New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5686346 = | 131 (0.450) | 9 (0.040) | 6/228 | NT | 9.2% | intergenic (‑63/+145) | PP_4986/PP_4987 | hemolysin III family channel protein/putative Chemotaxis protein |
? | NC_002947 | 5686461 = | 69 (0.280) | intergenic (‑178/+30) | PP_4986/PP_4987 | hemolysin III family channel protein/putative Chemotaxis protein |
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
TGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAGCGC > NC_002947/5686318‑5686610 | tgttgtGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTTTGTCGCGAAAGGGGCGCGGAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCGGCTGCGCCGCCCGATCGCGGACCAAGGCCGCGCCCCCACCAGac > 2:5265632/1‑150 (MQ=255) gATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGCAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACAGCATTAACCGCCGGGGGAGCTGCGCCGCCCTATAGCGACACAAGGCCGCGCCCACTCCACaccacccc > 2:6674287/1‑148 (MQ=25) tGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCATGTTTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACAGCATGAAACGCCCGGGCTGCTGCGCCGCCCCAAAGCCACACAAGGCCCCACCCACACCACAACACCACGc > 2:6069380/1‑150 (MQ=21) ttCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCCCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCCTTGGCACTGCATTAAACGCCGGGGCTGCTGCGCCGCCCTATAGCCACACAAGGCCGCTCCCACTACAGAACACCAGGCCCAGCGccac > 2:456667/1‑148 (MQ=25) ttCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCGTGTTTGGCGGAATGGGCGCGAAGCCGCCCCAGGCGTTCATTGCCCATGCAAGTACCGCCCGGGGGGGTTGGCAGCCCCATAGCCGCCCAAGGGCGCACCCACGCCAGAACCCCCGCCCCAGCGccgc > 2:1973644/1‑148 (MQ=255) ttCTTTGTGGGAGCGGCCATGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCAATGCCACAGCATGGACCCCCGGGGCGGCTGCGCAGCCCAAACCCCACACAACGCCCCACCCCAACCAGAACACCACGCCCAGCCCCCcacaa > 2:4958345/1‑149 (MQ=16) tgtgGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCCAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGGCACAGCATTAACCGCCCGGGCTGCTGCGCCGCCCGATCGCGACACAAGGCCGCGCCCCCGCCAGACCCCCAGGCCCAGCGCCGCACAACCaaa > 2:6695627/1‑150 (MQ=21) CCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCGGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAgg < 1:3796319‑M1/150‑1 (MQ=255) tttgggCGCGAATGGGGCGCGAAGGGGCCCCTGGCTTTATTTGCCACTGCATGAACCGCGGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGtt > 2:6700947‑M1/7‑150 (MQ=255) TTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGtt < 2:5021863‑M1/150‑1 (MQ=255) GTGACGCGAATGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATTAACCGCGGGGGCTGCTGCGCAGCCATATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGc > 2:5095640‑M1/1‑150 (MQ=255) TCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGGCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGa < 1:911467‑M1/150‑1 (MQ=255) TCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGa < 2:4952930‑M1/150‑1 (MQ=255) TCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCAAACCAAGGTCAGGTTGCAGa < 2:825117‑M1/150‑1 (MQ=255) gcgatagggctgcgcagcagccccggcggttcatgcagtggcaatgaaagcctggggccgcttcgcgcccctttcgcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATc > 1:5217361‑M2/97‑150 (MQ=255) gcgatagggctgcgcagcagccccggcggttcatgcagtggcaatgaaagcctggggccgcttcgcgcccctttcgcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATc > 2:3895182‑M2/97‑150 (MQ=255) cgatagggctgcgcagcagccccggcggttcatgcagtggcaatgaaagcctggggccgcttcgcgcccctttcgcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATcc > 1:2266472‑M2/96‑150 (MQ=255) CGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATcc < 1:5674004‑M1/150‑1 (MQ=255) CGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATcc < 1:2208055‑M1/150‑1 (MQ=255) gatagggctgcgcagcagccccggcggttcatgcagtggcaatgaaagcctggggccgcttcgcgcccctttcgcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAAc > 2:3785095‑M2/95‑129 (MQ=255) gatagggctgcgcagcagccccggcggttcatgcagtggcaatgaaagcctggggccgcttcgcgcccctttcgcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCcg > 1:1136482‑M2/95‑150 (MQ=255) GAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCcg < 2:3512736‑M1/150‑1 (MQ=255) GAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCGATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACACCAGACCACCAGGCCCAGCGCCTCACATCCTAAACAAGGTCACGTTGCAGATCcg < 1:4127569‑M1/150‑1 (MQ=255) ggCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCAc > 2:5211011/1‑150 (MQ=255) gcgcGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAg > 1:2190449/1‑126 (MQ=255) gcgcGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAg < 2:2190449/126‑1 (MQ=255) gcgcGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCGATCGCGACACAAGGCCGCGCCCCCTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCAAACCAAGGTCAGGGTGCAGATCCGCGTCACg > 1:4649622/1‑150 (MQ=255) cgcgAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGc > 2:5396059/1‑150 (MQ=255) gcagcagccccggcggttcatgcagtggcaatgaaagcctggggccgctgcgcagccctatcgcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCAcc > 1:5903667‑M2/84‑150 (MQ=255) gAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCAcc > 2:4696810/1‑150 (MQ=255) gCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCtt > 2:6446844/1‑150 (MQ=255) gCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCtt < 1:3512736/150‑1 (MQ=255) ccAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTcc > 2:562022/1‑150 (MQ=255) ccAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTcc > 2:2826662/1‑150 (MQ=255) cAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCa > 2:4489235/1‑150 (MQ=255) ggCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAAt < 1:2826662/150‑1 (MQ=255) gCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATAGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCGTTCCAATg > 1:5546062/1‑150 (MQ=255) tttCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCg > 2:2574037/1‑150 (MQ=255) tttCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCGATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCAAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTATCCAATGCg > 1:3817356/1‑150 (MQ=255) tttCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCGATCGCCACACAAGGCCGCTCCCACTCCCGACCACCAGGCCCAGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCg > 2:7377/1‑150 (MQ=255) ccACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTc > 2:3443354/1‑150 (MQ=255) ccACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCAGCGCCTCACATCCTAACCAACGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCATTCCAATGCGACCAGGTc > 1:3951929/1‑150 (MQ=255) aCTGCTTTAACCGCGGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACACGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCg < 2:3635919/150‑1 (MQ=255) gCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCAATCGCGACACAAGGCCCCGCCCACTCCAGACCACCAGGCCCAGCGCCGCACAACCAAACCCAGGTCACGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCATTCCAAAGCGACCAGGTCCGGTa > 1:6146741/1‑150 (MQ=255) aTGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAACGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTAcc > 2:6469224/1‑150 (MQ=255) tGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTAccc > 2:518252/1‑150 (MQ=255) tGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCAGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCATTCCAATGCGACCAGGTCCGGTAccc > 2:518090/1‑150 (MQ=255) ccgccgGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCgcgc < 2:5674004/150‑1 (MQ=255) ccgccgGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCgcgc < 2:2208055/150‑1 (MQ=255) gatagggCTGCGCAGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCa > 2:683742/5‑150 (MQ=255) gatagggCTGCGCAGCAGCCCCATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCa > 1:6782260/5‑150 (MQ=255) ccgGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAg > 1:2222254/1‑84 (MQ=255) ccgGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCAc < 1:6602698/150‑1 (MQ=255) tagggCTGCGCAGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCAcc > 1:2357887/3‑150 (MQ=255) tagggCTGCGCAGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCAcc > 1:2357843/3‑150 (MQ=255) gggCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTg > 2:4225871/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCCGCCCTATCGCGACAAACGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTca < 2:2078105/150‑1 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTca > 2:4768740/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTca > 2:1044359/1‑150 (MQ=255) tgcGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTcaccc > 2:3004140/1‑150 (MQ=255) tgcGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTcaccc > 2:4675033/1‑150 (MQ=255) tgcGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTcaccc > 1:3811264/1‑150 (MQ=255) tgcGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTcaccc > 1:6190681/1‑150 (MQ=255) cccccttATCGCCAAACACGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCt < 1:458252/144‑1 (MQ=255) cAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCt > 2:3689910/1‑150 (MQ=255) 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tcgcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCt > 1:5954668‑M2/24‑150 (MQ=255) gcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGc > 2:1160124‑M2/22‑70 (MQ=255) gcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGc < 1:1160124‑M2/49‑1 (MQ=255) gcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGc > 2:1801005‑M2/22‑150 (MQ=255) gcgacacaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACAAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGc > 1:1575689‑M2/22‑150 (MQ=255) acacggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCt < 2:2060241‑M2/134‑1 (MQ=255) acaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCt > 2:2832277‑M2/17‑150 (MQ=255) acaaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCt > 2:3829581‑M2/17‑150 (MQ=255) atgcccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTcc < 1:3950339‑M2/136‑1 (MQ=255) aaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTcc > 2:3472914‑M2/15‑150 (MQ=255) aaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTcc > 2:1162415‑M2/15‑150 (MQ=255) aaggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTcc > 2:6593646‑M2/15‑150 (MQ=255) aggccgctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCa > 1:589255‑M2/14‑150 (MQ=255) gctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTg < 1:4177384‑M2/142‑1 (MQ=255) gctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTg < 1:4177413‑M2/142‑1 (MQ=255) gctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGAACCGCGTCACGCACCCGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTg < 1:533618‑M2/142‑1 (MQ=255) ctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCa > 1:5540561‑M2/8‑144 (MQ=255) ctcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCa < 2:5540561‑M2/137‑1 (MQ=255) tcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGcc > 2:1767272‑M2/7‑150 (MQ=255) tcccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGcc > 2:3644517‑M2/7‑150 (MQ=255) cccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGccc > 1:5924312‑M2/6‑150 (MQ=255) ccacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCa > 1:3674143‑M2/5‑150 (MQ=255) cacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAg > 1:1258121‑M2/4‑150 (MQ=255) cacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAg > 2:6764055‑M2/4‑150 (MQ=255) cacTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAg > 1:5040368‑M2/4‑150 (MQ=255) acTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAgc < 2:4127569‑M2/148‑1 (MQ=255) tCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAgcgc > 1:272548/1‑150 (MQ=255) tCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAgcgc > 1:2654450/1‑150 (MQ=255) tCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAgcgc > 1:5041868/1‑150 (MQ=255) | TGTTGTGATGCTGATGGCTTCGTTCTTTGTGGGAGCGGCCTTGTGTCGCGAAAGGGGCGCGAAGCGGCCCCAGGCTTTCATTGCCACTGCATGAACCGCCGGGGCTGCTGCGCAGCCCTATCGCGACACAAGGCCGCTCCCACTCCAGACCACCAGGCCCTGCGCCTCACATCCTAACCAAGGTCAGGTTGCAGATCCGCGTCACGCACCAGCCTTTCCAATGCGACCAGGTCCGGTACCCGCGCCACCTGCTCACCCACCTGCACCGCTGCCAGCTCCAACCTGCCCAGCGC > NC_002947/5686318‑5686610 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |