| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,155,517 | T→G | 6.2% | L43V (TTG→GTG) | PP_3655 → | cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,155,517 | 0 | T | G | 6.2% | 822.2 / 29.1 | 250 | L43V (TTG→GTG) | PP_3655 | cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (107/127); new base G (8/8); total (115/135) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
CTACCTTGCCTTGGAGTCAGTCATGACCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCATTCCGCAGAT > NC_002947/4155369‑4155665 | aCCTTGCCTTGGAGTCAGTCATGACCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGc < 2:1294318/150‑1 (MQ=255) aCCTTGCCTTGGAGTCAGTCATGACCAGTGCAGCCAATGCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGc < 2:702397/150‑1 (MQ=255) gtgccttgGAGTCAGTCATGACCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCa < 2:116931/149‑1 (MQ=255) gccttgGAGTCAGTCATGACCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGGTgacgatg < 2:4128647/150‑7 (MQ=255) cttgGAGTCAGTCATGACCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGt > 2:6519590/1‑150 (MQ=255) ggAGTCAGTCATGACCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCAc > 1:4889326/1‑150 (MQ=255) tcagtcaTGACCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGgc < 2:2876190/150‑1 (MQ=255) agtcaTGACCCGTGCAGCCATTTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGACAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGGTGACGATGGGCAACGgcgc < 1:4187202/150‑1 (MQ=255) agtcaTGACCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGgcgc > 1:6723843/1‑150 (MQ=255) agtcaTGACCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGGTGACGATGGGCAACGgcgc < 1:6281844/150‑1 (MQ=255) agtcaTGACCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGGTGACGATGGGCAACGgcgc < 2:852649/150‑1 (MQ=255) tcaTGACCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGgcgcgc > 2:2716523/1‑150 (MQ=255) tGACCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTgg < 1:1778417/150‑1 (MQ=255) tGACCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTgg < 1:3209693/150‑1 (MQ=255) gACAAGTGCAGCCAATTAGGCACCCCTGATATAAAAACACACTATCGGCTAAGTGACCCCGCAACACCGCCATGGAAATGAAAGTGATCTGTTAACACACTGGTTCTGCGGCAACAACGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCAggg > 1:2941201/1‑150 (MQ=255) aCCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGTATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGgt < 2:4565981/150‑1 (MQ=255) aCCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGgt > 2:4930569/1‑150 (MQ=255) ccAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGgtg > 1:4344470/1‑150 (MQ=255) tGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACTCGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCa < 2:5094183/150‑1 (MQ=255) tGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCa < 2:6314895/150‑1 (MQ=255) gCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGATCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTg > 2:3265977/1‑150 (MQ=255) ccAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGt < 1:6230610/150‑1 (MQ=255) ccAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGGTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGt > 2:6020563/1‑150 (MQ=255) aaTTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGgt > 1:2371692/1‑138 (MQ=255) aaTTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTc > 1:492573/1‑150 (MQ=255) tCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCAc < 2:6269733/150‑1 (MQ=255) tCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCAc < 1:2261709/150‑1 (MQ=255) tCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCAc < 2:2705430/150‑1 (MQ=255) ggCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCt < 2:4085315/150‑1 (MQ=255) ggCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCt < 2:666767/150‑1 (MQ=255) ccTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCt > 2:2110951/1‑150 (MQ=255) cTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTg < 1:3047164/150‑1 (MQ=255) aaaaaCACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATggg < 2:1392852/150‑1 (MQ=255) aaaaaCACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATggg > 2:6648251/1‑150 (MQ=255) aaaaaCACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATggg < 1:5780030/150‑1 (MQ=255) cacGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCAATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCAtcgt > 1:23015/1‑150 (MQ=255) acGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCAtcgtc > 1:417018/1‑150 (MQ=255) acGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCAtcgtc < 1:1228848/150‑1 (MQ=255) gATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCCTCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGc > 2:170564/1‑150 (MQ=255) gCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATcc < 2:4924672/150‑1 (MQ=255) aCGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTg > 1:4007864/1‑150 (MQ=255) gTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTc > 1:3905666/1‑150 (MQ=255) gCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCgg > 1:6185666/1‑150 (MQ=255) cccGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCa < 1:1024482/150‑1 (MQ=255) cccGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCa > 1:2183279/1‑150 (MQ=255) cccGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCa < 1:4522232/150‑1 (MQ=255) aaGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTgg > 2:1626723/1‑150 (MQ=255) ccATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTcggcgg > 1:3732477/1‑150 (MQ=255) ccATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCACCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTcggcgg < 2:3044177/150‑1 (MQ=255) cATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCggg < 1:1714453/150‑1 (MQ=255) cATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCggg < 1:1714899/150‑1 (MQ=255) cATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCggg < 2:5567168/150‑1 (MQ=255) aTGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCgggg < 2:2352579/150‑1 (MQ=255) tGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCAt > 1:739127/1‑123 (MQ=255) gAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGc < 1:6536758/150‑1 (MQ=255) aGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGa > 2:6132852/1‑150 (MQ=255) gTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATg < 1:5515968/150‑1 (MQ=255) gTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATg < 1:573077/150‑1 (MQ=255) gTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATg < 2:1459251/150‑1 (MQ=255) gTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATg < 1:1337105/150‑1 (MQ=255) tAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATgg < 1:2716523/150‑1 (MQ=255) aGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGcc < 2:1797065/150‑1 (MQ=255) aGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGcc < 2:5987029/150‑1 (MQ=255) aGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGcc < 2:4982478/150‑1 (MQ=255) aGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGcc > 1:2582488/1‑150 (MQ=255) ggATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCt < 2:648252/150‑1 (MQ=255) ggATCTGTTCACACCCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCt > 2:6213439/1‑150 (MQ=255) tGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACt > 2:6866535/1‑150 (MQ=255) cacaCTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGc > 1:6499032/1‑150 (MQ=255) cacaCTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGc > 1:2072471/1‑150 (MQ=255) acacTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGcc > 1:805984/1‑150 (MQ=255) acacTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGcc > 2:4298491/1‑150 (MQ=255) cgttctGGGTCGGCGGCAAGATCGCTCCGTTGCCCATCTTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGTTCCTGGTTTGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCTCCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGccc < 1:1648508/147‑1 (MQ=255) cacTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGccc > 1:1136781/1‑150 (MQ=255) acTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCCTCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGACGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCa > 1:4105580/1‑150 (MQ=255) acTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGcccc > 1:4688264/1‑149 (MQ=255) acTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCa > 1:3443619/1‑150 (MQ=255) acTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCa > 1:506067/1‑150 (MQ=255) acTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCa > 1:5868586/1‑150 (MQ=255) acTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCa > 1:1467903/1‑150 (MQ=255) ctctGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAg > 2:482778/1‑150 (MQ=255) tctGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAgg < 2:5785166/150‑1 (MQ=255) tctGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAgg > 2:3815264/1‑150 (MQ=255) tGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCTATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGc < 2:23015/150‑1 (MQ=255) gTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGccc > 1:900860/1‑150 (MQ=255) gTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGccc < 1:1754588/150‑1 (MQ=255) gTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGccc > 1:5276713/1‑150 (MQ=255) gcAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATgg < 2:1859930/150‑1 (MQ=255) agcgcgCCGGTGACGATGGGCAACGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCAtt > 2:5296026/3‑150 (MQ=255) aTCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCAtt > 2:2442321/1‑150 (MQ=255) aTCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCAtt > 1:441716/1‑150 (MQ=255) tCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATcc > 1:2387767/1‑81 (MQ=255) tCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATcc < 2:2387732/81‑1 (MQ=255) cgcgCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCATTcc > 2:426519/1‑150 (MQ=255) gcgcCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGccc > 2:538988/1‑115 (MQ=255) gcgcCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCATTCCg > 2:1090139/1‑150 (MQ=255) gcgcCGGTGACGATGGGCAACGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCATTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCATTCCg > 2:2513873/1‑150 (MQ=255) gctgTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCATTCCGCa < 2:3486943/147‑1 (MQ=255) gcCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCATTCCGCa > 1:634436/1‑150 (MQ=255) gTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCATTCCGCAgat < 2:3876316/150‑1 (MQ=255) | CTACCTTGCCTTGGAGTCAGTCATGACCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCATTCCGCAGAT > NC_002947/4155369‑4155665 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |