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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,291,671 | 0 | G | C | 5.6% | 909.3 / 31.0 | 269 | A353G (GCC→GGC) | PP_3758 | two component system response regulator/sensor histidine kinase |
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Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
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ccccAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCAc < 2:3282004/150‑1 (MQ=255) cccAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCAGCAcc > 2:4967701/1‑150 (MQ=255) ccAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACATGCACCg > 2:4872379/1‑150 (MQ=255) cAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCgg > 2:2744796/1‑150 (MQ=255) aaGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGa > 2:1612598/1‑150 (MQ=255) aaGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGa < 1:2713539/150‑1 (MQ=255) aaGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGa < 1:4051167/150‑1 (MQ=255) gCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGAtt < 2:5535580/150‑1 (MQ=255) ccAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGATTgc > 2:5323638/1‑150 (MQ=255) cAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGATTgcg > 2:1078866/1‑150 (MQ=255) aGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGATTgcgc > 1:6317300/1‑150 (MQ=255) aCCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGATTGCGCTc < 1:3964705/150‑1 (MQ=255) tCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGATTGCGCTCGcc > 1:6827954/1‑150 (MQ=255) tCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGATTGCGCTCGcc > 1:595856/1‑150 (MQ=255) tCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTAATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGATTGCGCTCGcc > 1:3789734/1‑150 (MQ=255) cTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGATTGCGCTCGCCGTaa < 1:2335551/150‑1 (MQ=255) | CTGGTCGTTTTGTTCTTTGAATGTTGCCAGCGGCAATTGCAGGGTGAATGTGGCACCCTTGCCCTCCTCGCTTTCAACCTGTATCCGGCCACCGTGCGCCTGGACGATCTGCTCGGAGATGTACAGCCCCAAGCCCAGACCTCCGCTGGCCTGCTGGGCAGCGACCCGCTCGAACTGCTGGAAGATCCGCTGCTGGTTGGCGGCGCTGATACCGATACCGTGATCCTGCACCTGCACCCAGGCCATGCCGCCCTGCTCGAACACCCGCACCTGCACCGGATTGCGCTCGCCGTAACGC > NC_002947/4291523‑4291820 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |