| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_002947 | 4,155,522 | 0 | C | G | 5.9% | 823.9 / 28.8 | 247 | P44P (CCC→CCG) ‡ | PP_3655 | cytosine/purine/uracil/thiamine/allantoin permease family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (107/124); new base G (7/7); total (115/132) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.91e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 262 total aligned reads displayed.
CTTGCCTTGGAGTCAGTCATGACCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCATTCCGCAGATGATCCA > NC_002947/4155373‑4155671 | cttgccttgGAGTCCGTCATGACCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGccc > 1:4067050/1‑150 (MQ=255) ttgccttgGAGTCAGTCATGACCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCa > 1:417031/1‑150 (MQ=255) ccttgGAGTCAGTCATGACCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCg > 2:4604897/1‑150 (MQ=255) 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aTCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCAtt > 2:3140740/1‑150 (MQ=255) aTCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCAtt > 2:2442321/1‑150 (MQ=255) tCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATcc > 1:2387732/1‑81 (MQ=255) tCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATcc < 2:2387732/81‑1 (MQ=255) gcgcCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGccc > 2:538988/1‑115 (MQ=255) gcgcCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGccc < 1:538988/115‑1 (MQ=255) gcgcCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCATTCCg > 1:4896556/1‑150 (MQ=255) gcgcCGGTGACGATGGGCAACGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCATTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCATTCCg > 2:2513873/1‑150 (MQ=255) gcCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCATTCCGCa < 1:4304804/150‑1 (MQ=255) gcCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCATTCCGCa < 2:417031/150‑1 (MQ=255) cGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCATTCCGCAga > 2:6269664/1‑150 (MQ=255) gCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCATTCCGCAgatgat > 1:7444/1‑150 (MQ=255) cccATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCATTCCGCAGATGATc > 2:6165865/1‑150 (MQ=255) cccATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCATTCCGCAGATGATc > 1:799785/1‑150 (MQ=255) cccATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGGGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTCTGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCCGGGCCCGCAAATGGGCCTTCCGCAGATGATc > 2:4268/1‑150 (MQ=255) ccATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCATTCCGCAGATGATcc > 1:5011206/1‑150 (MQ=255) cATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCATTCCGCAGATGATCCa > 2:853953/1‑150 (MQ=255) | CTTGCCTTGGAGTCAGTCATGACCAGTGCAGCCAATTCGGCACCCCTGATAGAAAAACACACGATCGGCTACGTGCCCCCGCAAGACCGCCATGGAAAGGTAAGGGATCTGTTCACACTCTGGTTCGGCGGCAACATCGCGCCGTTGCCCATCGTCACCGGCGCGCTGGGTGTGCAGCTGTTCCACCTGAACCTGGTATGGGGCATCGTCGCCATCCTTGTCGGCCACCTGGTCGGCGGGGTGCTGATGGCCCTGCACTCGGCCCAGGGCCCGCAAATGGGCATTCCGCAGATGATCCA > NC_002947/4155373‑4155671 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |