New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5875294 | 114 (0.390) | 13 (0.060) | 9/216 | NT | 12.0% | intergenic (+50/+84) | PP_5144/ptsP | hypothetical protein/phosphoenolpyruvate‑dependent regulator |
? | NC_002947 | = 5875329 | 100 (0.430) | intergenic (+85/+49) | PP_5144/ptsP | hypothetical protein/phosphoenolpyruvate‑dependent regulator |
Only 100 of 184 total aligned reads displayed.
GGCTGGTTGAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAACCTGCGGGTTGTCATGGC > NC_002947/5875180‑5875478 | ggcTGGTTGAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTg < 2:5545019/150‑1 (MQ=255) ggcTGGTTGAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTg < 2:2883772/150‑1 (MQ=255) cTGGTTGAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgt > 2:155695‑M2/1‑148 (MQ=255) tGGTTGAGCGCTGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCTTTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgta > 2:2018714‑M2/1‑147 (MQ=255) tGGTTGAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgta > 2:2019046‑M2/1‑147 (MQ=255) tGGTTGAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgta > 1:1563300‑M2/1‑147 (MQ=255) tGGTTGAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgta > 2:6486480‑M2/1‑147 (MQ=255) tGGTTGAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGGGAAACCCCCCCAACAACCGCCCGGGGCCAACCCCCCAAGTGTGTACggggga > 1:1961427/1‑148 (MQ=255) ggTTGAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtag > 1:6754614‑M2/1‑146 (MQ=255) ggTTGAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtag < 2:6814893‑M2/150‑5 (MQ=255) gAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagc > 2:6137729‑M2/1‑142 (MQ=255) gAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagc > 2:6137831‑M2/1‑142 (MQ=255) aGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcg > 1:449312‑M2/1‑141 (MQ=255) aGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcg > 1:6008811‑M2/1‑141 (MQ=255) gcgcAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTCCAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgg > 1:5815345‑M2/1‑140 (MQ=255) gcgcAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgg > 1:1833387‑M2/1‑140 (MQ=255) gcgcAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgg > 1:4834069‑M2/1‑140 (MQ=255) cgcAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcggg > 1:5388928‑M2/1‑139 (MQ=255) gcAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgggt < 2:3423319‑M2/150‑13 (MQ=255) gcAGGTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgggt > 2:6199769‑M2/1‑138 (MQ=255) aGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgggttc > 2:790337‑M2/1‑136 (MQ=255) aGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAAACCGCAACTAAAACGGCCTGGGTCCAAACCCAGATGTGTGTAAGTGgttggagcgggtta < 2:3064834‑M2/150‑15 (MQ=255) gTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgggttca > 1:3423319‑M2/1‑135 (MQ=255) tCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGTGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgggttcaccc > 2:5701763‑M2/1‑132 (MQ=255) tCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgggttcaccc > 1:1268258‑M2/1‑132 (MQ=255) tCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgggttcaccc > 1:1904958‑M2/1‑132 (MQ=255) tCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGGGAACCCCCGCCGACAAACGCCGGGGTCCAAACCCAAAAGTGTTTAAGTGGTAGGTGCggggtaacac > 1:4821425/1‑143 (MQ=255) gggCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCAACGACAAAGGGCGGGGTACAACCCCCGATGTGTTTACTTGgtaggagcggggtaaccccc < 1:2799024‑M2/150‑21 (MQ=255) gggCCTTTAGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCACCAACAAAGGCATGGGTCCAACCCCACCTAGGGGTACCTGgtaggatcgggttcaacccc < 2:4180191‑M2/150‑21 (MQ=255) ggCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACCGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgggttcacccgcg > 2:6251960‑M2/1‑129 (MQ=255) ccTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACCGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgggttcacccgcgaa > 2:5086063‑M2/1‑127 (MQ=255) ttttGGCGGGCATTTGGGTTAAATTGAGTTGTTGGTCTTATTATTTTATGTTTTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGTTGAACCCGATCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCATATGTGTGTACGTGgtaggagcgggttcacccgcgaaga > 2:4515915‑M2/1‑125 (MQ=255) ttttGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCCCACCAACAACCGCCGGGGTCCAAACCCAGATGTTTGTACGGGgtgggagcggggtaacccccgaaga < 2:266447‑M2/150‑26 (MQ=255) tttgGGGGGGCTTTTGGGGTAATTTGAGTTGTGGGTCTTAGTATTTGATGTTGTCTTTTGGGGCCTCTTCGCGGGGGACCCCGCTCCTCCAACGGCCTGGGTCAAACCCCATATGTGTTTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAaga < 2:1872981/150‑1 (MQ=255) gggCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGTACCCCCGCCGACAACCGCCGGGGGCCAACCCCCCCGGGGGGTACGTGGGAGGAGCGGGGTCACCCGCCCAGAGGCCGGc > 2:314332/1‑150 (MQ=255) gCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCACCAACAAACGCCAGGGTCCAACCCCAGAAGTGTGTAAGTGGTAGGAGCGGGGTCACCCCCCAACAGGCCGGcac > 2:310533/1‑150 (MQ=255) gCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGGGTACCCCCACCAACAAACGCCAGGGTACAAACCCCCAAGATTGTACGGTGTTGGAGCGGGGTGACCCCCCAACAGGCCCGccc > 1:2934164/1‑148 (MQ=255) tttGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCGCCTACAAAGGCCAGGGTCCAACCCCAGATGTTTGTAAGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACaaa > 1:6189590/1‑150 (MQ=39) gggtattttGTGTTGTTGTTGTGTGTTTTTGATGGTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGGGGGTGAACCCGCTCGAACACGGGCCTGGGTCCAACCCCTTATGTGTGTACGTGGTTGGAGGGGTTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGc < 2:3911170/143‑1 (MQ=255) ggggAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgggttcaccc < 2:3552044‑M2/127‑19 (MQ=255) gggAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCa > 2:6284158/1‑150 (MQ=255) ttgttgGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTGCAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGGAGGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTcaca > 2:2778652/1‑150 (MQ=255) gTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTACTACAACGGCCTGGGTGCAACCCCCGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTAACCCCCGAAGAGGCCGGCACAAACACCAACACCCACACAGGGttt > 2:5242614/1‑150 (MQ=38) tGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTGttat > 2:4456895/1‑150 (MQ=255) tttGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCGCCAACAACGGCCGGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGGGCCGGTTCAACCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCAACACCCACACAGGGGTTTTTTAGccc > 2:2409373/1‑150 (MQ=37) tttGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGGGAACCCCCTCCAAAAAACGCCGGGGTGCAACCCCCGATGTGTGTTGGGGGGGGGGGCGGGGTCACCCGCGGAGGGGGCGGCCCAAACAGCATCACCCACAAAGGGGTTTATTATccc > 2:1204007/1‑150 (MQ=255) ttgtCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCAGGGTCCCACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGGGCGGGGTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGccc > 2:2145008/1‑150 (MQ=255) gtCTGTTCGGGCCTGTTCGGGGGTGAACCGGCTCCTACACGGGCCTGGGTCCACCCCCTGTTGTGTGTAGGTGGTAGGCGCGGGTTCACCGGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACCGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCaa < 2:3962014/150‑1 (MQ=255) tGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGTAACCCCGACTACAAACGCCGGGGTCCAAACCCACATTTGTGTACGTGGTAGGTGCGGGTTCACCCCCGAAGAGGCCCGCAAAAAAAGCAACACCCAAACAGGGTTTTATTATCACCAGGCCCaaaaa > 2:228619/1‑147 (MQ=255) ggggCCTCTGGGGGGGTTACCCGGCTCATACCAGGGCGTGGGTCCACCCCCTTTGGTGTGTCGGGGTTTGTTGCGGGTACCCCCGCTAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCcg < 2:833030/149‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGGTGAACCCGCTCCGACAACGGCCGGGGTCCCACCCCACATGTGGGTACCGGGTAGGAGCGGGGTCACCCGCGAAGCGGCCGGCACAAACAGCATCACCCACACAGGGTTTTATTAGCCCCCGGCCCCAACAGCCGCGCCa > 2:5888724/1‑150 (MQ=255) gggttgcaCCCGACCCAACACCGGCGGGGGTCCAACCCATTTTGTGTGTAGGGGGTCGGTGGGGGTACACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAg < 1:6205684/143‑1 (MQ=255) gggTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgaacagacaacatcaaatactcagaccaacaactcaatttcccccaaatgcccgccaaaaggcccga < 1:5190281‑M2/150‑98 (MQ=255) gggTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCAAACCCCTGTTTTGTGTAGGTGGTAGGTGGGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAgg < 2:5456311/150‑1 (MQ=255) caCCCGCTCCTACACCGGCCTGGGTCCAACCCCTTTTGTGTTTACGTGGTTGGAGCGGTTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGttctt < 2:1108497/149‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgaacagacaacatcaaatactcagaccaacaactcaatttcccccaaatgcccgccaaaaggcccgaaactgc < 2:4394893‑M2/150‑104 (MQ=255) cccGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgaacagacaacatcaaatactcagaccaacaactcaatttcccccaaatgcccgccaaaaggcccgaaact < 1:886474‑M2/147‑102 (MQ=255) cccGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgaacagacaacatcaaatactcagaccaacaactcaatttcccccaaatgcccgccaaaaggcccgaaact > 2:886474‑M2/1‑46 (MQ=255) cccGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCa > 2:6760298/1‑150 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAgg < 2:5601607/142‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAgg > 1:5601607/1‑142 (MQ=255) ccGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAg > 1:5516339/1‑150 (MQ=255) cGCTCCTACACCGGCCTGGGTCAAACCCATTTTGTGTTTAGGTTTTAGTAGGGGTTACACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAgg < 2:696472/150‑1 (MQ=255) cTCCTACACCGGCCTGGTTCCAACCCAAGATGTGTGTCCGTGGTTGGTGCGGTTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGc < 2:1092184/150‑1 (MQ=255) cTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCAAGTTGTGTGTAGGGGGTAGGAGCGGTTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGc < 2:3608848/150‑1 (MQ=255) tCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgaacagacaacatcaaatactcagaccaacaactcaatttcccccaaatgcccgccaaaaggcccgaaactgcgctcaa < 1:1462283‑M2/150‑110 (MQ=255) tCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgaacagacaacatcaaatactcagaccaacaactcaatttcccccaaatgcccgccaaaaggcccgaaactgcgctcaa < 1:4419288‑M2/150‑110 (MQ=255) tCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgaacagacaacatcaaatactcagaccaacaactcaatttcccccaaatgcccgccaaaaggcccgaaactgcgctcaa < 1:4419347‑M2/150‑110 (MQ=255) tCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGcc > 2:5421138/1‑150 (MQ=255) tCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGcc > 1:4546572/1‑150 (MQ=255) tACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGccc < 1:6608790/113‑1 (MQ=255) ccaccGGCCTGGGTCAAACCCCTGATGTGTGTACGTGGTCGGAGCGGGTTCCCCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGtt < 2:3263602/146‑1 (MQ=255) cAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTg > 2:2511606/1‑150 (MQ=255) cAACGGCCGGGTTCCAACCCCTGTTGTGTGTACGTGGTTGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTg < 2:3481630/150‑1 (MQ=255) aaCGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGgtaggagcgggttcacccgcgaagaggcccgaacagacaacatcaaatactcagaccaacaactcaatttcccccaaatgcccgccaaaaggcccgaaactgcgctcaaccagcc < 1:747783‑M2/150‑116 (MQ=255) aaCGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGc > 2:2640653/1‑150 (MQ=255) aaCGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGc > 1:4552559/1‑150 (MQ=255) aaCGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGc > 1:4552813/1‑150 (MQ=255) aaCGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGc > 2:5373655/1‑150 (MQ=255) ccGGCCTGGGCCCAACCCAATATGTGTGTACGTGGTAGGAGGGGGTCCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCa < 2:4220461/149‑1 (MQ=255) gCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCg > 2:2337547/1‑150 (MQ=255) gcggggCCCACCCCCTGTTGTGTGCAGGTGGTCGGGGGGGGTCCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGa < 1:6253318/147‑1 (MQ=255) tGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGc > 2:6105318/1‑150 (MQ=255) caaaCCCCAGATTTGGTTAGGTGTTTGGTGGGGGTACACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTgg < 2:2546279/148‑1 (MQ=255) cAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGa > 1:2761582/1‑150 (MQ=255) cAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGGTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGa > 1:2761714/1‑150 (MQ=255) cccTGATGTGTTTCGGTGGTTGGAGGGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAAc < 2:2446521/150‑1 (MQ=255) cccAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAAc > 2:4849463/1‑150 (MQ=255) cccAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAAc > 2:296643/1‑150 (MQ=255) cccAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAAc > 1:3874859/1‑150 (MQ=255) cccAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAAc > 2:296688/1‑150 (MQ=255) tttgtttgTACTTGGTAGGAGCGGTTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCGGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTATTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAACCTGc < 2:5151874/148‑1 (MQ=255) gATGTGTGTCGGGGGTTGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAACCTGc < 2:1254600/150‑1 (MQ=255) gATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAACCTGc > 2:6791956/1‑150 (MQ=255) tgtgtgTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAACCTGCgg > 2:4598276/1‑150 (MQ=255) tgtgtACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAACCTGCGGGt > 2:1760638/1‑150 (MQ=255) tttaggTGGTCGGTGGGGTTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAACCTGCGGGTTg < 2:1870753/145‑1 (MQ=255) tgtCCGGGGTTGGCGGGGGTCCCCCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAACCTGCGGGTTg < 1:497331/150‑1 (MQ=255) tACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAACCTGCGGGTTGTc > 1:5867421/1‑150 (MQ=255) gTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAACCTGCGGGTTGTCATg > 2:5342665/1‑150 (MQ=255) | GGCTGGTTGAGCGCAGTTTCGGGCCTTTTGGCGGGCATTTGGGGGAAATTGAGTTGTTGGTCTGAGTATTTGATGTTGTCTGTTCGGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACAACGGCCTGGGTCCAACCCCAGATGTGTGTACGTGGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGCACAAACAGCATCACCCTCACAGGGTTTTATTAGCCCCAGGCCCAATCATCCGCGCCAACCCAAGGTTCTTCAGGGCCAGTTGCAGCGAGCTGTGGATAACCTGCGGGTTGTCATGGC > NC_002947/5875180‑5875478 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |