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAgcagg < 2:5275735/150‑1 (MQ=255) tGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGGGGGTTGG‑CGGGTGAAAACCCTCCGACACGTTGGTGGTGGCCGGAAGACCGCCAGGCCCCGGGAGGAGCGGGGTGACCCCCGAAccaggcacggcg > 2:3706103/1‑145 (MQ=255) ttACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACAGAGTCGGGGGCTTCGCCGGGGAAACCC‑CCCCGACACGTGGGGGGGGGCCGGAAGACGGCAAGGCCCCCGGGGGAGCGGGGTGACCCCCCAAGCACGCCGCTccggggga > 2:1199445/1‑143 (MQ=255) tACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCaa < 2:2056397/150‑1 (MQ=255) ggggacggcaacgtggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagtcggCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCGTGTTGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTTGGTCTCaa > 1:832097‑M1/48‑150 (MQ=255) tggacggcaacgaggggggctgtgaaaaaccttgagaccgagctgcCTGCTTCG‑CGGGTGAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCgg < 1:369493‑M1/71‑1 (MQ=255) ccccGGGGGGTGCAGACGCTGTGGGGCTGACTGGACACCGCGTCGGCTGCTGCG‑CGGTTAAACCCGCTCCTCCCGGTGGGTGCTGCCGTGACGACGGCAAGGCCCCTGTAGGCGCGGGTTCCCCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAg < 1:3527573/149‑1 (MQ=255) tGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTcaca < 2:2144411/150‑1 (MQ=255) 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cTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTAc > 2:5695859/1‑150 (MQ=255) cTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTAc > 1:631984/1‑150 (MQ=255) tACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCcctgtaggagcgggtttacccgcgaagcagccgactcggtctccagtcagcccaacagcttctgcacccccagggtaatcgccagccccccgccaaccagccacaggttgaggatc < 2:5536199‑M2/150‑117 (MQ=255) tACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTAcc < 1:5942387/150‑1 (MQ=255) tgggtgCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGcaca < 2:963788/150‑1 (MQ=255) 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tGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAg > 2:6411771/1‑150 (MQ=255) gAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGa > 1:3483564/1‑150 (MQ=255) aaGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGACAGACTTAGAt > 2:160146/1‑150 (MQ=255) ggCAAGGCCcctgtaggagcgggttcacccgcgaagcaggcgactcggtctccagtcagcccaacagcttctgcacccccagggtaatcgccagccccccgccaaccagccacaggttgaggatcgcaccggtggccagcgcccgtggcc < 2:381514‑M2/150‑142 (MQ=255) ggCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCaaa < 1:566484/110‑1 (MQ=255) 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GTGCGATCCTCAACCTGTGGCTGGTTGGCGGGGGGCTGGCGATTACCCTGGGGGTGCAGAAGCTGTTGGGCTGACTGGAGACCGAGTCGGCTGCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTGGGTGCTGCCCTGAAGACGGCAAGGCCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGCAGGCAGCTCGGTCTCAAGGTTTTTCACAGCCCCCCTCGTTGCCGTCCACATTTCTCGGTATGGTGGTGTCAAAGAAGGATGTTTTACCCGCACAGGAAAGACTTAGATGCCTCAACGCCAT > NC_002947/4163972‑4164268 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |