| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5293391 = | 191 (0.650) | 12 (0.050) | 8/214 | NT | 9.3% | intergenic (‑75/+109) | PP_4660/mdaB | LysR family transcriptional regulator/drug activity modulator B |
| ? | NC_002947 | 5293485 = | 84 (0.370) | intergenic (‑169/+15) | PP_4660/mdaB | LysR family transcriptional regulator/drug activity modulator B | |||||
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
GGATTAGATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGTTGGCCTT > NC_002947/5293344‑5293634 | taTACCCGCTGGTCGCGCCCATGGCCTGGGGCGCGTGTTTGGGCCTCTGCGGGGGGTGGCCCGCGCCCACCATTACGGCAATGTCCTTGAACCCTGCGTAATACCTGTGGGTGGGGGAATGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATaaaa < 2:2990880/149‑1 (MQ=255) gATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCACCCACAAGTACTGCAAAGTCCATGAAAACAGCGTAATACCAGGGGGAGCCGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCCGTACAGACATaaaa > 2:4394101/1‑150 (MQ=255) gCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTTAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACtgt < 2:5621093/150‑1 (MQ=255) gTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTTCCCGCTCCCACAAGTAAGGCAAACTCCATTAAACCAGCGGAATACCTGTGGGCGCGGGCAAGCCCGCGCAGAGGCCGGTACAGACAAAAAAATACAGTGccg > 2:4009622/1‑149 (MQ=255) gcggCCAAGGCCAGCGGCGCCTTTATGGGCCTCTTCGGGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAACGTCATTGAAACGTGCGTAATACGTGTGGGAGGGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGc < 2:4041098/148‑1 (MQ=38) cAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAac > 2:6155994/1‑150 (MQ=255) gTCCTGGGGCGCCTGTTTGGGCCTCTTCGCGGGTTTGCCCGCTCCCACACGTACTGAAATGTCCTTTAACCCTGCTTATTACCTTTGGGAGGGGGAAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACAcc < 2:75607/150‑1 (MQ=255) gTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGGGTGCCCCCTACCACAAGTACTGCAAAGTCCGTGAAACCAGCGTAATACCGGGGGGTGCGGGCCAGCCCCCGCCCAGGCCGGTACCGACAAAAAAATACTGTGGCTTGCCCAACAcc > 2:2386009/1‑150 (MQ=255) ctCCAGCGGCGCCTGTTTGGGCCTGTTGGCGGGCTTGCCCGGTCCCACAAGTTGAGCATAGTCCTTCAACCGTGCGTAATACGTGTGGTAGCGGGCATGCGCGGGAAGAGGCCGGTACTGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCTAACAcc < 2:5440457/149‑1 (MQ=255) cctggggcgCCTGTTTGGGCCTCTTCGCGGGGTTGCCCGCACCCACAAGTACTGCAACGTCCTTGAAACCTGCGTAAGACCTGGGGTTGCGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCtt < 2:4209399/145‑1 (MQ=255) aGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCTCCCACAAGTACTTGCAAGTCCGTGAAACCGGCGTAATAACTGGGGGGGCGGGGAAGCCCCCGGAGAGGCCGGGACAGACAAAAAAATAATGTGCCTTGGCAAACAccgagt > 2:267823/1‑146 (MQ=255) gcggcgCCTGTAGGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACGGCAAAGTCCTTGAAACCTGCTTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTc < 2:4873626/150‑1 (MQ=255) cgcCTTTATGGGCCTCTCCGGGGGCTTGCCCGCTCCCAAAAGTACTGAAAAGTCCTTTAAACCTGCTTACTCCCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGa < 2:3530318/150‑1 (MQ=38) cgcCGGTAGGGGCCCCTCCGCGGGCTGGCCCGCCCCCCCAAGAACTCCAACCCCCTTAAACCCTGCGAAATACCGGTGGGCGCGGGAACGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGa < 1:3188169/150‑1 (MQ=255) gcCTTTAGGGGCCTCTTCGGGGGCTTGCCCGCCCCCACACGTACTGCAACGTCCTTGAACCCTGCGTAATACCGGGGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGAt < 2:2031505/150‑1 (MQ=38) cTGTAGGGGCCTCTGCGGGGGCTGGCCCGCTCCCACATGTACCGAAACGGCCTTCAACCCTGGGTAATACCTGTGGGAGGGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATgg < 2:98605/150‑1 (MQ=37) gggCCTCTTCGGGGGCTTGCCCGCTCCCACACTTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGAAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCa < 2:3523105/150‑1 (MQ=255) ggCCTCTGGGGGGGCGTGCCGGCCCCCACCAGTACTGCAACGCCGTGCAAACCTGGTTATTCCCGGTGGGTGCGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTCGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCAt < 2:1995149/150‑1 (MQ=255) 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CGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCaa < 1:4460793‑M1/150‑1 (MQ=255) TTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAAcgccg < 2:5486402‑M1/150‑1 (MQ=255) CCCGCTCCCACACGTACTGCAAAGTCCTTGAACCCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGccgccg > 2:3885596‑M1/1‑150 (MQ=255) ccgctcccacaggtattacgcaggtttcaaggactttgcagtacttgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCgg > 2:4074519‑M2/76‑150 (MQ=255) ccgctcccacaggtattacgcaggtttcaaggactttgcagtacttgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCgg > 2:4919369‑M2/76‑150 (MQ=255) CCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTCCAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCgg < 2:5039933‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCgg < 1:533813‑M1/150‑1 (MQ=255) cgctcccacaggtattacgcaggtttcaaggactttgcagtacttgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGc > 2:4288047‑M2/75‑150 (MQ=255) CGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGc < 1:1837036‑M1/150‑1 (MQ=255) ctcccacaggtattacgcaggtttcaaggactttgcagtacttgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGcac > 1:4247261‑M2/73‑150 (MQ=255) tcccacaggtattacgcaggtttcaaggactttgcagtacttgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGcaca > 2:6488774‑M2/72‑150 (MQ=255) ccacaggtattacgcaggtttcaaggactttgcagtacttgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATc > 2:1115102‑M2/70‑150 (MQ=255) ccacaggtattacgcaggtttcaaggactttgcagtacttgtgggagcgggcaagcccgcgaagaggccAGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATc > 1:3596175‑M2/70‑150 (MQ=255) CCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATc < 1:6483384‑M1/150‑1 (MQ=255) CCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATc < 1:738395‑M1/150‑1 (MQ=255) 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agcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGt > 2:2061223‑M2/25‑150 (MQ=255) gcgggcaagcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTc > 2:2282751‑M2/24‑150 (MQ=255) ggcttgcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATg > 1:3322206‑M2/21‑150 (MQ=255) cccccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCa < 1:267823‑M2/134‑1 (MQ=255) agcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCa < 2:5888304‑M2/134‑1 (MQ=255) agcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCa < 1:5415065‑M2/134‑1 (MQ=255) gcccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAg > 1:144100‑M2/16‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGa > 2:4637403‑M2/14‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGa > 1:1317746‑M2/14‑150 (MQ=255) ccgcgaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGa < 1:6794426‑M2/137‑1 (MQ=255) gaagaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTg > 2:3592256‑M2/10‑150 (MQ=255) gaggctGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGtt < 2:25110‑M2/144‑1 (MQ=255) gaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGtt < 2:3526394‑M2/144‑1 (MQ=255) gaggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGtt < 1:2698216‑M2/144‑1 (MQ=255) aggccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGTTg < 2:6559669‑M2/145‑1 (MQ=255) gccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTc < 2:6721393‑M2/54‑1 (MQ=255) gccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGTTGGc > 1:3914444‑M2/4‑150 (MQ=255) gccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGTTGGc > 1:122327‑M2/4‑150 (MQ=255) ccGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGTTGGcc < 1:1253814‑M2/148‑1 (MQ=255) cGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGTTGGCCt > 2:6817416‑M2/2‑150 (MQ=255) ggTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGTTGGCCtt > 2:5218128/1‑150 (MQ=255) | GGATTAGATAACCGCTTGTCGAGGCCAAGTCCAGCGGCGCCTGTATGGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCTCCCACAAGTACTGCAAAGTCCTTGAAACCTGCGTAATACCTGTGGGAGCGGGCAAGCCCGCGAAGAGGCCGGTACAGACATAAAATTACTGTGCCTTGCCAAACACCTTGTCCAGATGGGCCTCATAAGCTGCCAACGCCGCCGGCACATCCGGGCGCTTCATCACATCCACAGCCAGGAAGGTCGGCAGGCCGGTCATGCCCAGGAACTGGTTGGCCTT > NC_002947/5293344‑5293634 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |