New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5881989 = | 237 (0.810) | 10 (0.040) | 8/226 | NT | 6.0% | intergenic (+6/+99) | rpiA/PP_5151 | ribose‑5‑phosphate isomerase A/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 5882071 = | 120 (0.500) | intergenic (+88/+17) | rpiA/PP_5151 | ribose‑5‑phosphate isomerase A/hypothetical protein |
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
GCCGGCGGATCTGCTGCTGCTGGGCACCGCTGAAGGCGTGAAGAGCCTGAAGGCCGAGTAAAACCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTACCCCACCGGCCTGGAACCGTGGCGATCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAGAACAGGTTCGGCTCACTGACCAGGTAAATGGTCCCCGCTTCATCCATCGCAATCCCCTCCGCCTGCGGCACCGTCGCCTGCAACCCCTGGAAACCCTTGCGCAAC > NC_002947/5881923‑5882220 | cggcggATCTGCTGCTGCTGGGCACCGCTGAAGGCGTGAAGAGCCTGAAGGCCGAGTAAAACCCTTCGCGGGGAAAACCCCGCCCAAAAAGTACCCCCCCCCCCGGGCACCGGGGCGGACCCGGGAGGGGCGGGGTTTCCCCCGcacacg > 1:298834/1‑148 (MQ=255) ggtaTCTGCTGCTGGTGGGCACCGCTGATGGGGTTAAGAGCCTGATGGCCGATTAAAACCCTGCGCGGTTAAACCCGCTCCTACATGGTACCCCACCGGCCTGGAACGGTGGCTATCCCTGTAGGAGGGGGTTTACCCGCGAACAGGccc < 1:2027130/147‑1 (MQ=255) ggATCTGCTGCTGCTGGGCACCGCTGAAGGCGTGAAGAGCCTGAAGGCCGAGTAAAACCCTTCGCGGGGAAAACCCCGCCAACAAGGTACCCCACCCGCCAGGAACCCTGGCGCTCCCAGTAGGAGCGGGTTTAACCCCCAACAGGcccg > 1:1077929/1‑149 (MQ=255) 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tgctgctgGGCACCGCTGAAGGCGTGAAGAGCCTGAAGGCCGAGTAAAACCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTACCCCACCGGCCTGGAACCGTGGCGATCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACAGGCCCTGACAGGCg > 2:2770668/1‑150 (MQ=255) tgctgctgGGCACCGCTGAAGGCGTGAAGAGCCTGAAGGCCGAGTAAAACCCTTCGCGGGGAAACCCCCACCAACAAGGGACCCCACCCGCCCGGAACCGGGGCGATCCCAGGTTGTGCGGGGTGTCCCGCGAACAGGCCCAGACAGGCg > 1:3749570/1‑150 (MQ=255) gctgctgGGCACCGCGGACGGCGTGAAGAGCCTGAAGGCCGATTAAAACCCTGCGGGGGTAAACCCGCTCCAACACGGTACCCCACCGGCCTGTACCGGTGGCGATCCCGGTAGGAGGGGTTTTACCCGCGAACAGGCCCTGACAGGCGa < 1:3462213/150‑1 (MQ=255) tgctgGGCACCGCTGAAGGCGTGAAGAGCCTGAAGGCCGAGTAAAACCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTACCCCACCGGCCTGGAACCGTGGCGATCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACAGGCCCTGACAGGCGAtc < 1:2687087/150‑1 (MQ=255) gctgGGCACCGCTGACGGCGTGAAGAGCCTGATGGCCGAGTAAAACCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTACCCCACCGGCCTGGAACCGTGGCGATCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACAGGCCCTGACAGGCGAtca < 1:2256558/150‑1 (MQ=255) 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gagCCTGAAGGCCGAGTAAACCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCACGGTACCCCACCGGCCTGGAACCGTGGCGATCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATa < 2:4578536/150‑1 (MQ=255) gagCCTGAAGGCCGAGTAAAACCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTACCCCACCGGCCTGGAACCGTGGCGATCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATa < 1:5463411/150‑1 (MQ=255) tgCCTGACGGCCGATTAAAACCCTGGGGGGTTAAACCCGCTCCTACACGGTACCCCACCGGCCTGTAACGGTGGCGATCCGTGTTGGTGCGGTTTTACCCGCGAACAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAg < 1:125364/149‑1 (MQ=255) agCCTGAAGGCCGAGTAAAACCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTACCCCACCGGCCTGGAACCGTGGCGATCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAg < 1:4512936/150‑1 (MQ=255) gAAGGCCGAGTAAAACCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTACCCCACCGGCCTGGAACCGTGGCGATCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAGAACAg < 1:3368253/150‑1 (MQ=255) 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gATCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAGAACAGGTTCGGCTCACTGACCAGGTAAATGGTCCCCGCTTCATCCATCGCAATCCCCTCCGCCTGCGGCACCGTc < 2:4666755/150‑1 (MQ=255) gATCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAGAACAGGTTCGGCTCACTGACCAGGTAAATGGTCCCCGCTTCATCCATCGCAATCCCCTCCGCCTGCGGCACCGTc > 1:99360/1‑150 (MQ=255) cccTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAGAACAGGTTCGGCTCACTGACCAGGTAAATGGTCCCCGCTTCATCCATCGCAATCCCCTCCGCCTGCGGCACCGTCGcc < 1:5281637/150‑1 (MQ=255) cTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAGAACAGGTTCGGCTCACTGACCAGGTAAATGGTCCCCGCTTCATCCATCGCAATCCCCTCCGCCTGCGGCACCGTCGCCTg > 2:3844535/1‑150 (MQ=255) ctgttcgcgggtaaacccgcgaaCAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAGAACAGGTTCGGCTCACTGACCAGGTAAATGGTCCCCGCTTCATCCATCGCACTCCCCTCCGCCTGCGGCACCGTCGCCTGCa > 2:393552‑M2/24‑150 (MQ=255) aggagcgggtttacccgcgaaCAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAGAACAGGTTCGGCTCACTGACCAGGTAAATGGTCCCCGCTTCATCCATCGCAATCCCCTCCGCCTGCGGCACCGTCGCCTGCAAc < 2:6136455‑M2/129‑1 (MQ=255) aggagcgggtttacccgcgaaCAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAGAACAGGTTCGGCTCACTGACCAGGTAAATGGTCCCCGCTTCATCCATCGCAATCCCCTCCGCCTGCGGCACCGTCGCCTGCAAc > 2:3646120‑M2/22‑150 (MQ=255) tttacccgcgaaCAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAGAACAGGTTCGGCTCACTGACCAGGTAAATGGTCCCCGCTTCATCCATCGCAATCCCCTCCGCCTGCGGCACCGTCGCCTGCAACCCCTGGaaa > 2:5486222‑M2/13‑150 (MQ=255) ttacccgcgaaCAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAGAACCGGTTCGGCTCACTGACCAGGTAAATGGTCCCCGCTTCATCCATCGCAATCCCCTCCGCCTGCGGCACCGTCGCCTGCAACCCCTGGAAAc < 2:3073487‑M2/139‑1 (MQ=255) tacccgcgaaCAGGCCCTGACCGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAGAACAGGTTCGGCTCACTGACCAGGTAAATGGTCCCCGCTTCATCCATCGCAATCCCCTCCGCCTGCGGCACCGTCGCCTGCAACCCCTGGAAAcc < 2:4200894‑M2/140‑1 (MQ=255) ccgcgaaCAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAGAACAGGTTCGGCTCACTGACCAGGTAAATGGTCCCCGCTTCATCCATCGCGATCCCCTCCGCCTGCGGCACCGTCGCCTGCAACCCCTGGACACCCtt > 1:4964408‑M2/8‑150 (MQ=255) ccgcgaaCAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAGAACAGGTTCGGCTCACTGACCAGGTAAATGGTCCCCGCTTCATCCATCGCGATCCCCTCCGCCTGCGGCACCGTCGCCTGCAACCCCTGGAAACCCtt > 1:2729572‑M2/8‑150 (MQ=255) ccgcgaaCAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAGAACAGGTTCGGCTCACTGACCAGGTAAATGGTCCCCGCTTCATCCATCGCAATCCCCTCCGCCTGCGGCACCGTCGCCTGCAACCCCTGGAAACCCtt > 2:706973‑M2/8‑150 (MQ=255) gcgaaCAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAGAACAGGTTCGGCTCACTGACCAGGTAAATGGTCCCCGCTTCATCCATCGCAATCCCCTCCGCCTGCGGCACCGTCGCCTGCAACCCCTGGAAACCCTTgc > 2:1424395‑M2/6‑150 (MQ=255) gcgaaCAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAGAACAGGTTCGGCTCACTGACCAGGTAAATGGTCCCCGCTTCATCCATCGCAATCCCCTCCGCCTGCGGCACCGTCGCCTGCAACCCCTGGAAACCCTTgc < 1:4371148‑M2/145‑1 (MQ=255) aCAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAGAACAGGTTCGGCTCACTGACCAGGTAAATGGTCCCCGCTTCATCCATCGCAATCCCCTCCGCCTGCGGCACCGTCGCCTGCAACCCCTGGAAACCCTTGCGCaa < 1:4285007‑M2/149‑1 (MQ=255) cAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAGAACAGGTTCGGCTCACTGACCAGGTAAATGGTCCCCGCTTCATCCATCGCAATCCCCTCCGCCTGCGGCACCGTCGCCTGCAACCCCTGGAAACCCTTGCGCAAc < 1:310607/150‑1 (MQ=255) | GCCGGCGGATCTGCTGCTGCTGGGCACCGCTGAAGGCGTGAAGAGCCTGAAGGCCGAGTAAAACCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTACCCCACCGGCCTGGAACCGTGGCGATCCCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAACAGGCCCTGACAGGCGATCAGTCAGTCGGCTGCTTGAACACATAGAACAGGTTCGGCTCACTGACCAGGTAAATGGTCCCCGCTTCATCCATCGCAATCCCCTCCGCCTGCGGCACCGTCGCCTGCAACCCCTGGAAACCCTTGCGCAAC > NC_002947/5881923‑5882220 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |