| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 3,615,261 | 0 | T | A | 5.1% | 977.2 / 23.4 | 283 | intergenic (‑37/+19) | PP_3183/mcoA | SCO1/SenC family protein/Mn(II) copper oxidase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (129/139); new base A (8/7); total (137/146) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.93e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
CCCCAGGGAGAGGCCGCTGCTTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGG > NC_002947/3615112‑3615407 | caccAGGGAGAGGCCGCTGCTTCGGCCAACGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAAAGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGAACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGCGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CAt > 2:1906440/3‑150 (MQ=255) ccAGGGAGAGGCCGCTGCTTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATgg < 1:5756962/150‑1 (MQ=255) cAGGGAGAGGCCGCTGCTTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATggc > 1:1175205/1‑150 (MQ=255) ggAGAGGCCGCTGCTTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATggcggc < 1:1052721/150‑1 (MQ=255) agagGCCGCTGCTTCGGCCACCGTTCGTTGGGGGTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGccc < 1:6466500/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGCTTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCt > 2:5071995/1‑150 (MQ=255) gCCGCTGCTTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCt > 2:2432267/1‑150 (MQ=255) gCCGCTGCTTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCt > 1:2657013/1‑150 (MQ=255) 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ccG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGt > 2:166510/1‑150 (MQ=255) gcttGGCGGCCCCGATTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACGGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCGGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTgg < 1:6747435/147‑1 (MQ=255) | CCCCAGGGAGAGGCCGCTGCTTCGGCCACCGTTCGTTGGGGTTGCAACGGCCAGAACGGAATGCTGGCGGCGAACAACGCCAGTACCAGCAGGAATCGCCATGAGCCGGGCATGATGCGGTCCTCGTGGGTTGGCTGATGGGGGCCG‑CATGGCGGCCCCGCTTTGCACTCACTTGTATGTGACTGGCGCTGTCACCGTCTGGCCCAGCGTCGATTTCACCGTGACCGTCGCTGGCGTGGCCGGGCCAAAGCCGGTGGTGGTCACCGCTACCCGCCAACGGGCCCCCGTAGTCGTGG > NC_002947/3615112‑3615407 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |