| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_002947 | 1,699 | G→T | 6.5% | P41Q (CCG→CAG) | parA ← | chromosome partition protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,699 | 0 | G | T | 6.5% | 982.2 / 37.6 | 293 | P41Q (CCG→CAG) | parA | chromosome partition protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (144/129); new base T (12/8); total (156/137) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.45e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 299 total aligned reads displayed.
GGTCACGGTTGGCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTG > NC_002947/1550‑1848 | tcaCGGTTGGCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGa > 1:1007583/1‑150 (MQ=255) tcaCGGTTGGCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGa > 1:1723528/1‑150 (MQ=255) gTTGGCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAg < 2:5181509/150‑1 (MQ=255) tGGCCGGCAGCATCTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGt < 1:6861957/150‑1 (MQ=255) cGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGAt > 1:1422882/1‑150 (MQ=255) agcaACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcagc > 1:136488/1‑150 (MQ=255) agcaACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcagc < 2:1642345/150‑1 (MQ=255) agcaACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcagc < 1:1999813/150‑1 (MQ=255) gcaGCTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcagca < 2:6346769/150‑1 (MQ=255) caACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCTGATCGACCTCGATccgcag < 2:6288419/150‑1 (MQ=255) caACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCTGATCGACCTCGATccgcag < 2:1816062/150‑1 (MQ=255) caACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCTGATCGACCTCGATccgcag < 2:5166281/150‑1 (MQ=255) aaCTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAgg < 1:2236944/150‑1 (MQ=255) aCTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGa < 2:4419753/150‑1 (MQ=255) cTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGac > 2:2866872/1‑150 (MQ=255) gAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACacg > 1:4768934/1‑150 (MQ=255) aGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACacgac > 2:3899396/1‑150 (MQ=255) aGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACacgac > 2:2770706/1‑150 (MQ=255) gCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACacgacg < 2:255883/150‑1 (MQ=255) cTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCt > 1:3652172/1‑150 (MQ=255) tCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCtt > 2:6737746/1‑150 (MQ=255) ccGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTg < 1:5901266/150‑1 (MQ=255) gTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGt > 1:3385070/1‑150 (MQ=255) tCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGca > 2:3641378/1‑150 (MQ=255) tCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGca < 2:4768934/150‑1 (MQ=255) tCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGca > 2:1186269/1‑150 (MQ=255) tCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGca < 2:4925815/150‑1 (MQ=255) cGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGcag < 2:3003015/150‑1 (MQ=255) gtGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGa > 2:5962324/1‑150 (MQ=255) aTAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAggcg > 1:5826500/1‑150 (MQ=255) aGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAggcggc < 2:4240178/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCga < 1:2458704/150‑1 (MQ=255) cTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCgag > 2:734216/1‑150 (MQ=255) ggCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGAtt < 2:144705/150‑1 (MQ=255) gCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTg < 1:4315887/150‑1 (MQ=255) tCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAg > 1:5625697/1‑150 (MQ=255) aCTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAggtgg < 2:3196926/150‑1 (MQ=255) tCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGtt < 1:2150484/150‑1 (MQ=255) tCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGtt > 2:5600465/1‑150 (MQ=255) tCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGtt > 2:4829780/1‑150 (MQ=255) tCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGtt > 1:4454753/1‑150 (MQ=255) ccGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTc > 2:2478201/1‑150 (MQ=255) cGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCt > 1:3827554/1‑150 (MQ=255) gATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGTGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCtt < 1:3338939/150‑1 (MQ=255) gATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCtt < 2:408472/150‑1 (MQ=255) tGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGc < 1:819128/150‑1 (MQ=255) gAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCATCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGcc < 2:1001171/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCcac > 2:1992862/1‑150 (MQ=255) cAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCcac < 2:4703544/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCcac < 1:6522742/150‑1 (MQ=255) ggTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCacac < 2:2509082/150‑1 (MQ=255) gTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACaccacc > 1:5022782/1‑150 (MQ=255) tAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCt > 2:3407999/1‑150 (MQ=255) tAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCt < 1:2550735/150‑1 (MQ=255) gACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCttt > 2:6789495/1‑150 (MQ=255) aCCTAATGCTCTAGCTCGTGCTTGTCCACACCTCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTc > 2:833745/1‑150 (MQ=255) aCCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGa > 2:5443830/1‑118 (MQ=255) aCCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGa < 1:5443830/118‑1 (MQ=255) ccGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCt > 2:5228452/1‑150 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cTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATAc < 2:432216/150‑1 (MQ=255) gTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGACGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTGTCTGGTTCGCGATTGCGACTACCtt > 2:5810996/1‑150 (MQ=255) tCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTa < 2:136488/150‑1 (MQ=255) tCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTa < 1:4024364/150‑1 (MQ=255) ccACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAg < 1:2967461/150‑1 (MQ=255) cacaCCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGc < 1:273813/150‑1 (MQ=255) acacCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTg > 1:2872366/1‑125 (MQ=255) acacCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGcc > 1:2785929/1‑150 (MQ=255) tGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACAGCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCAttgttg < 2:2713373/150‑1 (MQ=255) cccATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCg > 2:2955788/1‑150 (MQ=255) ccATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGa < 2:615623/150‑1 (MQ=255) cATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAg > 2:1080072/1‑150 (MQ=255) ggCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTcc > 2:4483842/1‑150 (MQ=255) gtcgtgtccTGCTGATCGACCTCGATCCGCAGGGCACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTccc > 1:744160/8‑150 (MQ=39) cGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCa < 2:1905928/150‑1 (MQ=255) tgtccTGCTGATCGACCTCGATCCGCAGGGCACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTc > 2:3744854/4‑150 (MQ=255) gtccTGCTGATCGACCTCGATCCGCAGGGCACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCa > 1:1171042/3‑150 (MQ=255) gtccTGCTGATCGACCTCGATCCGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCa > 1:2652397/3‑150 (MQ=255) gCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCa > 1:6342831/1‑150 (MQ=255) gCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCa > 2:928402/1‑150 (MQ=255) tccTGCTGATCGACCTCGATCCGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTcgc > 2:5714725/2‑107 (MQ=39) cccTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCAt > 1:5268547/1‑150 (MQ=255) ccTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATg > 1:3256774/1‑150 (MQ=255) cTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGc > 1:6165290/1‑150 (MQ=255) tGCGGTTCGAGGTCGGTCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGTGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCTCACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCGGTCATggc > 2:650595/1‑148 (MQ=255) ggATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTg < 1:2327502/150‑1 (MQ=255) | GGTCACGGTTGGCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTG > NC_002947/1550‑1848 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |