| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 335,437 | A→G | 5.1% | intergenic (‑40/+164) | PP_0277 ← / ← PP_5437 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 335,437 | 0 | A | G | 5.1% | 963.0 / 22.5 | 308 | intergenic (‑40/+164) | PP_0277/PP_5437 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (143/143); new base G (14/2); total (159/149) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.70e-03 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.61e-01 | |||||||||||
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
CCGGGGTGGTTCCAGCCCAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACGGGG > NC_002947/335288‑335586 | ccGGGGTGGTTCCAGCCCAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCaa > 1:5001233/1‑150 (MQ=255) gggTGGTTCCAGCCCAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGc > 2:3102128/1‑150 (MQ=255) gtggtTCCAGCCCAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCa > 1:3907764/1‑150 (MQ=255) gtTCCAGCCCAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGaa < 1:6370230/150‑1 (MQ=255) tCCAGCCCAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAgg > 1:118156/1‑150 (MQ=255) tCCAGCCCAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAgg > 1:3298219/1‑150 (MQ=255) cccAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTcgcg > 2:1502621/1‑150 (MQ=255) cAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCggg > 1:778363/1‑150 (MQ=255) cAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCggg < 2:5152101/150‑1 (MQ=255) aGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCgggg < 1:5388035/150‑1 (MQ=255) aGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCgggg < 1:4935376/150‑1 (MQ=255) tGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCACCAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTgg < 2:1322794/150‑1 (MQ=255) cTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCg < 1:1486218/150‑1 (MQ=255) tGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCgg > 1:2534478/1‑150 (MQ=255) tGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCgg > 1:1005018/1‑150 (MQ=255) tGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCAGTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCgg > 2:3415951/1‑150 (MQ=255) gTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCggg < 1:2266645/150‑1 (MQ=255) gTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCggg > 2:5218705/1‑150 (MQ=255) ggggCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAgcgcgc < 2:5080083/150‑1 (MQ=255) gggCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGcgcgcg > 1:5455803/1‑150 (MQ=255) ggCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGa > 2:4852423/1‑150 (MQ=255) ggCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGa > 1:6628285/1‑150 (MQ=255) ggCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGa < 1:4665521/150‑1 (MQ=255) gAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGt > 2:4550922/1‑150 (MQ=255) gAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGt < 1:1602800/150‑1 (MQ=255) ggTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGACAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCCGCGCGCGACGTCa > 1:1228634/1‑150 (MQ=255) gTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCAc > 1:2188904/1‑150 (MQ=255) gTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCAc < 2:1555335/150‑1 (MQ=255) tGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACt > 1:2817007/1‑150 (MQ=255) ccgccgGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACttt > 1:5657261/1‑150 (MQ=255) cgccgGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACtttt < 2:3780118/150‑1 (MQ=255) gccgGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACttttt < 1:1376932/150‑1 (MQ=255) cgGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTaa < 2:444018/150‑1 (MQ=255) cgGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTaa < 2:4322047/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGACTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAAt > 1:1108150/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATg < 2:4986665/150‑1 (MQ=255) gcAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGAt > 2:1157754/1‑150 (MQ=255) gcAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGAt > 2:600350/1‑150 (MQ=255) 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tCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATg < 1:3501411/150‑1 (MQ=255) tCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCAGTCGCCTTGTGTTGTCTGGTATg > 2:5293909/1‑150 (MQ=255) gtggtCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTcg > 1:4822253/1‑150 (MQ=255) gtCCATTGTCGGTTCTGGCGCCACGCCAGAAGGTCGGGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGCTTTGGGGGGGCGGATGAGACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCgg < 1:2626181/150‑1 (MQ=255) gtCCAGTGTCGGTTCTGGCGCACCGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTACTGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCgg < 2:21086/150‑1 (MQ=255) ttGTCGGTTCTTGCGAAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACCTCACATTTTAATGATGTGGGGGGGCGGATGATACCCCGTTGCGGGGGTGGAGCAGTAGCCGGGGGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGaa > 2:421140/1‑150 (MQ=255) ttGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTggg < 1:4513914/76‑1 (MQ=255) tGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTGAATGATTGGGGGGGGCGGATGAGACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAAc < 2:4706640/150‑1 (MQ=255) ggcGGGTCTGGCGCCCCGCCAGAAGGGCGCGGGGCGGGCGGGCCGCGCGCGACGTCACTGTGGACTGCGGTGGGGGGGCGGATGATCCCCCGTTGCGGGGGGGGAGCATTAGCCGTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAAcc < 1:4972849/148‑1 (MQ=255) tCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAAccc > 2:2568440/1‑150 (MQ=255) ggTTCTGGCGCCACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGc < 1:4127447/150‑1 (MQ=255) ggTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGc > 1:3524334/1‑150 (MQ=255) cttCTGGCGTTGCGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCt > 2:6819026/2‑150 (MQ=255) ttCTGGCGTTGCGCCCGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGGGTTGTCGGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTc > 2:1967359/1‑150 (MQ=255) ttCTGGCGTTGCGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTc > 1:6214113/1‑150 (MQ=255) ttCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTc > 1:6156589/1‑150 (MQ=255) ttCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATGTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCAGTAGCCTTGTGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTc > 1:6843597/1‑150 (MQ=255) tGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTTTGTTGTCTGGTAAGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTa > 1:1460533/1‑150 (MQ=255) gcgcAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTaca > 1:355405/1‑150 (MQ=255) cAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACgg > 2:246183/1‑150 (MQ=255) aaCGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACggg > 2:1361445/1‑150 (MQ=255) aCGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTGGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACgggg < 1:3102128/150‑1 (MQ=255) | CCGGGGTGGTTCCAGCCCAGGTTGCTGTTGGGGTGGGGCGAGGTGCCGCCGGCGCAGCCGGTCAGGGCCAGGGCGAAGGTCAACAGGGCGAGGGGGTTGGCTCGGGTCACGATGCTCAGGTCCGGTGGTCCATTGTCGGTTCTGGCGCAACGCCAGAAGGTCGCGGGGCTGGCGGGCAGCGCGCGACGTCACTTTTTAATGATTTGGGGGGGCGGATGATACACCGTTGCGGGGGTGGAGCATTAGCCTTGTGTTGTCTGGTATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACGGGG > NC_002947/335288‑335586 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |