New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4588487 | 148 (0.510) | 26 (0.100) | 11/234 | NT | 18.7% | intergenic (‑67/+104) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
? | NC_002947 | = 4588548 | 99 (0.400) | intergenic (‑128/+43) | treSB/glgE | bifunctional trehalose synthase B/maltokinase/alpha‑1,4‑glucan:maltose‑1‑phosphate maltosyltransferase |
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
CCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTC > NC_002947/4588399‑4588698 | cctggcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccggtaacaaggttcagactgtgccccccCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGa > 1:4053894‑M1/70‑150 (MQ=255) ccGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGa < 2:3960146/150‑1 (MQ=255) ccGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGa > 1:2454236/1‑150 (MQ=255) ctggcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaacaaggttcagactgtgccccccCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGa > 1:2097552‑M1/69‑150 (MQ=255) gggcgggAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAta < 1:4856127‑M2/150‑3 (MQ=255) ggctcctgcctttcgggatctggcgcttctaaaatgccctttaacaaggttctgactgggccccccCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGTCACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATaa > 2:4825634‑M1/67‑150 (MQ=255) gcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaacaaggttcagactgtgccccctCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATaaa > 1:5542963‑M1/66‑150 (MQ=255) gcacctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaacaaggttcagactgtgccccccCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATaaa > 1:3579501‑M1/66‑150 (MQ=255) acctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccggtaacaaggttccgacggtgccccccCCCCCCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCGTCGCCGGTGTTCGCGGATAAAc > 2:2256784‑M1/64‑150 (MQ=255) ggAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaaccc > 1:323614‑M2/1‑143 (MQ=255) ggAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTGACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaaccc > 1:5276519‑M2/1‑143 (MQ=255) cctgccgttcggcatctggcgcatcgaaaaagcccgttaacaaggttcagactgtgccccccCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAAccc > 1:6817977‑M1/63‑150 (MQ=255) aaCGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgc > 2:5055038‑M2/1‑141 (MQ=255) gCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcc < 1:999429‑M2/150‑13 (MQ=255) gCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcc < 2:4186410‑M2/150‑13 (MQ=255) cTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcct > 1:4764223‑M2/1‑137 (MQ=255) ggCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacg < 2:6844580‑M2/150‑17 (MQ=255) ccATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacggg > 1:4727252‑M2/1‑132 (MQ=255) cATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacgggg > 2:935368‑M2/1‑131 (MQ=255) cATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGATCGATACCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGAGAAGATGACACAGCGGTGCCGAGGTGCATTGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAaaaacacgctcctacgggg < 1:2603792‑M2/150‑20 (MQ=255) tgtgCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGTTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacggggga > 2:3455845‑M2/1‑129 (MQ=255) gtgCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCACGGTGCCGAGGTACATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑ggggggg > 2:6073293/1‑150 (MQ=255) cTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCGAC‑‑GGGGGGGGGGGcaccg > 1:1940325/1‑148 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTCC‑‑gggggggggggggcaca > 1:5355808/1‑144 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑ggggggggggcccagtc > 1:1575119/1‑143 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGccccgg > 1:2960517/1‑145 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGt > 1:2617007/1‑150 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGt > 2:3972601/1‑150 (MQ=255) tttCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGt > 1:6192869/1‑150 (MQ=255) tCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCCCAGTCt > 1:1261751/1‑150 (MQ=255) aaTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGa > 2:6452896/1‑150 (MQ=255) aaTTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGa > 2:861215/1‑150 (MQ=255) caGACACCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCCCAGTCTGTACCTGGTTAAc > 1:2739988/1‑150 (MQ=255) aGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACG‑GGGGGGGGGGGCCCCGACGGAACCTTGTAAAc > 2:6646234/1‑150 (MQ=38) aGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAAACCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTTAACCTTGTTaagt > 1:1058860/1‑148 (MQ=255) cTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACGGGGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCGTGTTAAAGGGCttttta > 1:579574/1‑149 (MQ=38) cTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCCCAGTCAGAACCGTGTTAAAGGGCTTTTTGGa > 1:3139745/1‑150 (MQ=38) tGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACG‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTTTTAAAGGGCTTTTTAGAt > 1:5943975/1‑150 (MQ=38) gCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCCCAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATgc > 2:5349891/1‑150 (MQ=255) tCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACG‑GGGGGGGGGGGCCCAGGCTGAACCGTGTTAACGGGCTTTTTCGATgcg > 1:4994711/1‑150 (MQ=38) tCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACG‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTAGATgcg > 1:5471448/1‑150 (MQ=255) tCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCGTTTTCGATgcgc > 2:1149374/1‑150 (MQ=255) tCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCAGGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCCCAGTCTGAACCGTGTGAACGGGCTGTTTCGATgcgc > 2:2828559/1‑150 (MQ=39) tCGATCCCAC‑GTAGTAGAGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGGGCAGGGCACCGGCTTCGCCGGGGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAG‑‑GGGGGGGGGGGCCCTGGCTGAACCGGGTTATCGGGCTGTGTCGCTgcgg > 2:5438333/1‑149 (MQ=255) gATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCa > 1:5098082/1‑150 (MQ=255) gATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCa > 1:1631664/1‑150 (MQ=255) CCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGG‑CACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATg < 2:3317146‑M1/150‑1 (MQ=255) TAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCCCAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGaa < 1:2282586‑M1/150‑1 (MQ=255) GAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACgg < 2:4634165‑M1/150‑1 (MQ=255) AGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGc < 1:2354319‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCa < 1:6387309‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCa < 2:6438136‑M1/150‑1 (MQ=255) cGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttc < 2:3196247‑M2/150‑82 (MQ=255) gggTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcc < 2:2269504‑M2/150‑83 (MQ=255) GGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGt < 2:1680871‑M1/150‑1 (MQ=255) GTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTg < 1:2547857‑M1/150‑1 (MQ=255) GTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTg < 2:756466‑M1/150‑1 (MQ=255) ttACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacggggggtcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccgcc < 2:6276746‑M2/150‑87 (MQ=255) ttACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacggggggtcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccgcc < 2:3026637‑M2/150‑87 (MQ=255) TTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCCCAGTCGGAACAATGTTAACGGGCTTTTTAGATGCGCCAGATGCCGAGCGGCAGGGGcc < 2:4474624‑M1/150‑1 (MQ=255) tACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccgccc < 1:1182029‑M2/150‑88 (MQ=255) ACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAg < 1:3420865‑M1/150‑1 (MQ=255) ccGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccgcccgg > 2:6773460‑M2/1‑60 (MQ=255) ccGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccgcccggc < 1:4432972‑M2/150‑91 (MQ=255) ccGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccgcccggc < 1:4281664‑M2/150‑91 (MQ=255) ccGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAggg > 2:5872664/1‑150 (MQ=255) ccGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGATCGCGGAtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgccattgaaaggagtcgcacatggccacgcgttcccgcccggc < 1:4197378‑M2/150‑91 (MQ=255) gcgAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccgcccggcag < 2:5868927‑M2/150‑93 (MQ=255) gcgAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTACCGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGct > 2:6585451/1‑150 (MQ=255) cgAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGctc > 1:2653581/1‑150 (MQ=255) gAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCACGGctca > 2:5582028/1‑149 (MQ=255) gATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccgcccggcagccttc < 1:744127‑M2/150‑98 (MQ=255) aTGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGGTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATgc > 1:5275327/1‑150 (MQ=255) atgcacctcGGCACCGCGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGAtaaacccgctcctacgggggatcgagcaagctcggatgtctgtgcatgcaattgaaaggagtcgcacatggccaagcgttcccgcccggcagccttcat < 1:6234793‑M2/147‑100 (MQ=255) atgcacCTCGGCACCGCGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATgcg > 2:2726843/4‑150 (MQ=38) gACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACCGTCTGAACCGTGTTAACCGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCCGGTGCCAGGGCGCTATgcgc > 2:4350951/1‑150 (MQ=38) acCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCCCAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATc > 2:2775550/1‑150 (MQ=255) acCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATc > 1:370926/1‑150 (MQ=255) acCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATc > 2:155400/1‑150 (MQ=255) cgcgGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCa > 1:5563095/1‑150 (MQ=255) gcgGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACCGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCAt > 1:989370/1‑150 (MQ=255) cGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCGGAACCTTGGTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCGCTATGCGCATCCATTGGGtgt > 2:568002/1‑148 (MQ=255) gAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCGCTATGCGCATCCAGTGGGTCtt > 2:5319753/1‑150 (MQ=255) gCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGt > 2:3623626/1‑150 (MQ=255) cATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACG‑GGGGGGGGGGGCCCCGTATGAACCTTTTTAACGGGCTTTTTCGTTGCGCCCGATGCCGAACGGAAGTTGCCAGGGGGCAATCCGCAACCATTGGGGATTGcgga > 1:4741775/1‑147 (MQ=21) cATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCCCAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTa > 2:3675249/1‑150 (MQ=255) cATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTa > 1:1105127/1‑150 (MQ=255) gaacACCGGCGAAGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTAcc > 1:4643879/4‑150 (MQ=255) gaacACCGGCGAAGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTAcc > 1:2041621/4‑150 (MQ=255) gCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGGACAGTCTGAACCGTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCGATGCGCATCCCTTGGGTCTTGCCGTACCAc > 1:2546011/1‑150 (MQ=255) cTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTACG‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTAGGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAg > 2:6113065/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑‑GGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCgg > 2:1720372/1‑150 (MQ=255) ccGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTgg < 1:278031/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCa > 2:1414221/1‑109 (MQ=255) ttCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCa < 1:1414221/109‑1 (MQ=255) cgcgGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTtcat > 1:3958518/1‑150 (MQ=255) ggATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAg < 1:6438136/150‑1 (MQ=255) gATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCGTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCGATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCCTCAgg > 1:915427/1‑150 (MQ=255) aTAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAggg > 2:1100629/1‑149 (MQ=255) aTAAACCCGCTCCTAC‑‑‑GGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCCTCAGGTc > 1:6776624/1‑150 (MQ=255) | CCGGGCGGGAACGCTTGGCCATGTGCGACTCCTTTCAATTGCATGCACAGACATCCGAGCTTGCTCGATCCCCC‑GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGATGACACCGCGGTGCCGAGGTGCATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGATAAACCCGCTCCTAC‑‑GGGGGGGGGGGCACAGTCTGAACCTTGTTAACGGGCTTTTTCGATGCGCCAGATGCCGAACGGCAGGTGCCAGGGCTCTATGCGCATCCATTGGGTCTTGCCGTACCACGACCAGCGGTGGCCGTTCATCAGGTC > NC_002947/4588399‑4588698 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |