New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4850137 | 145 (0.490) | 30 (0.120) | 13/242 | NT | 17.4% | intergenic (+29/‑108) | PP_4260/PP_4261 | hypothetical protein/cation‑transporting P‑type ATPase |
? | NC_002947 | = 4850198 | 157 (0.610) | intergenic (+90/‑47) | PP_4260/PP_4261 | hypothetical protein/cation‑transporting P‑type ATPase |
Only 100 of 219 total aligned reads displayed.
CATGGTGTGACCTTGCAGTTGGGTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCG > NC_002947/4850049‑4850347 | aTGGTGTGACCTTGCAGTTGGGTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCCCGCCCCCCAAAGCCATAGCACCGGCAAACGTAATTCCACGTCACACGCATTCGCGCGCGCg < 2:5910648‑M2/150‑2 (MQ=255) tGGTGTGACCTTGCAGTTGGGTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCGGGCCCCCGCATGCGATAGGTCAGGGCAAGGGAGTTGAAGGTCGGGCGCCTTGGCGGgcgccg > 1:1794155/1‑148 (MQ=255) gtgACCTTGCAGTTGGGTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCgcccgc > 2:1297162‑M2/1‑144 (MQ=255) gACCTTGCAGTTGGGTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCgcccgctc > 1:975811‑M2/1‑142 (MQ=255) cTTGCAGTTGGGTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCgcccgctccca > 2:6191877‑M2/1‑139 (MQ=255) tgccggtGGGTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCACCAGTAGCAACACCGCAACTCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCGCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCcaca < 2:5769318/144‑1 (MQ=255) tGGGTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGttt < 2:2047548/150‑1 (MQ=255) gTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAATGCGGTAGCTCAGGCCAAGGTATTTCCAGGTCTGTCGCATTAGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTccg > 1:6258507/1‑149 (MQ=39) gTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGGTTCCt > 1:6772113/1‑150 (MQ=255) tGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGGGCGCCCCCGCCAGCGCGGGGGCCGGGCAGGGTGTTTCCCGGTGTGTCGCGGGCGCGGGCGCGCCCCCGCCCCCCGGGGGTCCTa > 1:3826494/1‑150 (MQ=255) gACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACCGTAGCAACACCGAAATTCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATCGCTCAGGCAAAGTTATTTCCAGGTCTGACGCTTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTAt < 1:4212209/150‑1 (MQ=255) ccGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCACCAGTAGCAACACCGCACATCCCGGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCCGGCAAAGGTATTTCCAGGTCGGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATc < 2:6542079/149‑1 (MQ=255) aaGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGc < 2:3636292/150‑1 (MQ=255) aaGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGCAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGAGAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGc < 2:5858962/150‑1 (MQ=255) gCCCTGCATGGCGCCCAACACCAACAGTAGCAACACCGAAAAGCCCTGTGGGCGCGGCCCCGCCCGCGAATGCTATAGCTCAGGCAACGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCt < 1:2385948/150‑1 (MQ=255) cTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATTCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAg < 1:4555438/150‑1 (MQ=255) gcCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCACCCACCGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTg > 2:1072960/1‑150 (MQ=255) gAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGccc > 2:1620807/1‑150 (MQ=255) 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tttCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCg < 2:3837805/150‑1 (MQ=255) ttCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCgg > 1:3859001/1‑150 (MQ=255) ttCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCgg < 2:5174589/150‑1 (MQ=255) tCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGc < 2:5893435/150‑1 (MQ=255) aGGTCTGACGCATTCGCGGGCGTgcccgctcccacagggatttgcggtgttgctactgttggtgttcggcgccttgcagggcttcgtcacccaactgcaaggtcacaccatgcgccactttttcctcttcgaacaggcgccatacctggc > 2:4963452‑M2/1‑23 (MQ=255) tGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCg > 2:5023867/1‑150 (MQ=255) gCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCCCCGGCAGCCGCGTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGccg > 1:4694988/1‑148 (MQ=255) gCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAg > 1:1719489/1‑150 (MQ=255) cATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAACAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCGTCACCGCCGTGGTCCGCGGCCAGCCCCGGCAgg > 1:5339363/1‑149 (MQ=255) aTTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGtt > 2:4422838/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTc > 1:5550132/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTc > 1:3292679/1‑150 (MQ=255) tCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTct < 1:1618670/150‑1 (MQ=255) tCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTct < 2:1686623/150‑1 (MQ=255) gagcgggCACgcccgctcccacagggatttgcggtgttgctactgttggtgttcggcgccttgcagggcttcgtcacccaactgcaaggtcacaccatgcgccactttttcctcttcgaacaggcgccatacctggcccccttcgctacc < 1:6398155‑M2/148‑141 (MQ=255) cgcgGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTctg < 1:2164859/150‑1 (MQ=255) gcgGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTctgc < 1:2236744/150‑1 (MQ=255) gcgGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTctgc > 2:1561823/1‑150 (MQ=255) cgGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTctgct < 2:1775271/150‑1 (MQ=255) cgGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCGGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTctgct < 2:4034386/150‑1 (MQ=255) gcgcgcCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCACTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGcc > 1:5096001/1‑150 (MQ=255) cgcccgctcccacagggatttgcggtgttgctactgttggtgttcggcgccttgcagggcttcgtcacccaactgcaaggtcacaccatgcgccactttttcctcttcgaacaggcaccatacctggcccccttcgctacccagcagttc > 1:4039907‑M2/1‑1 (MQ=255) | CATGGTGTGACCTTGCAGTTGGGTGACGAAGCCCTGCAAGGCGCCGAACACCAACAGTAGCAACACCGCAAATCCCTGTGGGAGCGGGCACGCCCGCGAATGCGATAGCTCAGGCAAAGGTATTTCCAGGTCTGACGCATTCGCGGGCGCGCCCGCTCCCACAGGGTTTCCTATCTGCCTGAGCAGTGTCTGCCCTATGACCCAACCGACCCCCTGCTACCACTGCGCCCTGCCCGTCCCCACCGGCAGCCGCTTCACCGCCGTGGTCCTCGGCCAGCCCCGGCAGTTCTGCTGCCCCG > NC_002947/4850049‑4850347 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |